联川生物单细胞测序助力客户持续发表高质量文章!两篇高分文章教你胃癌组织怎么做单细胞测序|单细胞专题
Evolution of immune and stromal cell states and ecotypes during gastric adenocarcinoma progression
胃癌进展过程中免疫和基质细胞状态与生态型的演变
发表单位:美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心、浙江省肿瘤医院
期刊:Cancer Cell
影响因子:50.3
研究者收集并分析了来自胃腺癌癌前病变、原发病灶、转移组织的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,以及未受累的正常组织和外周血样本。深入刻画了在不同GAC阶段肿瘤微环境(TME)中免疫和基质细胞群体的转录状态、细胞组成、分化轨迹、细胞间的相互作用以及细胞生态类型(ecotype)。这项研究提供了对于胃腺癌进展过程中免疫和基质细胞演变的详细图谱,并揭示了潜在的研究靶点,也为未来的研究提供了宝贵的资源。这项研究是迄今为止在胃癌免疫微环境领域中涉及的样本量最大、样本类型最丰富的一项研究工作。
Single-cell analysis of gastric signet ring cell carcinoma reveals cytological and immune microenvironment features
单细胞分析揭示了胃印戒细胞癌的细胞学和免疫微环境特征
发表单位:山东省肿瘤防治研究院(山东省肿瘤医院)
期刊:Nature communications
影响因子:16.6
研究内容
本研究全面解析了GSRC特异的转录信号变化和高免疫抑制肿瘤免疫微环境,揭示了GSRC的潜在生物标志物MSMB,其与GSRC的分化及发育密切相关,可用于指导印戒细胞癌的鉴定。同时,还阐明了GSRC具有较低的细胞粘附和较高的免疫逃避能力,可能与其预后相对较差密切相关。总之,与胃中/低分化腺癌相比较相比,GSRC细胞具有独特的细胞学特征和独特的免疫微环境,可能有利于GSRC的准确诊断和治疗。
山东省肿瘤防治研究院(山东省肿瘤医院) 一作解读
胃印戒细胞癌(GSRC)作为胃腺癌中较为特殊的亚型,具有低粘附性、侵袭性强、转移风险高、对放疗和化疗反应差等特点,且发病率呈逐年上升趋势。我们的研究主要通过对不同亚型的胃腺癌及癌旁组织进行单细胞转录组测序,绘制GSRC细胞图谱展示GSRC异质性的同时进一步揭示了GSRC患者中存在高免疫抑制性肿瘤微环境。
在整个实验过程中,感谢联川生物提供的单细胞转录组测序服务,而联川生物的技术工程师对我们研究课题的了解以及对于数据的专研和挖掘,为我们后续的研究打下坚实基础,联川的技术团队以其专业严谨的工作态度深深打动了我们,给我们留下深刻的印象,希望未来有机会与联川继续展开深度合作。
关于联川
杭州联川生物致力于为全球各地的科研用户提供基因组、转录组、表观组、蛋白组、代谢组,以及单细胞和空间组学测序服务。
单细胞和空间转录组测序作为联川重点科研服务产品,目前已经搭建完成包括10x单细胞测序(ScRNA-seq、ScRNA-seq&VDJ及ScATAC seq),10x空间转录组测序(Visium 、CytAssist),10x Xenium及华大时空组学(stomics)测序平台。联川生物实现从nm到um,从单细胞到亚细胞的全生态单细胞空间原位检测的布局。在样本制备和生物信息学分析,以及云分析平台方面充分发挥自身优势,联川生物致力于为客户提供优质的服务。
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