【NTT 2019演讲视频】玛氏全球食品安全中心：评估纳米孔测序技术用于沙门氏菌血清型预测的可行性研究

原创：中国市场部 OxfordNanopore 2019-12-12

沙门氏菌是食品安全风险监测的常规项目，其菌型繁多，已确认的沙门氏菌有 2500个以上的血清型，是导致食源性疾病的主要致病因子之一。食品安全一直都是玛氏最重视的事，纳米孔测序平台在便携性、可负担性、实时碱基识别和简易性方面的优势提供了一种潜在的基因测序替代方法，以满足工业需求中用于事故分析的有效和高效的沙门氏菌血清型识别。来自玛氏全球食品安全中心的唐斯琳博士和葛崇韬博士分别在NTT 2019北京场和上海场介绍了他们利用纳米孔测序技术用于沙门氏菌血清型预测的可行性研究，我们在此选取了北京场的演讲与大家分享。

点击下方视频观看完整的演讲：

为了探索纳米孔测序生成的全基因测序数据是否可以准确预测沙门氏菌血清型，他们对24株肠沙门氏菌菌株进行了测序（17种血清型）。Illumina Hiseq（200X）生成的相同分离株的全基因测序数据也作为准确度的基准用于预测血清型。他们发现GridION测序仪在前两个小时内生成的数据足以进行准确的血清型预测。所有预测均与Illumina Hiseq测序数据生成的对应结果相同。该初步研究表明，Oxford Nanopore测序系统生成的全基因测序数据可以在更短的时间内预测沙门氏菌血清型，预测的准确性与使用Illumina测序系统产生的测序数据进行预测的准确度相当。

会后，我们在现场对唐斯琳博士进行了采访，点击下方视频查看她谈纳米孔测序在应用科学的优势吧！

纳米孔测序微生物研究案例：

Nature Biotechnology封面 | 6小时识别病原菌的纳米孔宏基因组学方案

Nanopore 2019《Science》首发 | 在拉沙热疫情爆发的中心测序病毒基因组

塞拉利昂-中国友好生物安全实验室完成病原感染的新一代基因组测序识别与分析

【精彩回顾】纳米孔测序实现对人体肠道微生物组中抗性决定因子和移动元件的高分辨率分析

【应用案例】肠道微生物群的病原菌鉴定和种属鉴定

实例解读 | 纳米孔长读长在16S测序的优势和应用

实时的微生物鉴定和抗微生物耐药性分析

我们的目标：

使任何人，在任何地点，

能对任何生物进行分析。