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结直肠癌丨FDA批准K药一线用于MSI-H/dMMR结直肠癌患者,MSI检测怎么选?

基因talks e药安全 2023-01-13
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MSI(MicroSatellite Instability,微卫星不稳定性)是由 MMR(MisMatch Repair,错配修复)蛋白功能缺陷所致,所以可通过检测MMR蛋白缺失来反应MSI状态。一般而言,dMMR≈MSI-H, pMMR≈MSI-L或MSS。

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2020年6月29日,FDA批准帕博利珠单抗(Keytruda,K药)单药用于不可切除或转移性MSI-H(微卫星高度不稳定性)或dMMR(错配修复缺陷)结直肠癌(CRC)患者的一线治疗。同时,这也是FDA首个批准一线用于MSI-H/dMMR结直肠癌的PD-1单药。2

▲ FDA批准K药一线用于CRC患者

此次获批,有可能改变 MSI-H CRC 的一线治疗模式。据KN-177的III期研究结果显示,K药单药比标准化疗的PFS增加了一倍以上(16.5月 vs 8.2月);并且与化疗相比,K药将患者的疾病进展或死亡风险降低了 40%。

▲K药 vs 化疗的PFS

值得注意的是,此次FDA依然没有批准MSI-H/dMMR的检测产品,这与过往我们所熟悉的PD-L1及TMB生物标志物有所不同,它们均有FDA批准的伴随诊断产品可以检测。3 MSI虽好,但并没有统一检测标准。

▲FDA目前尚未批准MSI-H/dMMR检测产品
MSI虽好,但没有统一标准

2017年5月,K药首次获批用于后线治疗MSI-H/dMMR泛实体瘤及结直肠癌患者;4 2017年7月,O药获批用于后线治疗MSI-H/dMMR结直肠癌患者;5 2018年7月,O药+Y药获批用于后线治疗MSI-H/dMMR结直肠癌患者;6 2020年6月,K药获批用于一线治疗MSI-H/dMMR结直肠癌患者。1

MSI-H/dMMR作为成熟的免疫治疗生物标志物不断获批,但却没有相应的检测产品获批,MSI有统一的检测及判断的标准吗?

▲ FDA批准用于MSI-H/dMMR的免疫疗法

K药获批

2017年5月23日


2017年5月23日,FDA基于五项单臂研究(KN016/164/012/028/158)批准帕博利珠单抗(Keytruda,K药)用于治疗在先前治疗后进展且没有令人满意替代治疗方案的 MSI-H/dMMR 实体瘤患者以及氟尿嘧啶,奥沙利铂和伊立替康治疗后进展的 MSI-H/dMMR 结肠直肠癌患者。4 这是MSI-H/dMMR首次被正式批准,也是首个泛实体瘤免疫治疗生物标志物。

此次K药获批用于MSI-H的实体瘤患者,并没有批准其伴随诊断产品,目前常见的MSI检测panel有NCI推荐的 Bethesda panel(BAT-25,BAT-26,D2S123,D5S346,D17S250)及promega panel(BAT-25,BAT-26,NR-21,NR-24,MONO-27),其中2个及以上微卫星位点不稳定判断为MSI-H。(当然还有一个Pentaplex panel

根据K药的说明书,我们可以发现,此次五项单臂研究对于MSI的检测方法主要是多重荧光PCR毛细管电泳法(金标准),一种是 local PCR(本地实验室检测),一种是central PCR(中心实验室检测),没有提及具体的检测位点信息。

▲ K药用于泛实体瘤中MSI-H的检测

不过,细心的我们还是可以发现K药在local和central临床试验中使用的是promega panel的5个MSI位点(BAT-25,BAT-26,NR-21,NR-24,MONO-27),其中2个及以上微卫星位点不稳定判断为MSI-H,1个为MSI-L,0个为MSS。

▲ KN016试验中MSI-H的判断

▲ KN158试验中MSI-H的判断
O药/Y药获批

2017/2018年7月


2017年7月31日和2018年7月10日,FDA基于CM142研究分别批准纳武利尤单抗(Nivolumab,O药)单药及联合低剂量CTLA-4抑制剂伊匹木单抗(YERVOY,Y药)用于治疗氟尿嘧啶,奥沙利铂和伊立替康治疗后进展的 MSI-H/dMMR 结肠直肠癌患者。5,6

此次O药获批用于MSI-H的CRC患者,也没有批准其伴随诊断产品。不过,细心的我们还是可以发现:CM142研究中8个国家31个地区虽然首先根据当地的MSI标准来筛选MSI-H患者,最后都是给到中心实验室进行统一的MSI-H检测验证(多重荧光PCR毛细管电泳法),采用的是改良版的Bethesda panel(BAT-25,BAT-26,D2S123,D5S346,D17S250),即 Bethesda panel+ TGFβR type 2,其中2个及以上微卫星位点不稳定判断为MSI-H,1个为MSI-L,0个为MSS。

▲ CM142试验中MSI-H的判断

K药继续获批

2020年6月29日


2020年6月29日,FDA基于KN177研究批准帕博利珠单抗(Keytruda,K药)单药用于不可切除或转移性MSI-H/dMMR结直肠癌患者的一线治疗。1

此次K药获批用于MSI-H的CRC患者,也没有批准其伴随诊断产品。KN177研究对于MSI的检测方法依然是多重荧光PCR毛细管电泳法,依然分为local和central两种PCR方法,所以应该与前面K药获批的研究一样,采用的依旧是 promega panel 的5个MSI位点(BAT-25,BAT-26,NR-21,NR-24,MONO-27),其中2个及以上微卫星位点不稳定判断为MSI-H,1个为MSI-L,0个为MSS。

