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科研 | Front. Cell Dev. Biol.:研究者揭示严重脂肪变性在肝移植失败中的分子致病机理(国人佳作)
编译:微科盟晨晓曦,编辑:微科盟Tracy、江舜尧。
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论文ID
原名:Metabonomic Profile of Macrosteatotic Allografts for Orthotopic Liver Transplantation in Patients With Initial Poor Function: Mechanistic Investigation and Prognostic Prediction译名:初发功能差的原位肝移植患者严重脂肪变性同种异体移植物的代谢组学特征:机制研究和预后预测
期刊:Frontiers in cell and developmental biology
IF:5.204发表时间:2020.08通讯作者:刘征涛、郑树森、耿磊通讯作者单位:浙江大学医学院
实验设计
实验结果
相对于肝脏利用率的稳定趋势,MaS的捐献同种异体移植从2015年的15%显著增加到2019年的25%以上。82名移植后IPF患者被纳入最终分析,如表1所示,接受代谢组学分析的移植物中MaS患病率约为42.6%。在大多数方面,同种异体脂肪变性分类的患者差异不显著(P>0.05)。仅在MaS中观察到抗HCV阳性,而在非MaS移植物中未观察到。使用MaS移植进行LT的患者WIT较短(P <0.05)。且同种异体脂肪变性分类的患者差异不明显(P> 0.05)。在医疗中心分类组中,我们观察到患者状态(年龄,性别,血型等)和疾病严重程度(Child-Pugh / MELD评分)的分布差异不显著(P> 0.05)。表1 按同种异体移植MaS状态分类的移植病例临床信息总结
2.移植失败的临床预测因素
在多变量cox比例风险模型中,受者的临床因素(术前Child-Pugh / MELD评分、身高、术后AST水平)、供体(术前ALT)、移植物(血脂过多)和手术(失血/输血)方面的临床因素通常会影响多位移植物的存活(图1)。
AST,天冬氨酸转氨酶;D,供体;EAD,早期同种异体移植功能障碍;FIB,纤维蛋白原;HR,危险比;R,受体;RBC,红细胞;S,脂肪变性
3.供体肝脏的代谢组学特征
原始数据通过QC样本根据预定义的标准被调整,通过Progenesis QI(v2.3)进行数据预处理后,每个样品总共被检测到3444种代谢物。最后,人类代谢组数据库中具有识别功能的2155个特征被纳入进一步分析。
4.捐助者肝脏的多元分析(MVA)
OPLS-DA模型中的多变量分析显示,MaS和非MaS移植物之间的代谢组学特征明确分离(Q [2] = 0.58,R [2] = 0.52,图2A)。同时,排列检验模型进一步验证了患者分类的特异性和可靠性(R [2] = 0.41,Q [2] = 0.441,图2B)。
(A) PCA分析显示接受MaS(蓝点)和非MaS(绿点)同种异体移植的患者通过OPLS-DA模型进行了明确的分离;(B)通过面板(A)的类别排列分析验证了OPLS-DA模型。
5.与供体MaS和移植失败相关的潜在代谢物的网络分析
通过单变量ANOVA分析,我们观察到MaS和非MaS同种异体移植物中389种代谢物差异显著(图3和表2)。进一步的功能途径分析表明,MaS引起的分化代谢产物主要参与了亚油酸和甘油磷脂的代谢(P<0.05,图3)。在MaS供体中,亚油酸水平显著升高,但磷脂酰胆碱和磷脂酰乙醇胺水平降低(P<0.05)。我们采用单变量Cox分析发现 104种代谢特征显着影响移植物的存活,其中包括91种有害代谢物和13种保护性代谢物(图3)。候选代谢产物的富集表明类固醇生物合成途径对移植后预后的重要性(P<0.05,图3),大多数涉及的特征可以归类为类固醇类,并对移植后的预后产生有害影响。经KEGG-IDs分类,包括磷脂酰胆碱(C00157)、磷脂酰乙醇胺(C00350)、糖精平(C00449)和葡萄糖醛酸苷(C03033)在内的化合物是重叠的代谢组簇,与移植后预后和供者MaS有关。C03033增加了发生MaS和GF的风险,而C00157和C00350对以上两个事件发挥了保护作用(图3)。网络分析表明,重叠的代谢物在甘油磷脂代谢途径上显著富集(P <0.01)。
(A)区分MaS移植物中具有显著增量(红色条,n=180)或减量(蓝色条,n=211)的成分的条形图;(B)MaS移植物和非MaS移植物之间的FC和每个代谢物的显著性对比的火山图,红色点代表MaS移植物中显著更高的代谢物(FC>2,P<0.05),蓝点代表MaS移植物的代谢产物显著降低(FC<0.5,P<0.05);(C)条形图区分具有显著危险性的成分(蓝条,n=13)或对移植物衰竭的保护作用(红条,n=91);(D)HR和每个代谢物的显著性的火山图;(E)结果基于代谢产物的途径富集在MaS和非MaS移植物之间存在差异;(F)亚油酸代谢途径和供体MaS相关代谢物的详细信息;(G)甘油磷脂代谢途径和供体MaS相关代谢物的详细信息;(H)基于移植失败单变量cox比例分析中差异代谢物的途径富集结果;(I)类固醇生物合成和移植物衰竭相关代谢物的细节;(J)接受MaS移植物的亚组患者或发生移植物衰竭的病例的标准化PC/PE比率;(K)结果以E和H交叉代谢产物为基础的途径富集;(1)MaS相关移植失败的甘油磷脂代谢途径及相关代谢产物的详细信息;(M)代谢产物都与MaS和移植物衰竭有关。
