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口腔菌群研究方向四:生活方式、种族对口腔菌群的影响

市场部—LXL 联川生物 2024-03-27


在人类口腔中发现的700种不同的微生物(细菌、古细菌、噬菌体、病毒、寄生虫、真菌和酵母,统称为微生物群)被认为是口腔疾病的基础。这些微生物间作用极其复杂,形成独特的群落分布在牙齿、舌头、硬腭,唾液等不同的口腔生态位中。随着时间的推移,这些不同的口腔微生物群落在个体内也非常稳定,有文献表明有可能从进化时间追踪口腔疾病的起源。


之前的推文中介绍了在口腔疾病全身疾病中可以发现口腔菌群多样性的改变,那么饮食习惯、生活习惯和种族是否也会对口腔菌群造成影响呢?早期的观点认为除了发酵食品之外,饮食不会对口腔微生物造成影响。但是近期一项关于母乳和奶粉喂养差异的文章打破了人们的认知。研究发现母乳喂养和配方奶粉喂养对婴儿口腔微生物群的早期形成有重大影响。



健康成年人食用肉类和糖果与口腔微生物群组成有关,特定膳食营养素也与口腔微生物多样性相关。饮食中饱和脂肪酸和维生素C的水平与口腔微生物多样性的变化有关,喝茶而不喝咖啡的人口腔微生物多样性增加。

非饮食类的输入如吸烟、饮酒、药物等也会对口腔菌群造成影响。例如,吸烟会显著改变口腔微生物群的组成,导致几种常见口腔物种的减少,尤其是在变形菌门中。口腔清洁习惯如刷牙频次,牙线的使用等都会造成口腔菌群的改变。



生活方式、种族对口腔菌群的影响研究思路解析

我们精选2篇口腔菌群的文献,对其中的样本分组、研究方法、研究思路(从单组学到多组学)、入组与排除标准、以及研究发现进行了细致的解析,以帮助您更快地掌握口腔菌群与生活方式、种族相关研究的主流思路。

1.口腔微生物群落与糖摄入量和口味偏好基因相关

 


研究背景:据报道,高碳水的摄入与产酸和耐酸龋齿相关物种的富集有关。糖摄入量与口腔微生物群的非靶向表征之间的关联仍然鲜有研究。

发表期刊:Nutrients

影响因子:5.711

发表时间:2020

样本数量:175名健康青少年

样本类型: 唾液

实验方法:16S rRNA基因测序

实验思路:



筛选标准:6个月内没有接受过抗生素治疗;未患全身性疾病或正在服用药物;能用瑞典语或英语交流;年龄在17-21岁之间

实验结果:175名实验参与者可根据口腔微生物群谱明显分离,且在蔗糖摄入量和味觉偏好相关基因TAS1R1 (rs731024)和GNAT3 (rs2074673)的等位基因变异方面存在差异。TAS1R1基因参与苦味感觉与甜的食物偏好,GNAT3可以参与甜、苦或鲜味的感觉。除了味觉之外,GNAT3编码的蛋白还可以作为肠道中的糖传感器,对糖的吸收和代谢综合征产生影响。因此总之,这项研究表明了糖摄入和口腔微生物生态之间的体内关联,强调了改变宿主因子和微生物的重要性。 

 


口腔菌群相似性分类


2.长期稳定隔离状态下人体多部位微生物组和代谢组的时间序列分析

口腔和肠道,两者都含有丰富的微生物群,两者距离甚远但是相互作用。外部因素如搬家、细菌感染、饮食不规律,熬夜等改变都会导致微生物系统的改变。因此对长期稳定隔离状态下粪便和唾液中微生物组、代谢组的分析可以了解长时间太空旅行过程中是否会因为人体微生物系统的改变而造成一定的风险。

 


发表期刊:Gut

影响因子:23.059

发表时间:2021

样本数量:4名宇航员进入太空舱前、登陆火星前、登陆火星、离开火星返回地球、登陆地球离开太空舱总共18个时间节点

样本类型:唾液样本、粪便样本、血浆样本样本

实验方法:16S rRNA基因测序

实验思路:


实验结果:在这项研究中,通过在不同时间节点检查了人体不同部位的微生物组和代谢组,以评估微生物生态系统的稳定性及其与人体代谢组的联系。在总共18个时间点研究了四名模拟宇航员的唾液和粪便微生物组以及血浆、尿液和粪便代谢组,并与在控制良好的生态生命支持系统中生活 180 天的测试之前、之中和之后进行了比较。在唾液中,进入太空舱往往会促进牙周炎相关微生物的增加。在粪便中,抗炎微生物从进入太空舱到离开太空舱呈增加趋势,而促炎微生物则呈减少趋势。唾液和肠道这两个位点部分变化可能与疾病风险有关,但其微生物群在整个过程中总体上是稳定的。

 


代谢组和口腔微生物组的多样性分析


相关文献列表

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参考文献

1. Esberg A, et al. Oral Microbiota Profile Associates with Sugar Intake and Taste Preference Genes. Nutrients. 2020 Mar 3;12(3):681.

2. Feng Q, et al. Time series analysis of microbiome and metabolome at multiple body sites in steady long-term isolation confinement. Gut. 2021 Jul;70(7):1409-1412.

3. Weyrich LS. The evolutionary history of the human oral microbiota and its implications for modern health. Periodontol 2000. 2021;85(1):90-100.

4. Al-Shehri SS, Sweeney EL, Cowley DM, et al. Deep sequencing of the 16S ribosomal RNA of the neonatal oral microbiome: a comparison of breast-fed and formula-fed infants. Sci Rep. 2016;6:38309. Published 2016 Dec 6.





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