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【疯狂7月】①—免费在线小工具:fasta序列提取 | 云平台

联川生物 2024-03-27

The following article is from HellsegaMosken Author HellsegaMosken


MID YEAR SUMMARY

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在线小工具:fasta序列提取




工具地址

https://www.omicstudio.cn/tool/77


适用场景

fasta文件格式是二代测序常用的序列存储格式,我们经常需要从中提取出特

定的基因序列,手动搜索提取是一个特别繁琐冗长又容易出错的过程。这里介绍一款好用的小工具,可以批量提取我们关注的ID序列。


输入文件格式

如截图所示,fasta文件以“>”符号指示序列的ID行,两个“>”符号之间的所有行为这个ID对应的序列。完整的文件后缀名为“.fasta”,有时也可用缩写“.fas”或".fa"。


下载示例数据


使用案例

1.上传fasta文件;

2.填写ID列表:如从txt或xlsx文件中复制ID信息并粘贴至页面文本框;

3.查看是否存在无效ID,预览所选序列的信息情况;

4.打包下载;


结果解读

1.fasta文件为筛选所得结果;

2.xlsx文件为序列信息统计;

3.分析记录文件夹收录了一些后续可能会用到的信息,便于引用和回溯,推荐保留。





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