表2 导致供者MaS和移植物衰竭的候选途径中潜在代谢物的总结
6.选择候选者进行预后分析
作者将先前单因素分析中的阳性临床和代谢组学阳性变量放入LASSO回归模型中以进行数据集的降维,筛选出包括23种代谢组学和9种临床特征的32个因素以进行进一步分析。结果显示其中15种因素(包括10种代谢组学和5种临床特征)具有最高的敏感性,为移植后预后的进一步预测模型。
7.结合临床和代谢组学特征的潜在模型对预后的预测
在多协变量Cox回归中具有统计学意义的15个因素被纳入到移植后预后的临床代谢预测模型的构建中(图4),在发生EAD或使用MaS供体的EAD患者中观察到明显较高的GF风险(分别为HR = 4.37 / 5.62)。已入药的易感代谢物大多数可分别分为脂质和有机酸类别。根据临床代谢模型,C00157化合物[PC(18:4/16:0)]发挥保护作用,而地塞米松(HMDB0015364)作为外源糖皮质激素在LT术后不良预后中起危害作用(HR = 0.28和4.13)。苏氨酸脯氨酸和PA(15:0/18:4)的危害作用达到高峰后继续保持在较高水平。作为外来物质的地塞米松和N-丙二酸在50%和37%的同种异体移植物中无法检测到,但我们发现一旦在其余位置检测到GF的风险会迅速增加。
8.诺模图预测移植后移植物衰竭
在考克斯回归模型中,与GF显著相关的15个因素(10个代谢组学和5个临床因素)被整合到不同时间段移植后移植物存活的预测列线图中(图4)。诺模图的一致性指数为0.85(95%CI:0.79 0.91)。校正图显示移植后存活的观察和预测风险之间有很好的一致性。我们在热图中观察到的较低的相关性,所有入选的因素相对独立(所有r<0.4,图4)。
9.诺模图在预后预测中的应用
作者根据上述诺模图算法提取的临床、代谢和组合因子聚类,分别评估预测模型的效率。同时,这些亚组对移植后生长因子的影响也按医学中心划分的亚组被评估。预测总移植物存活率的AUC为0.69(95%CI:0.58−0.79),0.85(95%置信区间:0.75−0.92)和0.91(95%CI:0.83)−0.96),用于临床、代谢和组合模型(图4)。基于诺模图算法的临床、代谢组学和组合因素,移植后GF的持续时间依赖性AUC也在延长至3年的登记患者中被评估(图4)。随着存活时间的延长,临床聚类(包括受体、移植物和手术因素)对移植后GF的预测准确率迅速下降。GF预测的AUC从180天的0.81下降到3年存活的0.67。与临床组群相比,代谢组群在GF预测上更稳定,不同时间点的波动较小(AUC在0.83~0.87之间)。临床代谢组学模型预测GF的敏感性和特异性在最佳临界值下分别达到0.93和0.81。与之相比,在相同的临床预测模型条件下,Youden指数仅为0.32,敏感性相对较高(0.99),特异性较低(0.33)。代谢组学数据的参与显著提高了移植后GF预测模型的效率。
(A)单变量分析中所选因子的Lasso系数分布;(B)最小准则交叉验证的最优参数选择;(C)通过cox比例分析构建GF发生预测模型的潜在候选森林图;(D)基于候选临床和代谢因素的GF预测诺模图;(E)不同时间点预测和实际GF之间关联的校正曲线;(F)对潜在的临床和代谢协变量进行成对相关分析的热图;(G)不同模型(临床模型、代谢模型和组合模型)在B组LT患者GF预测中的应用;(H)所有肝纤维化患者中不同模型对肝纤维化预测的时间依赖性AUROC值;(I)A组中不同模型对肝纤维化预测的时间依赖性AUROC值;(J)不同模型对B组(K)LT患者GF预测的时间依赖性AUROC值。
(A)精氨琥珀酸(HMDB0000052)对GF的剂量效应;(B)PC(18:4/16:0)(HMDB0008232)对GF的剂量效应;(C)非酰基肉碱(HMDB0013288)对GF的剂量效应;(D)地塞米松(HMDB0015364)对GF的剂量效应;(E)苏氨酸脯氨酸(HMDB0029069)对GF的剂量效应;(F)枇杷苷B(HMDB0038029)对GF的剂量效应;(G)阿维菌素D(HMDB0038943)对GF的剂量效应;(H)N-丙二酰色氨酸(HMDB0039500)对GF的剂量效应;(I)30-UMP(HMDB0060282)对GF的剂量效应;(J)PA(15:0/18:4)(HMDB0114818)对GF的剂量效应;(K)失血量(每1000ml)对GF的剂量效应;(L)移植前受者child-pugh评分;(M)受者身高(cm)对GF的剂量反应效应。
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