云课堂（6） | FigTree构建进化树（圆形）教程

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今天小编将与大家一起分享云平台里的FigTree构建进化树（圆形）教程，一起学起来吧~

系统进化树（phylogenetic tree）是表明被认为具有共同祖先的各物种相互间演化关系的树，又被称为系统发育树、种系发生树等。用来表示系统发生研究的结果，用于描述物种之间的进化关系。这里介绍 一款常用于进化树绘制的软件FigTree。

该软件的下载地址：http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/，下载界面如下图：

下载完成后，将该软件解压，然后点击运行 FigTree v1.4.3.exe 即可（注意电脑必须按照 java）：

1.软件界面

2.导入数据，该软件可支持.tre，.tree，.result等格式的文件（File-open），默认输出的进化树图为分支图，可根据需要进行调整。

3.图形调整，将参数按照下图展示的进行设置，绘制圈形进化树图。注意修改    Trees    内部的参数（Root tree 选 中 并 设 置 为 Midpoint ， Order nodes 可 根 据 需 求 选 择 ， Transform branchs 选 中 并 设 置 为 cladogram）。

4.添加分支及节点颜色（选中 Clade，然后选择需要添加的一类分支，点击 Hilight 进行背景颜色添加，如下图所示，如果需要对分支线条添加颜色，选中后直接点击    Colour    进行颜色的添加与修改）。另外， 分支标注的物种颜色可以通过选中 Taxa 及对应的物种后，点击 Colour 进行颜色的修改。

5.图形保存（File-Export Pdf（png，svg，jpeg 等格式））

FigTree构建进化树（圆形）教程就分享完了，除了本教程联川云平台还有很多小技能供学习哦~下载本教程请至云平台：http://cloud.lc-bio.com:5390/faq/sop_detail.php?id=134 或直接点击文末左下角“阅读原文”下载~

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