【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(下) pandas高级应用
作者:SeanCheney Python爱好者社区专栏作者
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12.2 GroupBy高级应用
尽管我们在第10章已经深度学习了Series和DataFrame的Groupby方法,还有一些方法也是很有用的。
分组转换和“解封”GroupBy
在第10章,我们在分组操作中学习了apply方法,进行转换。还有另一个transform方法,它与apply很像,但是对使用的函数有一定限制:
它可以产生向分组形状广播标量值
它可以产生一个和输入组形状相同的对象
它不能修改输入
来看一个简单的例子:
In [75]: df = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'c'] * 4, ....: 'value': np.arange(12.)}) In [76]: df Out[76]: key value 0 a 0.0 1 b 1.0 2 c 2.0 3 a 3.0 4 b 4.0 5 c 5.0 6 a 6.0 7 b 7.0 8 c 8.0 9 a 9.0 10 b 10.0 11 c 11.0
按键进行分组:
In [77]: g = df.groupby('key').value In [78]: g.mean() Out[78]: key a 4.5 b 5.5 c 6.5 Name: value, dtype: float64
假设我们想产生一个和df['value']形状相同的Series,但值替换为按键分组的平均值。我们可以传递函数lambda x: x.mean()进行转换:
In [79]: g.transform(lambda x: x.mean()) Out[79]: 0 4.5 1 5.5 2 6.5 3 4.5 4 5.5 5 6.5 6 4.5 7 5.5 8 6.5 9 4.5 10 5.5 11 6.5 Name: value, dtype: float64
对于内置的聚合函数,我们可以传递一个字符串假名作为GroupBy的agg方法:
In [80]: g.transform('mean') Out[80]: 0 4.5 1 5.5 2 6.5 3 4.5 4 5.5 5 6.5 6 4.5 7 5.5 8 6.5 9 4.5 10 5.5 11 6.5 Name: value, dtype: float64
与apply类似,transform的函数会返回Series,但是结果必须与输入大小相同。举个例子,我们可以用lambda函数将每个分组乘以2:
In [81]: g.transform(lambda x: x * 2) Out[81]: 0 0.0 1 2.0 2 4.0 3 6.0 4 8.0 5 10.0 6 12.0 7 14.0 8 16.0 9 18.0 10 20.0 11 22.0 Name: value, dtype: float64
再举一个复杂的例子,我们可以计算每个分组的降序排名:
In [82]: g.transform(lambda x: x.rank(ascending=False)) Out[82]: 0 4.0 1 4.0 2 4.0 3 3.0 4 3.0 5 3.0 6 2.0 7 2.0 8 2.0 9 1.0 10 1.0 11 1.0 Name: value, dtype: float64
看一个由简单聚合构造的的分组转换函数:
def normalize(x): return (x - x.mean()) / x.std()
我们用transform或apply可以获得等价的结果:
In [84]: g.transform(normalize) Out[84]: 0 -1.161895 1 -1.161895 2 -1.161895 3 -0.387298 4 -0.387298 5 -0.387298 6 0.387298 7 0.387298 8 0.387298 9 1.161895 10 1.161895 11 1.161895 Name: value, dtype: float64 In [85]: g.apply(normalize) Out[85]: 0 -1.161895 1 -1.161895 2 -1.161895 3 -0.387298 4 -0.387298 5 -0.387298 6 0.387298 7 0.387298 8 0.387298 9 1.161895 10 1.161895 11 1.161895 Name: value, dtype: float64
内置的聚合函数,比如mean或sum,通常比apply函数快,也比transform快。这允许我们进行一个所谓的解封(unwrapped)分组操作:
In [86]: g.transform('mean') Out[86]: 0 4.5 1 5.5 2 6.5 3 4.5 4 5.5 5 6.5 6 4.5 7 5.5 8 6.5 9 4.5 10 5.5 11 6.5 Name: value, dtype: float64 In [87]: normalized = (df['value'] - g.transform('mean')) / g.transform('std') In [88]: normalized Out[88]: 0 -1.161895 1 -1.161895 2 -1.161895 3 -0.387298 4 -0.387298 5 -0.387298 6 0.387298 7 0.387298 8 0.387298 9 1.161895 10 1.161895 11 1.161895 Name: value, dtype: float64
解封分组操作可能包括多个分组聚合,但是矢量化操作还是会带来收益。
分组的时间重采样
对于时间序列数据,resample方法从语义上是一个基于内在时间的分组操作。下面是一个示例表:
In [89]: N = 15 In [90]: times = pd.date_range('2017-05-20 00:00', freq='1min', periods=N) In [91]: df = pd.DataFrame({'time': times, ....: 'value': np.arange(N)}) In [92]: df Out[92]: time value 0 2017-05-20 00:00:00 0 1 2017-05-20 00:01:00 1 2 2017-05-20 00:02:00 2 3 2017-05-20 00:03:00 3 4 2017-05-20 00:04:00 4 5 2017-05-20 00:05:00 5 6 2017-05-20 00:06:00 6 7 2017-05-20 00:07:00 7 8 2017-05-20 00:08:00 8 9 2017-05-20 00:09:00 9 10 2017-05-20 00:10:00 10 11 2017-05-20 00:11:00 11 12 2017-05-20 00:12:00 12 13 2017-05-20 00:13:00 13 14 2017-05-20 00:14:00 14
这里,我们可以用time作为索引,然后重采样:
In [93]: df.set_index('time').resample('5min').count() Out[93]: value time 2017-05-20 00:00:00 5 2017-05-20 00:05:00 5 2017-05-20 00:10:00 5
假设DataFrame包含多个时间序列,用一个额外的分组键的列进行标记:
In [94]: df2 = pd.DataFrame({'time': times.repeat(3), ....: 'key': np.tile(['a', 'b', 'c'], N), ....: 'value': np.arange(N * 3.)}) In [95]: df2[:7] Out[95]: key time value 0 a 2017-05-20 00:00:00 0.0 1 b 2017-05-20 00:00:00 1.0 2 c 2017-05-20 00:00:00 2.0 3 a 2017-05-20 00:01:00 3.0 4 b 2017-05-20 00:01:00 4.0 5 c 2017-05-20 00:01:00 5.0 6 a 2017-05-20 00:02:00 6.0
要对每个key值进行相同的重采样,我们引入pandas.TimeGrouper对象:
In [96]: time_key = pd.TimeGrouper('5min')
我们然后设定时间索引,用key和time_key分组,然后聚合:
In [97]: resampled = (df2.set_index('time') ....: .groupby(['key', time_key]) ....: .sum()) In [98]: resampled Out[98]: value key time a 2017-05-20 00:00:00 30.0 2017-05-20 00:05:00 105.0 2017-05-20 00:10:00 180.0 b 2017-05-20 00:00:00 35.0 2017-05-20 00:05:00 110.0 2017-05-20 00:10:00 185.0 c 2017-05-20 00:00:00 40.0 2017-05-20 00:05:00 115.0 2017-05-20 00:10:00 190.0 In [99]: resampled.reset_index() Out[99]: key time value 0 a 2017-05-20 00:00:00 30.0 1 a 2017-05-20 00:05:00 105.0 2 a 2017-05-20 00:10:00 180.0 3 b 2017-05-20 00:00:00 35.0 4 b 2017-05-20 00:05:00 110.0 5 b 2017-05-20 00:10:00 185.0 6 c 2017-05-20 00:00:00 40.0 7 c 2017-05-20 00:05:00 115.0 8 c 2017-05-20 00:10:00 190.0
使用TimeGrouper的限制是时间必须是Series或DataFrame的索引。
12.3 链式编程技术
当对数据集进行一系列变换时,你可能发现创建的多个临时变量其实并没有在分析中用到。看下面的例子:
df = load_data() df2 = df[df['col2'] < 0] df2['col1_demeaned'] = df2['col1'] - df2['col1'].mean() result = df2.groupby('key').col1_demeaned.std()
虽然这里没有使用真实的数据,这个例子却指出了一些新方法。首先,DataFrame.assign方法是一个df[k] = v形式的函数式的列分配方法。它不是就地修改对象,而是返回新的修改过的DataFrame。因此,下面的语句是等价的:
# Usual non-functional way df2 = df.copy() df2['k'] = v # Functional assign way df2 = df.assign(k=v)
就地分配可能会比assign快,但是assign可以方便地进行链式编程:
result = (df2.assign(col1_demeaned=df2.col1 - df2.col2.mean()) .groupby('key') .col1_demeaned.std())
我使用外括号,这样便于添加换行符。
使用链式编程时要注意,你可能会需要涉及临时对象。在前面的例子中,我们不能使用load_data的结果,直到它被赋值给临时变量df。为了这么做,assign和许多其它pandas函数可以接收类似函数的参数,即可调用对象(callable)。为了展示可调用对象,看一个前面例子的片段:
df = load_data() df2 = df[df['col2'] < 0]
它可以重写为:
df = (load_data() [lambda x: x['col2'] < 0])
这里,load_data的结果没有赋值给某个变量,因此传递到[ ]的函数在这一步被绑定到了对象。
我们可以把整个过程写为一个单链表达式:
result = (load_data() [lambda x: x.col2 < 0] .assign(col1_demeaned=lambda x: x.col1 - x.col1.mean()) .groupby('key') .col1_demeaned.std())
是否将代码写成这种形式只是习惯而已,将它分开成若干步可以提高可读性。
管道方法
你可以用Python内置的pandas函数和方法,用带有可调用对象的链式编程做许多工作。但是,有时你需要使用自己的函数,或是第三方库的函数。这时就要用到管道方法。
看下面的函数调用:
a = f(df, arg1=v1) b = g(a, v2, arg3=v3) c = h(b, arg4=v4)
当使用接收、返回Series或DataFrame对象的函数式,你可以调用pipe将其重写:
result = (df.pipe(f, arg1=v1) .pipe(g, v2, arg3=v3) .pipe(h, arg4=v4))
f(df)和df.pipe(f)是等价的,但是pipe使得链式声明更容易。
pipe的另一个有用的地方是提炼操作为可复用的函数。看一个从列减去分组方法的例子:
g = df.groupby(['key1', 'key2']) df['col1'] = df['col1'] - g.transform('mean')
假设你想转换多列,并修改分组的键。另外,你想用链式编程做这个转换。下面就是一个方法:
def group_demean(df, by, cols): result = df.copy() g = df.groupby(by) for c in cols: result[c] = df[c] - g[c].transform('mean') return result
然后可以写为:
result = (df[df.col1 < 0] .pipe(group_demean, ['key1', 'key2'], ['col1']))
12.4 总结
和其它许多开源项目一样,pandas仍然在不断的变化和进步中。和本书中其它地方一样,这里的重点是放在接下来几年不会发生什么改变且稳定的功能。
为了深入学习pandas的知识,我建议你学习官方文档,并阅读开发团队发布的更新文档。我们还邀请你加入pandas的开发工作:修改bug、创建新功能、完善文档。
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