查看原文
其他

收藏 | 2023年时空组学及细胞组学知识大盘点

华大时空 华大时空
2024-11-08


初心如磐,笃行致远。2023年,“华大时空知识库”共推出11期时空及单细胞多组学文献追踪月度速览(涵盖近2700篇文献),33篇代表性文献的深度解读。


在此,我们梳理了2023年全年推送的时空及单细胞多组学技术与应用的解读,整理成合集,期待这份“生命科学知识礼包”,能为您的科研征途提供更多崭新思路(点击下方题目即可查看文章详情)


深度文献解读


植物研究

1. Plant Biotechnol. J. | Stereo-seq助力首次构建非模式植物花生的空间转录组图谱

2. Nature Genetics | Stereo-seq助力首次绘制洋葱鳞茎组织不同发育阶段时空图谱

3. PNAS | Stereo-seq揭示番茄愈伤组织的芽再生空间转录组图谱 

4. Nat Plants | 单细胞核与空间转录组学联合揭示大豆根瘤成熟过程中的动态特征

5. TPJ前沿综述 | 空间转录组学推进植物研究进入新时代


/ 特别关注 /



想要了解更多植物前沿研究?快来锁定2024年1月5日在三亚举办的“与时偕行,蔚然成林——2024时空组学用户峰会·植物研究”。


本次会议将邀请国内时空组学植物研究领域的知名专家学者,围绕时空组学技术在不同植物研究中的创新应用进行深入探讨。会议名额有限,立即报名参与,与我们一起探索植物研究新机遇>>>重磅开启 | 2024时空组学用户峰会·植物研究邀您参与。


脑科学研究

1. Cell重磅 | Stereo-seq助力绘制迄今为止跨时间点最广、面积最大的人脑多区域时空发育转录组图谱 

2. Cell | 成年猕猴全脑皮层单细胞分辨率空间图谱揭示细胞组织模式


生长发育研究

1. Nat Commun | Stereo-seq助力绘制不同发育阶段小鼠心脏的单细胞时空图谱

2. Nat Neurosci | 单细胞转录组揭示人类胚胎脊髓发育 

3. Cell重磅 | Stereo-seq助力杜鹏课题组解析妊娠早期子宫微环境的建立和稳态维持

4. Nat Genet | 人类肺空间细胞图谱揭示腺体相关免疫生态位 


疾病病理研究

1. Sci Adv | Stereo-seq揭示肾上腺髓质素在胎盘发育和早发型子痫前期发病机制中的作用 

2. Nat Commu | 单细胞多组学图谱揭示人类癌症细胞系转录组和表观遗传异质性

3. Fundamental Research | Stereo-seq揭示错配修复系统完善型结直肠腺癌的空间免疫异质性 

4. SCLS | Stereo-seq助力山大生殖团队揭示肥胖引起的卵巢微环境变化的全面动态空间图谱 

5. Nature | 利用空间转录组解析良、恶性组织的拷贝数变异 

6. Cell Res | Stereo-seq揭示人类肝癌浸润区促进肝细胞-肿瘤细胞串扰、局部免疫抑制和肿瘤进展 

7. 一作详解 | Stereo-seq和scRNA-seq联合分析揭示微生物群塑造小鼠脾脏解剖结构和免疫功能

8. Nat Cancer | 新辅助治疗预测HER2阳性乳腺肿瘤反应的空间蛋白质组学特征研究

9. Nat Metab | Stereo-seq助力干细胞治疗糖尿病新突破 

10. 空间转录组学在癌症研究中的应用和机遇 

11. Cancer Cell | 空间分析技术“照亮”肿瘤微环境研究

12. 时空组学:如何让病理诊断更精确、临床治疗更精准?


技术工具类

1. Nat Commun | 高歌课题组提出跨平台、多模态空间组学比对与整合方法

2. Nat Methods | 高分辨率空间转录组学的细胞分割

3. Nat Methods | 空间转录组与单细胞转录组整合分析工具大比拼 

4. Nat Methods | COMMOT:用于推断空间细胞通讯的方法 

5. Nat Methods | SODB推动空间组学数据的全面探索

6. Nat Biotechnol | USeqFISH:用于生物组织中病毒载体趋向性分析的空间转录组学技术 

7. Science | “百花齐放,风起云涌”,空间组学开启生物学领域新篇章

8. JGG最新综述 | 时空组学技术的研究进展、应用及挑战

9. Nat Biotechnol | 空间转录组技术及其发展方向

10. Current Medicine | 空间转录组学在生物医学及临床研究中的应用



时空月速览


时空/细胞组学研究

1. 时空月速览 | 165篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年11月)

2. 时空月速览 | 184篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年10月)

3. 时空月速览 | 170篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年9月)

4. 时空月速览 | 252篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年8月)

5. 时空月速览 | 253篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年7月)

6. 时空月速览 | 282篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年6月)

7. 时空月速览 | 304篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病/技术前沿研究(2023年5月)

8. 时空月速览 | 258篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病前沿研究(2023年4月)

9. 时空月速览 | 272篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病前沿研究(2023年3月)

10. 时空月速览 | 235篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病前沿研究(2023年2月)

11. 时空月速览 | 247篇文章,追踪发育/再生/演化/疾病前沿研究(2023年1月)


2024年,“华大时空知识库”将继续为各位呈现时空组学、细胞组学领域的前沿知识,助力您新岁登“封”造极,再创佳绩。


附:2022年时空及细胞组学知识大盘点(点击查看)


题图 | 彭卫

排版 | 小飞鱼



特别关注



学而时习之,不亦说乎💥。11月份,华大时空组学携手生态合作伙伴:海普洛斯及嘉因生物,为各位科研工作者奉献了2场干货满满的线上讲座,5000多位小伙伴一起相聚云端,共同学习了时空组学、细胞组学在疾病研究中的应用,以及数据处理的联合分析方法。


丰富的内容,专业的讲解为各位研究人员提供了详实的科研干货。错过直播以及想要温故知新的小伙伴,快来一起学习吧。>>>点击查收11月线上讲座合集



推荐阅读


联系我们


对时空组学或细胞组学整体解决方案感兴趣的老师,可选择以下方式和我们联系,我们将及时为您进行详细的介绍:

1. 在公众号留言;

2. 发送信息至邮箱:

services@stomics.tech;




让我知道你“在看”

继续滑动看下一个
华大时空
向上滑动看下一个

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存