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谢晓亮组:Omicron进化出的突变可逃避由BA.1感染诱导的体液免疫;影响疫苗接种策略

王宇歌 博士 Hanson临床科研 2022-05-21
用数据,来辨清事实。



关键词:COVID-19;Omicron;免疫逃逸

如果说,昨天我们推送的研究论文否定了通过“感染一次,由此躺平”的想法;那么,今天推送的研究则让人沉思,尤其是需重新审视疫苗接种策略

Omicron的新亚型,已经可以躲避其早期亚型感染建立起的中和免疫


2022年5月2日北京大学谢晓亮组在bioRxiv上传了一篇评估3种新的Omicron亚型BA.2.12.1,BA.4和BA.5的免疫逃逸文章,数据很翔实,应该会被顶级期刊接收(貌似文章是Cell格式)。


一直在美国从事病毒研究和抗病毒新药/疫苗研发的王宇歌博士对这篇极为重要的文章做了解读。



这项研究的题目是“BA.2.12.1, BA.4 and BA.5 escape antibodies elicited by Omicron infection”,直译过来就是“BA.2.12.1、BA.4 和 BA.5 逃逸 Omicron 感染诱导的抗体”。


单看这个题目,就令人震惊!


要知道,BA.2.12.1, BA.4和BA.5本身就是属于Omicron突变株的亚型啊,竟然还逃逸了Omicron BA.1感染后的免疫应答,可见Omicron发生的抗原漂移正在沿着Bedford的推测快速推动。

Bedford更新新冠病毒分子流行病学分析;关乎疫情走向,这三个突变株最为重要。。。


这项提供的数据十分关键,证明了:

1. R346和L452突变是上述3种亚型发生免疫逃逸的关键突变;

2. BA.4和BA.5的回复突变使两种新亚型的ACE2结合能力减弱;

3. 研究还解析了我反复强调的Omicron BA.1感染者血清缺乏交叉中和活性的原因,因此Omicron BA.1特异性疫苗效果不会理想。


(Omicron亚型的结构特征)


我讲了多次,L452是上述3种新亚型的关键突变。

研究首先通过生化分析发现,BA.2亚谱系,包括 BA.2.12.1和BA.2.13,与BA.1相比表现出增强的ACE2结合亲和力

相反,BA.4和BA.5由于F486V和R493Q两个向原始野生型的回复突变,而显示出最弱的受体结合活性。但是,与BA.2相比,BA.2.12.1,BA.4和BA.5对3剂疫苗接种者(CoronaVac或ZF2001)血清的免疫逃逸增强,尤其是对BA.1康复者血清的逃逸十分显著。

鉴于这一现象,研究进行了一个超大规模的表位鉴定研究,分析了1640种RBD特异性的中和抗体(614种从BA.1康复者中分离)对上述Omicron亚型的中和、表位结合及逃逸机制。

研究发现,
接种灭活病毒疫苗后再发生突破性感染BA.1主要诱导针对原始野生型和BA.1的免疫召回反应,而产生的中和抗体主要针对原始野生型和BA.1。

更为重要的是,这些中和抗体主要是非ACE2结合表位抗体,当病毒出现R346和L452突变时,如R346K(BA.1.1),L452M(BA.2.13),L452Q(BA.2.12.1)和L452R(BA.4/BA.5)等,这时疫苗接种及BA.1感染者血清则不能有效中和这些毒株,因此R346和L452突变是上述3种亚型发生免疫逃逸的关键因素。


(灭活疫苗+智飞/感染后的中和活性)


研究进一步发现,虽然BA.1感染者血清能够有效中和BA.1,但对原始野生型和其他突变株缺乏中和活性,这主要是因为N501,N440,K417和E484突变组合的特异性和敏感性。
而由于新亚型D405N和F486V突变,使BA.1感染产生的中和抗体无法中和BA.2,BA.4及BA.5,这解释了Omicron BA.1感染者血清缺乏交叉中和活性及广谱性的原因。

治疗性单抗
LY-CoV1404(Bebtelovimab)和COV2-2130(Cilgavimab)仍能有效中和BA.2.12.1和BA.4/BA.5;而BA.2,BA.4及BA.5谱系携带的S371F,D405N和R408S突变会逃逸最广泛的sarbecovirus中和抗体。



简析:

谢晓亮组针对新冠疫情中做了很多非常好的病毒研究工作。

这项研究结果表明,
1,Omicron进化出的突变可逃避由BA.1感染诱导的体液免疫
2,Omicron的不断进化对SARS-CoV-2免疫屏障的建立带来了巨大挑战,这项研究表明BA.1衍生的疫苗增强剂可能不是实现广谱保护的理想选择
3,这项研究尤其关注了国人应用最为广泛的灭活病毒疫苗全程接种为基础的加强/感染后免疫应答;面对快速进化的突变株,优化接种策略势在必行。

P.S.
现在做疫苗速度赶不上病毒突变速度。
一个同事说此刻做个横断面湾区1/3都是阳性,这是因为BA.2.12.1高峰开始了,所以5个月内我周围又再感染了一圈。还有些朋友在这5个月里感染了两次。
BA.2.12.1/BA.4/BA.5进化出了Delta的L452,417/452/478/484/501是集RBD大成,似乎已经穷尽了人类的想象力。


本期编辑:Henry,微信号healsan。

Hanson临床科研团队,由6位在美国的医生及医学科学家组成;目前在美国主要从事新药研发和临床科研。

作者:王宇歌 博士,一直在美国从事病毒新药和疫苗研发。微博:子陵在听歌。

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