编辑精选 | EBioMedicine2021年度精选论文合集

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EBioMedicine是柳叶刀旗下的金色开放获取期刊，致力于发表与疾病发生发展以及治疗相关的原创性研究，以期帮助人们理解和健康相关的各个生物医学领域。柳叶刀特别推出EBioMedicine年度精选论文合辑，分享给读者。

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论文精选

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短链脂肪酸及其产生菌：一种被忽视的IBD治疗方法？

肠道微生物群和肠道免疫系统是炎症性肠病（IBD）的主要诱因。两者都有一个重要的共同信号因子:短链脂肪酸（SCFAs）。SCFAs（乙酸、丙酸和丁酸）是由肠道细菌发酵产生的，。比利时胃肠疾病转化研究中心、鲁汶大学Séverine Vermeire教授等综述了短链脂肪酸对宿主的代谢和免疫系统的作用，特别是在IBD的能量代谢、肠道屏障、免疫系统和疾病活动方面的影响。此外，作者展望了未来对肠道微生物群的交叉喂养机制以及基于短链脂肪酸对不同疾病模型的治疗。

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胰腺癌中N6-甲基腺苷调节因子预测肿瘤侵袭性和免疫逃避的综合模型

胰腺癌是癌症相关死亡的主要原因。在美国，其5年总生存率只有9%。m⁶A是最丰富的mRNA修饰，m⁶A调节因子在癌症进展和免疫逃避中发挥关键作用。美国俄克拉何马大学健康科学中心李敏教授团队开展的转录组研究确定了一个由9个m⁶A调控因子组成的预测特征（m⁶Ascore）。作者发现，m⁶score升高与胰腺癌预后不良相关。高侵袭性胰腺癌亚型（基础亚型、鳞状亚型、QM-PDA）比低侵袭性胰腺癌亚型具有更高的m⁶score。m⁶score高的肿瘤具有独特的突变谱和免疫浸润降低。本研究提示m⁶Ascore可以作为一种潜在的工具，用于预测患者对免疫疗法的反应，以提高治疗成功率。

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LILAC初步研究:在抗逆转录病毒治疗期间，二甲双胍对mTOR激活和艾滋病病毒库存在时间的影响

接受抗逆转录病毒治疗（ART）的艾滋病毒感染者（PLWH）持续存在慢性炎症和艾滋病毒转录残留，从而增加了非艾滋病合并症的风险。雷帕霉素（mTOR）的治疗靶点是细胞代谢和HIV转录的关键调控因子，因此成为一个新的艾滋病治疗靶点。LILAC研究于2016年10月至2018年8月在加拿大进行。来自加拿大蒙特利尔大学，渥太华大学，和麦吉尔大学的学者报告了他们的前期试验结果。

在前期试验中，作者评估了 口服二甲双胍12周（500 - 850毫克每日两次）对CD4+/CD8+ T细胞比值小于0.8的非糖尿病HIV患者接受ART治疗期间免疫学、病毒学指标的动态变化。结果显示：CD4+ T细胞计数，CD4+/CD8+ T细胞比值，血浆炎症/肠道损伤标志物，以及细胞相关的HIV- DNA和HIV- RNA整合水平，以及转录诱导的HIV病毒库，在二甲双胍的作用下发生了微小的变化。基线水平乙状结肠活检mTOR激活/磷酸化水平最高。二甲双胍显著降低了结肠中CD4+ T细胞浸润以及mTOR激活/磷酸化，特别是在表达Th17标志物CCR6的CD4+ T细胞中。此外，二甲双胍降低了8/13名参与者结肠浸润CD4+ T细胞中的HIV-RNA/HIV-DNA比值（病毒转录的替代标记）。这些结果与二甲双胍优先作用于肠道和mTOR激活/磷酸化选择性发生在结肠浸润的CCR6+CD4+ T细胞的结果一致，提示未来的随机临床试验应评估长期服用二甲双胍对于HIV抗逆转录病毒治疗的作用。

