结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.88(11.06~11.12)
上周发布了哪些“结构”文章？又取得了哪些科研进展？
结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题，梳理一周结构发文大事记，“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。
2023.11.06~2023.11.12
CNS刊登文章
01
Nature
2023/11/07
1.“Ligand recognition and G protein coupling of trace amine receptor TAAR1”
研究人员表示，痕量胺相关受体（TAAR）是一组生物胺受体，在神经和代谢平衡中发挥着关键作用。它们能识别多种内源性痕量胺（ETA），随后激活一系列G蛋白亚型信号通路。值得注意的是，TAAR1已成为治疗精神疾病的有望靶点。然而，TAAR1识别不同配体能力的分子机制在很大程度上仍然难以捉摸。
来自四川大学华西医院生物治疗全国重点实验室邵振华/颜微和山东大学孙金鹏/于晓合作团队解析了九种冷冻电镜（EM）结构，其中八种显示了人类和小鼠TAAR1与一系列配体的复合物，包括内源性3-碘甲状腺原氨酸、两种抗精神病药物、精神活性药物苯丙胺和两种已确定的儿茶酚胺激动剂，还有一种描述了5-HT1AR与一种抗精神病药物的复合物。这些结构揭示了TAAR1中与ETA刺激物结合的刚性共识结合基团，以及两个可容纳不同化学类型的扩展结合口袋。结合突变分析、功能测试和分子动力学模拟，研究人员阐明了药物多药理学的结构基础，并确定了人类和小鼠TAAR1的物种特异性差异。这项研究深入揭示了TAAR1对配体的识别机制和G蛋白的选择性，这可能有助于发现配体或神经和代谢疾病的治疗策略。
原文链接
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06804-z
2023/11/07
2. “Recognition of methamphetamine and other amines by trace amine receptor TAAR1”
痕量胺相关受体1（TAAR1）是由九名成员组成的痕量胺受体家族的创始成员，负责识别大脑中的一系列生物胺，包括内源性β-苯乙胺（β-PEA）和甲基苯丙胺（METH），后者是一种对人类健康和社会构成严重威胁的滥用物质。鉴于TAAR1在大脑中的独特生理作用，它也是包括精神分裂症、抑郁症和药物成瘾在内的一系列神经系统疾病的新靶点。
来自中国科学院上海药物研究所徐华强、上海科技大学iHuman研究所的徐菲、中国科学院分子卓越创新中心汪胜团队及上海市刑事科学技术研究院刘文斌合作团队解析了与METH和β-PEA结合的人类TAAR1-G蛋白复合物的结构，以及与TAAR1选择性激动剂RO5256390和TAAR1与血清素受体5-HT1AR的临床阶段双重激动剂SEP-363856结合的复合物结构。结合系统突变和功能研究，这些结构揭示了METH识别的分子基础以及TAAR1和其他单胺受体之间配体选择性和多药性的潜在机制。研究人员在配体结合口袋中发现了一个类似睑状ECL2的螺旋/环结构和一个氢键网络，这可能有助于TAAR1的配体识别。这些发现揭示了TAAR1的配体识别模式和激活机制，为开发治疗药物成瘾和各种神经系统疾病的新一代疗法提供了指导。
原文链接
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06775-1
02
Cell
2023/11/09
“Reconstruction of a fatty acid synthesis cycle from acyl carrier protein and cofactor structural snapshots”
脂肪酸（FAs）作为细胞膜的组分、细胞能量储备和第二信使前体，在生物细胞的代谢中扮演着中心角色。在酵母中，一个分子质量为2.6兆达尔顿（MDa）的脂肪酸合酶（FAS）负责脂肪酸的生物合成，其中酶反应和结构已知。酵母FAS催化循环中不可或缺的是酰基转运蛋白（ACP），它能够主动地将底物、生物合成中间体和产物从一个活性位点转运到另一个。
来自德国马克斯·普朗克的Ashwin Chari 和Holger Stark课题组合作以1.9埃的分辨率解析了酿酒酵母（S. cerevisiae）FAS的结构，阐明了涉及它们识别的辅因子和水网络。与各种酶结合的ACP结构快照使研究者能够重构完整的酵母脂肪酸生物合成循环途径。结构信息表明，每个FAS功能单元可能容纳外源蛋白，以整合各种酶活性，通过概念验证实验证明了异位蛋白可以用来调节FAS产物谱。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)01125-X
Science
本周无
2023.11.06~2023.11.12
子刊刊登文章
01
Nature Structural & Molecular Biology
11.09
1.“Large-scale, in-cell photocrosslinking at single-residue resolution reveals the molecular basis for glucocorticoid receptor regulation by immunophilins”
11.09
2.“The p97/VCP adaptor UBXD1 drives AAA+ remodeling and ring opening through multi-domain tethered interactions”
11.09
3. “Cryo-EM reveals how Hsp90 and FKBP immunophilins co-regulate the glucocorticoid receptor”
02
Nature Communications
11.06
1. “Elevator-like movements of prestin mediate outer hair cell electromotility”
11.06
2.“Structural basis for ligand recognition and signaling of hydroxy-carboxylic acid receptor 2”
11.06
3.“Enzymatic β-elimination in natural product O- and C-glycoside deglycosylation”
11.06
4.“Dual function of OmpM as outer membrane tether and nutrient uptake channel in diderm Firmicutes”
11.06
5. “Structure of a heteropolymeric type 4 pilus from a monoderm bacterium”
11.07
6.“RNA recognition by Npl3p reveals U2 snRNA-binding compatible with a chaperone role during splicing”
11.07
7.“Structural basis of peptide secretion for Quorum sensing by ComA”
11.07
8.“Structural insights into the modulation of coronavirus spike tilting and infectivity by hinge glycans”
11.08
9.“Inadequate structural constraint on Fab approach rather than paratope elicitation limits HIV-1 MPER vaccine utility”
11.08
10.“Cryo-EM structures of human magnesium channel MRS2 reveal gating and regulatory mechanisms”
11.08
11.“Asymmetric conformations and lipid interactions shape the ATP-coupled cycle of a heterodimeric ABC transporter”
11.08
12.“Mechanism of selective recognition of Lys48-linked polyubiquitin by macrocyclic peptide inhibitors of proteasomal degradation”
11.09
13.“Structures of the DarR transcription regulator reveal unique modes of second messenger and DNA binding”
11.09
14.“trRosettaRNA: automated prediction of RNA 3D structure with transformer network”
11.09
15.“Cryo-electron tomography of NLRP3-activated ASC complexes reveals organelle co-localization”
11.10
16.“Structural basis of bile salt extrusion and small-molecule inhibition in human BSEP”
11.10
17.“A closed translocation channel in the substrate-free AAA+ ClpXP protease diminishes rogue degradation”
11.11
18.“The E3 ligase Riplet promotes RIG-I signaling independent of RIG-I oligomerization”
Cell Research
本周无
Molecular Cell
本周无
Science Advances
本周无
作者 | 谭佳鑫
审稿 | 肖媛
责编 | 囡囡
设计、排版 | 可洲
微信号：FRCBS-THU
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