查看原文
其他

【有机】JACS:强效广谱抗生素Amycolamicin的全合成

潜陶 CBG资讯 2022-07-28

 
导读:
最近,日本东北大学Shigefumi Kuwahara课题组以路易斯酸促进的分子内D-A反应和立体选择性的N-酰基化反应为关键反应为,实现强效广谱抗生素amycolamicin(1)的全合成。相关研究成果发表在近期的《美国化学会志》上(J. Am. Chem. Soc. DOI: 10.1021/jacs.2c00647)。
 
背景介绍和逆合成分析(Figure 1, Scheme 1):

 


(Figure 1, 来源:J. Am. Chem. Soc.

 

抗生素耐药性已成为人类生命健康的重要威胁,为此需要寻找新的抗生素。2019年,Igarashi团队从土壤放线菌Amycolatopsis sp. MK575-fF5中分离出一种新的广谱抗生素amycolamicin(1,Figure 1),生物活性研究显示该分子对多种耐药菌具有抑制活性,包括:甲氧西林和喹诺酮耐药菌Staphylococcus aureus、耐万古霉素肠球菌、青霉素耐药菌Streptococcus pneumoniae、氨苄西林耐药菌Haemophilus influenzae等。结构方面,该抗生素具有独特的混合结构,包含两个糖片段A和D、一个tetramic acid片段B、一个反式十氢化萘片段C、一个二氯代吡咯酸片段E。全合成方面,北京生命科学研究所李超课题组在2021年报道了amycolamicin(1)的首次全合成,并通过全合成确定amycolamicin和其成盐分子kibdelomycin的绝对构型(J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 21258−21263)。

 


(Scheme 1, 来源:J. Am. Chem. Soc.

 

最近,日本东北大学Shigefumi Kuwahara课题组结合组内前期对DE片段合成的研究工作,也实现了amycolamicin(1)的全合成。其逆合成分析如Scheme 1所示,化合物9endo型过渡态A发生路易斯酸促进的分子内D-A反应,得到反式十氢化萘片段C。片段C和片段DE发生糖苷化反应,得到化合物44再和片段A发生立体选择性的N-酰基化反应,转化成化合物22经Dieckmann缩合和碳酸酯环开环,即可转化成最终产物amycolamicin(1)。

Amycolamicin的全合成(Schemes 2-3):

如Scheme 2所示,为了实现amycolamicin(1)的全合成,作者首先尝试合成糖片段3(A部分)、反式十氢化萘片段6(C部分)和片段7(DE部分)。糖片段3的合成以α-L-岩藻糖为起始原料,经已知的6步反应转化成化合物55再经碳酸酯化-选择性脱甲基-糖苷化以1:1.1的α/β比得到片段3。反式十氢化萘片段6的合成以10为起始原料,经烷基化和HWE反应,得到化合物14E/Z= 19:1)。14经Heck反应-CBS还原-酸脱缩醛三步反应,转化成D-A反应前体9。受Marshall组D-A反应研究工作启发,作者同时尝试了不带保护基的底物9和带MOM保护基的底物9’参与的路易斯酸促进的分子内D-A反应。结果显示底物9参与的羟基导向D-A反应选择性更好,能以72%的产率和96:4的选择性得到理想产物6。相比之下,带MOM保护基的底物9’参与的D-A反应,只以1:2.8的选择性得到理想产物6’。对此,作者认为该羟基导向的D-A反应可能经过过渡态A发生反应,从而高选择性地得到产物6;3)片段7的合成以化合物8为起始原料,经TBS保护-Sharpless不对称双羟基化-DMP氧化-构型反转叠氮化得到化合物2020再经组内前期报道的研究工作,经4步已知反应即可得到DE片段7

 


(Scheme 2, 来源:J. Am. Chem. Soc.

 

最后,作者尝试利用片段367为原料完成amycolamicin(1)的全合成。如Scheme 3所示,片段7和三氯乙腈反应得到化合物环状产物2121和片段6发生糖苷化反应,得到β型主要产物22(α/β = 1:4.3),22的立体构型可通过NOESY谱图和糖片段D上相关氢原子间的大耦合常数确定。22先和烯醇锂中间体发生加成,再经DMP氧化,转化成1.8:1的酮/烯醇混合物4。利用优化后的Ley组乙酰化条件,43的混合物(α/β = 1:1.1)反应得到单一α型产物22的的立体构型可通过糖片段A上相关氢原子间的大耦合常数确定。对于该N-酰化反应出现的高选择性,作者认为可能原因是反应位点上N原子处于位阻小的凸面,更易于发生N-酰化反应。相反反应位点上N原子处于位阻大的凹面,难以发生N-酰化反应。因此会导致3β在反应中先异构化成3α再参与N-酰化反应,从而只得到单一构型产物2。该推断可通过SI中描述的异构化实验加以确定:1:12或1:7的/混合物在核磁管中搅拌反应45分钟,转化成1.8:1或1.7:1的/混合物。2经Dieckmann缩合转化成中间体2424直接和2,4-二甲氧基苄胺发生开环反应,一锅法得到主要产物2525的立体构型也可以通过糖片段A上相关氢原子间的大耦合常数确定。25在DDQ氧化下脱去苄基,接着发生乙酰化和脱TBS保护基反应,最终得到天然产物amycolamicin(1),相关谱图和比旋光度与已报道文献一致。同时,作者发现,若采用氨气直接氨解中间体24的方法,主要得到异构体iso-27

 

(Scheme 3, 来源:J. Am. Chem. Soc.

 

总结:
总之,Kuwahara课题组以路易斯酸促进的分子内D-A反应和立体选择性的N-酰基化反应为关键反应,实现强效广谱抗生素amycolamicin(1)的高效合成。作者后期将研究该抗生素类似物的结构-活性关系。
 
论文信息:
Total Synthesis of the Broad-Spectrum Antibiotic Amycolamicin
Yasuhiro Meguro, Junya Ito, Kiyotaka Nakagawa, and Shigefumi Kuwahara*
J. Am. Chem. Soc. DOI: 10.1021/jacs.2c00647


原文(扫描或长按二维码,识别后直达原文页面):



CBG资讯一直致力于追踪新鲜科研资讯、解读前沿科研成果。如果你也对科研干货、高校招聘、不定期福利(现金红包、翻译奖励、实验室耗材优惠券等)有兴趣,那么,请长按并识别下图二维码,添加C菌微信(微信号:chembeango101),备注:进群



Nature Chemistry:钯催化可逆的C-C键形成过程
JACS:光驱动氨基甲酰叠氮化合物活化合成环N-三氟甲基脲
ACS Catalysis:利用镍/光双催化实现氧杂/氮杂双环衍生物的开环烯丙基化反应德国哥廷根大学Lutz Ackermann课题组:首例电催化螺环化反应Nicolaou组JACS:Gukulenin B的首次全合成

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存