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Cell Research — 时钟上的卵细胞

松迪科技 2021-03-15

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本文撰稿:Perry


Integrative single-cell analysis of transcriptome, DNA methylome and chromatin accessibility in mouse oocytes


封面设计师:Nicole  学术支持:Enya

项目编号:20190104f-4+


2019年1月,四川大学华西第二医院郭帆研究员在期刊Cell Res.上发表关于哺乳动物卵细胞成熟过程中染色质重塑特征以及DNA甲基化和染色质状态之间的相互关系的研究,此次松迪设计的图像被选为期刊封面。

图1.Cell Res.杂志封面

该封面的主体“大时钟”的金属特质让画面呈现出一种古典美,艺术感倍增,并且突出该研究阐述的是对卵细胞不同时间节点不同发育阶段的研究。加上细胞和RNA的背景,实现了科技感和艺术感的完美结合。接下来让我们了解封面背后的含义。

研究人员利用最新改进的单细胞多组学iscCOOL-seq测序技术结合单细胞转录组测序技术、生物信息学分析、卵泡体外培养体系等,在单细胞和单碱基分辨率上绘制了小鼠卵细胞成熟过程中的转录组图谱、DNA甲基化图谱和染色质状态图谱,并进行了各组学层面上的异质性分析和多种组学之间的关联分析。


在卵细胞生长成熟的过程中,单个卵细胞在开启生长的前后阶段会经历染色质状态的剧烈改变,同时转录组也会相应发生显著变化,而基因组整体DNA甲基化水平在卵细胞开启生长前后仍然低于5%(下图),未有大幅度增加。处于非生长期的Non-growing Oocytes拥有非常独特的染色质状态和转录组特征。


图2.不同时期卵细胞的大小及其对应的染色质状态

(来源:论文配图)


图3.终稿效果图

该图代表大时钟指针指向不同的时间点对应我们研究的五个阶段,时钟的钟点代表卵细胞,从12点到5点直径依次增大,代表卵细胞在长大。


该研究系统地描绘了哺乳动物的卵细胞在发育成熟过程中,DNA甲基化、染色质状态和基因表达发生的精准、有序的变化,以及多种组学层面之间的相互关系。为今后人们继续研究哺乳动物卵细胞重编程能力的获得奠定了基础,同时为体细胞克隆效率的提高以及卵细胞发育异常的研究提供了新思路。



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