针对南非Omicron BA.4/5流行病学研究提示：引起新冠病毒突变的宿主库可能持续存在

用数据，来辨清事实。

关键词：COVID-19；Akiko Iwasaki；疫情；疫苗

导言：

2022年6月27日，Nature Med发表了一篇十分重要的BA.4/5在南非早期流行的分子流行学文章，这项研究来自南非Stellenbosch大学，该机构于去年12月最早报道了Omicron的流行病学。

一直在美国从事病毒研究和抗病毒新药/疫苗研发的王宇歌博士对这篇文章做了解读；王博士特别分享了一些病毒进化方向的启示。

这篇文章的题目是“Emergence of SARS-CoV-2 Omicron lineages BA.4 and BA.5 in South Africa”。

最近BA.4/5正在欧洲造成最新的新一波新冠疫情，而这波疫情更早之前刚发生在了南非。

BA.4/5两者Spike（棘突蛋白）完全相同，因此研究中经常把BA.4和5作为一个亚型病毒进行研究。

与BA.2相比，BA.4/5增加了69-70del，L452R，F486V和Q493。69-70del使BA.4/5可以被SGFT PCR方法检测出来。

这项研究发现，在2022年4月，南非的BA.4/5取代了BA.2，占检出病例的50%以上。

应用多项逻辑回归（multinomial logistic regression model），研究发现BA.4/5的单日增长优势比BA.2高8%-10%。

作者因此认为南非涌现出的Beta，Omicron及BA.4/5说明引起病毒持续流行和变异的人类或者动物大型宿主库（reservoir）可能持续存在。

简析：

BA.4/5的增长优势与Omicron对Delta的增长优势一样，主要原因是由于新突变株形成了更强的免疫逃逸。

即新突变株可以突破之前感染/疫苗接种形成的免疫力造成重复感染/突破性感染，而不是Spike结合能力更强；相反，之前谢晓亮组发现BA.4/5因为回复突变实际上与受体结合能力更弱。

因此，Omicron新突变引入后，新的亚型不断取代旧的突变株，这一取代过程主要是因为Omicron引入新突变后形成新的突变株，而新的突变株可以突破旧突变株感染形成的中和抗体。

所以今后一段时间的病毒突变株可能依然会是Omicron的新亚型。

另外，目前没有证据证明BA.4/5引起的疾病更严重，晓亮组也证明BA.4/5与受体结合能力更弱。

小结：

新的突变株之所以成为新的主流毒株，主要是由于其免疫逃逸。

引起病毒持续流行和变异的人类或者动物大型宿主库可能持续存在。

今后一段时间的病毒突变株可能依然会是Omicron的新亚型。

原文链接：

【1】 https://www.nature.com/articles/s41591-022-01911-2

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本期编辑：Henry，微信号healsan。

Hanson临床科研团队，由6位在美国的医生及医学科学家组成；目前在美国主要从事新药研发和临床科研。

作者：王宇歌 博士，一直在美国从事病毒新药和疫苗研发。微博：子陵在听歌。

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