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生信菜鸟团-专题学习目录(7)

冰糖 生信菜鸟团 2022-06-07

R是生信者的工作利器,本专题是有关于R及Bioconductor注释的专题,本专题在于将生信具体问题同R和Bioconductor结合起来,都是基础的知识,但是很值得学习。



R专题
  1. R专题:Rsamtools的简单探索

  2. R专题:使用R读取,处理VCF格式的文件

  3. R专题:使用R读取,处理BED格式的文件

  4. R专题:使用R读取和处理GTF格式的文件

  5. R txdb创建与读取

  6. R专题:把fa/fq读到R里面去~



Bioconductor注释专题
  1. Bioconductor注释专题:OrgDb

  2. Bioconductor注释专题:BSgenome(85)

  3. Bioconductor注释专题:MeSHDb

  4. Bioconductor注释专题:Inparanoid

  5. Bioconductor注释专题:OrganismDb

  6. Bioconductor注释专题:db0

  7. Bioconductor注释专题:用R获取芯片探针与基因的对应关系


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