先来一组简单暴力的Medline数据，回答是否有超越？复旦大学已经被Medline数据库收录了51,550篇论文，上海交通大学则被收录了40,916篇论文。Medline是美国国立卫生研究院主持的医学生物领域数据库，故反应了这两个大学在生物医学领域的科研情况。结果显示：在医学生物研究中，复旦大学没有被上海交通大学超越。需要考虑的事实是，上海交通大学和上海第二医科大学合并的晚，所以仅仅看论文总数不公平。那么我们从时间段上做一更深层解析。检索及分析机构：Healsan Consulting LLC, USA结果显示，在生物医学领域，复旦和上交大每年发表的论文均在持续增长；但任何一年，复旦也从来没有被上交大超越过。（复旦和上海交通大学发表的生物医学SCI论文数量对比）图表说明：蓝色 - 复旦大学，红色 - 上海交通大学检索词："Fudan University"[Affiliation] vs "Shanghai Jiao Tong University"[Affiliation]但是，也可以看到，两者之间的差距越来越小，差不多每年降低3%。尤其是2020年，上交大是否真的如群友所言超越复旦，还真是不能排除。在比较复旦和上交大生物医学领域时，也需要考虑到两个大学附属医院数量的情况。根据复旦大学网站信息，目前有附属中山医院，附属华山医院，附属儿科医院，附属妇产科医院，附属耳鼻喉科医院，附属肿瘤医院，附属华东医院，附属上海市公共卫生临床中心，附属上海市第五人民医院，附属金山医院，附属浦东医院，附属静安区中心医院，附属闵行医院，附属精神卫生中心（筹），附属青浦区中心医院（筹），附属口腔医院（筹），附属徐汇医院（筹）等17个医疗机构。而上海交通大学有附属瑞金医院，附属仁济医院，附属新华医院，附属第九人民医院，附属第一人民医院，附属第六人民医院，附属上海儿童医学中心，附属儿童医院，附属胸科医院，附属精神卫生中心，附属国际和平妇幼保健院，附属同仁医院，附属苏州九龙医院等13个医疗机构。附属医疗机构数量的差别，是否是决定两个大学生物医学研究论文数量的因素？有可能。所以，来一个更直接比拼是：两个大学各选前两名的医院直接进行对比。选取中山医院、华山医院、瑞金医院、仁济医院进行对比。结果如下所示，单纯从收录在Medline数据库中论文情况看，由高到低依次是：中山医院＞华山医院＞瑞金医院＞仁济医院。图片说明：其中蓝色 - 中山医院，红色 - 华山医院，橙色 - 瑞金医院，绿色 - 仁济医院。检索词："Zhongshan Hospital"[Affiliation] vs "Huashan Hospital"[Affiliation] vs "Ruijin Hospital"[Affiliation] vs "Renji Hospital"[Affiliation]通过临床科研以改进临床诊疗是对大学及大学医院的要求；而发表的SCI论文是考核其科研能力的关键指标，但质量更为关键。在对于复旦与上交大在SCI论文的基础上，我们做了更深入的检索，期望能够对于双雄之间的具体情况作一客观剖析。第一部分是big analysis（大数据分析），也就是对发表论文的宏观分析，包括发表年度、国家/地区、杂志、主研领域、最常发表的杂志，最有影响力学者等等。
第二部分是citation network，是已经发表论文的被引用情况。我们都知道，论文的价值体现在被阅读和借鉴，并通过被引用次数体现出来。本研究中论文影响力决定于：所发表杂志影响因子、发表的时间、被引用次数。下面我们只对两所医院最新发表的1万篇论文作一分析。
时间分布显示，复旦发表的最新1万篇论文都是2019年和2020年发表的；而上交大最新发表的1万篇论文发表于2018 - 2020年，增长趋势都很好。复旦的国际合作主要分布在美国、德国、澳大利亚和日本；而上交大的国际合作主要分布在美国、澳大利亚、德国和日本。可以看到，复旦和上交大第一关联机构都包括对方。也就是说，两个大学相互是对方国内交流的第一合作伙伴，双方第二合作伙伴都是同济大学医学院。复旦关注的十大领域是：癌症、乳腺癌、肝脏、肺癌、直结肠癌、胃癌、糖尿病、干细胞、胰腺癌、卵巢癌等关键词。而上交大关注的十大领域是癌症、肝脏、肺癌、糖尿病、乳腺癌、干细胞、胃癌、应激、直结肠癌、睡眠等。可以看出，癌症、糖尿病和干细胞研究是两个大学都关注的领域。似乎复旦最多集中在癌症研究，而上交大在精神卫生方面也有很多关注。