宋尔卫院士本月新发Nature论文被质疑！国内网友在Pubpeer评论区玩起手绘

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论文信息

2023年12月，中山大学孙逸仙纪念医院在Nature期刊上在线发表题为"Tumour circular RNAs elicit anti-tumour immunity by encoding cryptic peptides"（肿瘤环状RNA通过编码隐性肽激发抗肿瘤免疫力）的论文。

第一作者：中山大学孙逸仙纪念医院乳腺肿瘤中心Di Huang（音译 黄迪）Xiaofeng Zhu（音译 朱晓峰） Shuying Ye（音译 叶淑英）

通讯作者：中山大学孙逸仙纪念医院乳腺肿瘤中心Erwei Song（音译 宋尔卫）Shicheng Su（音译 苏士成）

质疑信息

#1 Gerbilliscus phillipsi于2023年12月发表评论：为什么在原始MS数据中没有发现肽ALFRLTNRA，而肽RTAHYGTGR仅在一个样品（P1）中发现？

#2 Hemieuryale pustulata于2023年12月发表评论：circRNA 疫苗合成部分是可疑的。

• T4 ssRNA连接酶1与短互补无间隙DNA夹板用于RNA环化没有意义。T4 RNA 连接酶 1 催化单链 RNA 或 DNA 连接，RNA-DNA 杂交会阻碍 ssRNA 底物识别。

• 合成的 circFam53b IVT 似乎是从 "AAAA "开始的，这与 T7 RNA 聚合酶倾向于 "GG "转录启动的直觉相反。根据 DNA 拼接序列，连接点应在拼接的中间。
• 根据 1 和 2，很难理解作者是如何体外合成 circFam53b 用于动物实验的。
• 合成的 circRNA 数据完全缺失，没有凝胶分析，没有质量检查，没有 IVT 模板序列，这是不专业的，也是不能接受的。
• 为动物研究制备 1 毫克 EB 染色、PAGE 纯化的 circRNA 令人印象深刻。作者应提供更多纯化细节。

#3 Leptolyngbya appalachiana于2023年12月发表评论：示意图

(版权归哥本哈根头条号、知乎所有）

#4 Leptolyngbya appalachiana于2023年12月发表评论：体内和体外 RNA 环化策略[doi:10.1093/nar/gkv045]，这篇综述详细介绍了用于 RNA 环化的 T4 RNA 连接酶 1

参考信息：

https://www.pubpeer.com/publications/48EACAED766F467FAEC3ECDBCA5177#

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06834-7

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