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生信分析平台搭建(十九):安装Galaxy
编者按
前面我们的应用都使用Ubuntu的终端命令行,如果实在是不喜欢命令行,可以提供一个图形化的数据分析界面,Galaxy就是这样一个生物信息分析的图形化框架,可以进行个性化设置,安装到服务器端对外提供服务。
接前面:
二十四:基本配置
1、安装vim
git clone -b release_17.09 https://github.com/galaxyproject/galaxy.git
2、cd 到galaxy目录,运行安装脚本,这一步比较耗时。
sh run.sh
3、安装成功之后,默认本地运行,浏览器登录127.0.0.1:8080,默认8080端口(Rstudio使用8787端口)。
4、默认本地运行,如果想放到互联网上,需要修改配置文件config/galaxy.ini,如果没有这个文件,拷贝生成
cp galaxy.ini.sample
galaxy.ini
host = 0.0.0.0
5、添加管理员账户,修改配置文件 vi config/galaxy.ini,将管理员账户添加到admin_users关键字中。
# this should be a comma-separated list of valid Galaxy users
admin_users = user1@example.com,user2@example.com
6、安装所需工具
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