▲ KN177中MSI-H的两种确认方式

至此,我们发现以上获批的试验中MSI-H的检测虽然都是采用金标准方法:多重荧光PCR毛细管电泳法,但是使用的检测panel却不一样(位点不一样),并没有统一的标准。
再看看我国的推荐标准是啥?
我国CRC的MSI检测推荐?
CSCO CRC指南

2020年5月


CSCO 结直肠癌2020版指南推荐MSI检测:

建议采用美国NCI推荐的5个微卫星位点(BAT25,BAT26,D5S346,D2S123和D17S250),即Bethesda panel。所有5个位点均稳定为MSS(微卫星稳定),1个位点不稳定为MSI-L(微卫星低度不稳定),2个及2个以上位点不稳定为MSI-H(微卫星高度不稳定)。

也可以通过检测MMR蛋白缺失来反映MSI状态,一般而言,dMMR相当于MSI-H, pMMR相当于MSI-L或MSS。

MSI检测怎么选?
虽然FDA在批准MSI-H标志物的同时并没有批准其检测产品,但是我们不难发现,这些获批的试验中MSI-H的检测都是采用当前公认的金标准:多重荧光PCR毛细管电泳法,只是panel不同(Promega版或Bethesda升级版),CSCO指南则推荐用Bethesda panel进行检测,它们的判断标准基本也是卡在40%左右为MSI-H。
随着NGS技术的发展,采用NGS检测MSI位点序列及丰度,进而确定MSI状态,也成为了MSI检测的一种常见技术手段。比如美国FDA已批准或认证的F1CDx及MSK-IMPACT检测分析产品,均包含MSI检测算法,准确性分别为 99.0% 和 95.4%。
当然,所有基于NGS的MSI检测应用于临床前必须进行充分的可靠性认证及临床验证。NCCN指南推荐,MSI检测仅可在临床实验室改进修正案(CLIA)认证的临床实验室进行。由于国内尚无类似的第三方实验室资质认证体系,评估第三方实验室可参考CLIA其他类似资质认证体系推荐所有基于NGS(采用组织或ctDNA样本)的MSI检测平台在应用于临床前,必须进行充分的可靠性认证及临床验证7
基于ctDNA样本的bMSI检测目前正处于验证阶段,有望为肿瘤组织取样困难或不足的晚期肿瘤患者提供新的选择,但是目前尚不成熟。

▲ MSI状态检测方法学比较

由于NGS检测通量高,灵敏度及特异性强,在NGS Panel中加入MSI检测,能够一次性检测多个MSI位点,无疑是MSI检测的一个重要方法,也是临床的迫切需求。

目前,国内肿瘤基因检测市场几乎所有公司都在宣传自己可以做MSI二代测序的检测,样本通常宣传适用于组织和血液,似乎不能做就赶不上潮流一般,哪怕是层层外包,良莠不齐。

同时,不同公司做的MSI位点及数目也是不同的,判断方法也是不同的,比如:

公司A:BAT-25,BAT-26,NR-21,NR-24,MONO-27;

公司B:BAT-25,BAT-26,NR-21,NR-24,NR-27;

公司C:NR-24、BAT-25、CAT-25、BAT-26、MONO-27;

公司D:NR-21,NR-22,NR-24,NR-27,BAT-25,BAT-26,MONO-27,CAT-25;

公司E:63个MSI位点,13个(20%)以上判断为MSI-H,9-12(14%-19%)判断为MSI-L,低于9个(14%)判断为MSS;

公司F:22个MSI位点;

公司G:16个MSI位点;

公司H:17个MSI位点,40%以上判断为MSI-H,20-40%之间判断为MSI-L,20%以下判断为MSS;

.... 琳琅满目,甚至有的公司,不会告诉你检测多少个位点,只告诉你是MSI-H还是MSS,根本没有判断标准。

临床应用上,除了常见8个MSI位点(NR-21,NR-22,NR-24,NR-27,BAT-25,BAT-26,MONO-27,CAT-25),其他的MSI位点多数为科研性质的,并不是MSI位点越多就越好,识别良好区分MSI位点需要好的算法和大量样本的积累验证,同时重复序列的捕获和检测分析等流程也是需要克服一定的困难。

临床MSI的检测,如果有组织样本的话,还是建议用组织做,没有组织的话可以用血液来代替,但一定要选择相对靠谱的大公司,最好有CLIA认证,最最好双C认证(加上CAP认证)(因为国内市场还比较乱,质量难以保证)。


参考资料:

1.https://www.fda.gov/drugs/drug-approvals-and-databases/fda-approves-pembrolizumab-first-line-treatment-msi-hdmmr-colorectal-cancer

2.https://www.businesswire.com/news/home/20200629005810/en/FDA-Approves-Merck%E2%80%99s-KEYTRUDA%C2%AE-pembrolizumab-First-Line-Treatment

3. KEYTRUDA drug lable

4.https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-approves-first-cancer-treatment-any-solid-tumor-specific-genetic-feature

5.https://www.fda.gov/drugs/resources-information-approved-drugs/fda-grants-nivolumab-accelerated-approval-msi-h-or-dmmr-colorectal-cancer

6.https://www.fda.gov/drugs/resources-information-approved-drugs/fda-grants-accelerated-approval-ipilimumab-msi-h-or-dmmr-metastatic-colorectal-cancer

7.结直肠癌及其他相关实体瘤微卫星不稳定性检测中国专家共识.实用肿瘤杂志 2019第34卷 第5期.


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