复旦发表论文最多的五个SCI杂志依次是：Ann Transl Med (IF 3.297), Nat Commun (IF 12.1), ACS Appl Mater Interfaces (IF 8.758), Sci Rep (IF 4), Aging (IF 4.8)等。上交大发表论文最多的五个SCI杂志依次是：Nat Commun (IF 12.1), Sci Rep (IF 4), ACS Appl Mater Interfaces (IF 8.758), Phys Rev Lett (IF 8.4), Angew Chem Int Ed Engl (IF 13)等。被震惊了，尤其是上交大，发表论文最多的5个杂志中，竟然有4个在8分以上。其中Nat Commun (IF 12.1), ACS Appl Mater Interfaces (IF 8.758), Sci Rep (IF 4),三个杂志是复旦与上交大都喜欢投的杂志。我不仅对ACS Appl Mater Interfaces (IF 8.758)这个杂志有了很大的兴趣，实在忍不住了就查了一下，结果发现了一个秘密。手快有哦。（但估计圈子内的人对这个早就门清了。）（ACS Appl Mater Interfaces 发文国家发布）在最新发表的1万篇论文中，中国发表的论文占到了57%，并且，有很多“应用物理新技术，进行生物干预研究”论文。（ACS Appl Mater Interfaces 发文最多的大学分布）
检索词："acs applied materials interfaces"[Journal]可以看到，在该杂志上发表论文最多的机构，几乎都是中国的学术机构。在这里面，复旦大学和上海交通大学发表的论文数并不起眼。
署名复旦最近2年发表论文最有影响力学者依次为：Ge, Junbo; Kan, Haidong; Peng, Huisheng; Wang, Feng; Yu, Jin-Tai; Jiang, Shibo; Chen, Nan; Deng, Yonghui; Che, Renchao; Liu, Cong; Zhang, Yongzhen; Yu, Kin-Hung P等。署名上交大最近2年发表论文最有影响力的学者依次为：Tan, Weihong; Fan, Chunhai; Wang, Feng; Chen Zi-Jiang; Chen, Nan等。与网络图中的学者相对应，按照影响力学者排名。可以看到，总分在150分以上的学者中，复旦有12位，而上交大有9位。
上述大数据分析，我们系统了解了复旦和上交大的研究领域、发表论文的杂志及最有影响力学者及其关系。但是大学直接比拼的不仅仅是数量，更是质量。即高影响力论文，在纳入发表时间的前提下，由论文发表杂志的影响因子和引用次数共同核算而来。可以看到，复旦影响力分值超过35分的有57位学者，而上交大有37位。通过大数据分析，获取了复旦大学与上海交通大学的发表的论文情况、研究热点领域，所在单位最有影响力专家以高影响力论文。1）复旦共发表了51,550篇Medline收录论文，上交大则被收录了40,916篇论文，复旦多于上交大；双方互为第一合作伙伴；在其附属医院方面，中山医院、华山医院发表的论文也多于瑞金医院和仁济医院。2）癌症、肝脏疾病、糖尿病和干细胞是复旦与上交大共同关注的研究领域，但复旦更多集中在癌症领域、而上交大关注的还有精神卫生领域等。3）就每年发表的SCI论文来说，复旦发表的论文一直领先于上交大。但领先优势越来越不显著；更多高影响因子杂志是两所发表论文的共同特点；4）高影响力学者方面，复旦有12位，上交大有9位；高影响力论文中，复旦有57篇，上交大有37篇。透过数据可以看到，一方面，复旦大学和上海交通大学在生物医学领域都高速发展，同时复旦一直领先于上交大，无论是在论文数量还是质量。另一方面，上交大与复旦之间的差距越来越小；在可以预见的未来，上交大发表的论文能否在“量”和“质”两方面都超过复旦，我们拭目以待。报告机构简介：
美国Healsan Consulting(恒祥咨询)公司，特长于医学生物大数据分析和临床科研数据库数据利用。
分析软件及致谢：
感谢“文献鸟”公司VIP项目提供检索和分析。这是特别适合课题组PI、科室的科研秘书、机构科研处等使用。
编辑：Henry，图片来自于网络，版权归原作者所有。
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