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那么,WGCNA是什么呢?先看看下面这篇文章:
本文就是利用WGCNA方法,构建与CCA临床性状相关的基因共表达网络,鉴定与肿瘤分化相关的hub基因,然后拿这些基因做研究,就是一篇SCI。
那么,其实通俗易懂的讲,WGCNA就是筛出与临床性状相关的基因集,从而进一步做研究。
那,只要你有一个基因表达量矩阵,如下(样本量大于15个,基因数量小于5000个):
再有一个临床性状信息表,如下:
我们就能通过WGCNA得到与具体某一临床性状相关的基因集,如性别相关基因集,如肿瘤转移相关基因集,如肿瘤大小相关基因集等。做到这一步,再接着做Hub基因筛选+GO+KEGG功能预测,就是一篇小SCI文章。
怎么样,是不是很简单,也好像很高大上的样子?那具体如何操作呢?一套《WGCNA分析实操视频(附全套演示代码)》免费送给大家:
(部分截图)
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