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喜讯 | 生命与健康科学学院黄宪达、李宗夷教授获得2020年度“中国生物信息学十大进展”荣誉


为推动生物信息学学科发展和创新研究,充分展示和宣传生物信息学领域的重大研究成果,《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)组织评选了2018年度“中国生物信息学十大进展”和2019年度“中国生物信息学十大进展”。在此基础上,GPB继续组织2020年度评选活动,经过推荐、初选和复选程序,本年度由生命与健康科学学院黄宪达副院长(教学)和李宗夷教授指导开发的miRTarBase获得2020年度“中国生物信息学十大进展”荣誉。相关论文被引用次数达3500次以上(Google Scholar),科研成果在生命科学与生物医药领域有重大影响。另外,我校生物信息学已确定为省级一流本科专业建设点。


本项目由生命与健康科学学院研究员黄熙渊博士与林杨冀冬博士执行,通过博士生李静唐筠,本科生陈奕钢丁思元谢悦洋罗梦凡蔡晓煊许嘉桐金辰南周震宇共同协作完成。此项荣誉充分显示对我校生命与健康科学学院瓦谢尔计算生物研究院推动生物信息专业学习与科研成果的肯定。


科研成果

图:miRTarBase 2020 数据实现与亮点 


MicroRNA(miRNA)是一类不编码蛋白质的遗传信息分子,在细胞分化、生物发育及疾病发生发展中发挥巨大作用。因此,揭示miRNA介导的遗传信息传递方式、靶基因和调控网络尤为重要。香港中文大学(深圳)生命与健康科学学院黄宪达、李宗夷教授团队与深圳市龙岗区妇幼保健院魏凤香团队构建了迄今为止最完整的miRNA与靶基因交互作用(MicroRNA-Target Interaction,MTI)数据库(miRTarBase)。该数据库收录了提供实验证据支持MTI的文章共计超过10,000篇, 涉及来自32个物种的23,426个靶基因。随着CLIP-seq数据集的增加,目前miRTarBase 涵盖的MTI数量将近480,000个。通过自然语言技术搜集更全面的靶向关系及网络功能和注释信息,高度整合有用数据内容,并改善miRNA调控和存在的相关信息,miRTarBase为使用者提供更高效的体验。藉由miRNA调控靶基因信息与表现趋势,解析miRNA在调控特定生物代谢路径与不同癌症或复杂疾病的致病机制全貌。


该成果发表于Nucleic Acids Research

数据库链接:

http://mirtarbase.cuhk.edu.cn/


原文信息:

Hsi-Yuan Huang, Yang-Chi-Dung Lin, Jing Li, Kao-Yao Huang, Sirjana Shrestha, Hsiao-ChinHong, et al. miRTarBase 2020: updates to the experimentally validated microRNA-target interaction database. Nucleic Acids Res 2020; 48(D1): D148–54. 


原文链接:

https://doi.org/10.1093/nar/gkz896



黄宪达

生命与健康科学学院

校长讲座教授

副院长(教学)

生物信息学专业课程负责人


李宗夷

生命与健康科学学院

副教授

生物医学工程专业课程负责人



生物信息学

生物信息学是一项跨领域的学科,涵括生命科学、物理、化学、统计、计算科学与数据科学。近年来生物信息已成为现代生物学的基石,用以探索生物系统的生命过程,从生物大数据中挖掘新颖的生物机制,进而研制出疾病诊断与治疗的方案。领域各项突破性进展正在塑造新的生命科学、农业科学、医学研究、医疗系统和生物科技产业。在国家与企业的大力支持下,国内与在珠江三角洲的生物科技产业正在快速增长,其中药物开发更是知识密集产业。因此,对具有专业生命科学与药物开发知识和生物信息学能力的专业人才的需求迅速地增长。


香港中文大学(深圳)在生物信息领域建立了一支世界一流的师资队伍,在生物信息与重要生物医学领域进行前沿研究。本课程的师资皆是具有国际水平且活跃的学者,他们将提供许多精品课程,并担任学生研究课题的指导老师。生物信息及计算生物的发展加强了我们对健康和疾病的理解。随着人类基因组计划完成,加上低成本的基因检测技术的推动,传统临床的研究亦扩展至数据处理及数据挖掘的领域,结构生物的进展也让计算机药物设计成为药物产业界不可或缺的工具。本专业旨在培养优秀的本科生,使其具有在生命科学与生物信息领域的知识与技能。例如,本科专业为生物、化学或物理的学生,经过本硕士学程的跨领域修习与动手操作,学生将成为生物科技领域不可或缺的顶尖的人才,并可在生物信息与生物医学处于领导地位。


生物医学工程

生物医学工程是一项跨学科研究,涉及将工程学原理和设计概念应用于生物学和医学上达到医疗保健目的,例如疾病诊断、监测和治疗。生物医学工程课程的主要任务是培养在生物学、医学和工程领域具有跨学科专业知识的学生,并通过分子生物学、生物化学、生物力学、信息学、纳米技术、仪器制造和材料工程方面的知识培训他们进行研究工作。通过该课程精心设计的学习计划,学生将获得良好的教育,并可在生物医学和工程学领域处于领导地位。

香港中文大学(深圳)的生物医学工程课程致力于组建一支世界一流的师资队伍,在重要生物医学领域进行前沿研究。凭借香港中文大学(深圳)在材料工程、人工智能、大数据分析和机器人技术方面的现有优势,该课程专注在生物材料和纳米技术、生物医学成像和信号处理、生物传感器和生物仪器、生物医学机器人技术、以及生物医学信息学的发展。在跨学科的学术环境中,学生可与有多学科专业背景的教授及临床医生互动和学习,以获得对人类医疗保健和疾病治疗的前瞻性见解,并转化他们的创新思想或前沿研究促进产业和临床医学的发展,最终让疾病患者受益。该课程为跨学科学习、创造性思维、实用的问题解决能力以及对新兴生物技术及其未来发展的敏锐感知奠定了坚实的基础。


部分图文来源:http://gpb.big.ac.cn/news/1014




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