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16亿美元!Astellas宣布与Dyno Therapeutics合作用AI开发下一代AAV基因治疗载体

张爱龙 细胞与基因治疗领域 2022-06-21

Astellas Pharma 和 Dyno Therapeutics(Dyno)今天宣布双发达成了一项关于AAV衣壳开发的合作,利用Dyno Therapeutics的 CapsidMap™ 人工智能(AI)平台开发下一代AAV基因疗法,用于骨骼肌和心肌相关疾病治疗。根据协议条款,Dyno Therapeutics将设计用于基因治疗的AAV衣壳,而Astellas将负责为基因治疗候选药物进行临床前、临床和商业化推动进程。Dyno 将收到1800万美元的预付款,并且未来Dyno有资格获得总计超过16亿美元的里程碑付款。

Dyno Therapeutics的创始人兼首席执行官Eric Kelsic表示,基因药物的体内递送是基因疗法的主要挑战,该公司将在基因药物体内递送研发上投入巨大的精力与众多尖端技术,使基因疗法更加安全有效,使基因药物的工业化制备成本更低,使基因疗法惠及更多患者。

Dyno Therapeutics现拥有约50名员工,总部位于马萨诸塞州,公司计划在明年将员工人数增加三倍。

Dyno Therapeutics由一群哈佛大学科学家和企业家于2018年成立,其中包括George Church博士和Eric Kelsic博士。

2019年底时,Dyno Therapeutics在Science杂志中展示了其新技术——通过一种机器学习方法对AAV载体衣壳进行改造,使其具有更好组织趋向性和人工可造性,该技术吸引了人们的关注。

2020年5月11日,Dyno Therapeutics宣布其CapsidMap™平台从隐形模式走出,并在同一天官宣与诺华和Sarepta Therapeutics分别达成用于眼科疾病和肌肉疾病的载体的开发协议。截止其与罗氏的合作,其累计达成的合作交易价值超过38亿美元。

2021年2月11日,Dyno Therapeutics与由George Church带领的哈佛大学Wyss生物启发工程研究所(Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering)的合成生物学团队合作发起,并与谷歌研究院合作的一项新研究应用了计算机深度学习方法设计基于AAV2血清型的高度多样衣壳变异体,被突变的目标片段在免疫识别以及靶向目标组织感染中发挥作用。相关研究成果发表在《Nat Biotechnol》杂志上(Nat Biotechnol. 2021 Feb 11. doi: 10.1038/s41587-020-00793-4. Online ahead of print.)。研究人员已成功使用AI技术设计出了用于基因治疗的腺相关病毒(AAV)多种衣壳变异体,这些衣壳变异体能够更好地逃避免疫系统的监视。(详见往期文章:人工智能可以使基因治疗设计更有效

2021年5月初,Dyno Therapeutics从投资者那里筹集了1亿美元,筹集的这笔资金将加速其基因治疗载体的开发,这些载体可靶向肝,肌肉,眼睛和中枢神经系统。

Dyno Therapeutics的CapsidMap™平台

CapsidMap™平台使用人工智能技术系统地,快速地优化AAV衣壳,通过改善其靶向能力,包装容量,免疫逃逸性和产率,克服天然衣壳的局限性。通过构建合成的AAV衣壳序列详尽的空间结构图谱,可以快速浏览其三维立体结构,以寻找具有临床应用潜力的增强型基因治疗载体。
1、突变衣壳DNA文库的构建
2、高通量测序鉴定衣壳序列特性
3、预测衣壳特性的机器学习模型的构建
4、机器学习模型的优化及其应用
重复上述步骤,数据不断迭代,训练出更好的机器学习模型,进一步提高具有所需特性的载体的适用性或有效性,这些增强的特性包括体内递送效率、靶向特异性,免疫逃逸特性,包装容量和可生产性。

参考资料:

https://www.astellas.com/en/news/17476

https://www.msn.com/en-us/money

Bryant DH et al. Deep diversification of an AAV capsid protein by machine learning. Nat Biotechnol. 2021 Feb 11. 

https://phys.org/news/2021-02.

https://www.dynotx.com.

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