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甲磺酸卡莫司他（Camostat mesylate）通过TMPRSS2相关蛋白酶抑制新冠病毒（SARS-CoV-2）激活，其代谢物GBPA可发挥抗病毒活性

目前，迫切需要抗病毒药物来对抗新冠病毒大流行。TMPRSS2对病毒刺突蛋白（Spike protein）的切割对于病毒进入肺细胞是必不可少的，而TMPRSS2表达对于小鼠的正常发育和体内平衡来说是不必要的。经临床验证的TMPRSS2抑制剂甲磺酸卡莫司他可阻断新冠病毒对原代人肺细胞的感染，并被发现可抑制病毒在小鼠中的传播和致病。然而，目前尚不清楚SARS-CoV-2是否可以使用TMPRSS2相关蛋白酶进入宿主细胞，以及使用这些酶是否会造成甲磺酸卡莫司他抗性。本研究表明新冠病毒可以利用TMPRSS2相关蛋白酶进入细胞，并且这些酶可能支持病毒在上呼吸道的传播。然而，新冠病毒利用TMPRSS2相关蛋白酶并未造成甲磺酸卡莫司他抗性。此外，本研究结果还表明，甲磺酸卡莫司他代谢物GBPA也可阻断TMPRSS2的活性，尽管其抑制效率与母体化合物相比有所降低。所有证据表明，甲磺酸卡莫司他将通过阻断TMPRSS2和其相关酶来抑制新冠病毒的激活。

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危重新冠病者患者呼气的代谢组学：一项初步研究

新冠病毒疾病（Covid-19）的早期诊断至关重要，但仍然具有挑战性。大约5%的新冠病毒 患者会出现急性呼吸窘迫综合征（ARDS）、感染性休克和/或多器官衰竭。理想情况下，应尽快识别出这些危重患者。呼吸分析是一种创新的、非侵入性的、实时的即时护理技术，用于检测呼气中的挥发性有机化合物。它具有用于诊断和大规模筛查的潜力。在本项研究中，作者表明呼吸分析可以区分新冠患者是否会出现急性呼吸窘迫综合征。他们描绘了一个基于呼气挥发性有机化合物的具有高度灵敏性和特异性的可用于识别需要有创机械通气的出现ARDS的新冠患者的呼吸印记（breathprint）。患者呼气中四种最突出的挥发性化合物是甲基戊-2-烯醛（methylpent-2-enal）、2,4-辛二烯（2,4-octadiene）、1-氯庚烷（1-chloroheptane）和壬醛（nonanal）。此呼吸印记不取决于ARDS的严重程度或患者的病毒载量。所有证据表明，实时、无创的呼吸分析可以实现大规模筛查，从而对可能发展为危重形式的新冠患者进行早期治疗。

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新冠疾病严重程度与呼吸衰竭的全表观基因组关联研究

新冠病毒疾病的临床表现涵盖从无症状到不需要住院的轻度症状再到因肺炎导致的呼吸衰竭。新冠疾病临床病程恶化的危险因素包括较大的年龄、男性和合并症，如糖尿病、肥胖和高血压。遗传易感性位点，例如A型血和I型干扰素免疫的先天缺陷最近也被认为是危险因素。本项研究结果表明，DNA甲基化位点的差异可将无症状新冠患者与需要住院给氧治疗（包括机械通气和其他器官支持措施）的新冠患者区分开来。鉴定的表观遗传位点大多位于与干扰素反应途径相关的基因内。使用这些DNA甲基化生物标志物，作者获得了一个表观基因组特征（EPICOVID）。它在预测新冠疾病严重性方面表现出很高的准确性。这些位点的DNA甲基化状态可以很容易地添加到其他分子、细胞和临床参数中，以便更准确地预测可能遭遇最坏临床结果的新冠患者。对这些患者的早期干预可以提高治愈率并减轻医疗系统的负担。END

*中文翻译仅供参考，一切内容以英文原文为准。

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