金担子素A/AureobasidinA
Coolaber-金担子素
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不溶于水,
溶于甲醇、乙醇
一、关于AbA(CA2332):
金担子素A(Aureobasidin A,AbA)是从丝状真菌Aureobasidium pullulans No. R106中分离出来的环酯肽类抗生素,具有很强的抗真菌能力。AbA作用机制是抑制酵母中AUR1基因(1,2)编码的肌醇磷酰胺(inositolphosphorylceramide,IPC)合成酶的活性,干扰鞘脂合成,从而杀死菌株。AbA在较低的浓度下(0.1-0.5 μg/mL)即可对酵母产生毒性。编码IPC合成酶的基因研究较多的来自酿酒酵母菌的AUR1基因,以及构巢曲霉的AURA基因,两者具有同源性。通过对编码AUR1-C基因进行突变即可使得菌株对AbA产生抗性,作为蛋白质互作研究的报告基因。
因为AbA可以直接杀死敏感的酵母菌株,而不是延迟菌株生长,所以AbA筛选有利于阳性克隆的生长和识别。与营养报告基因(如HIS3)进行的低严紧度初筛相比,AbA筛选大大消除了背景克隆。实际操作中,用AbA进行初筛时会获得更多克隆,之后再用4个报告子(AUR1-C,HIS3,ADE2和MEL1)进行高严紧度的二次筛选以验证阳性克隆。AbA非常适合用作阳性克隆子筛选用的药物选择性标记;也是酵母单/双杂交研究中理想的报告子,可以简化酵母双杂交文库筛选。
二、使用方法:
1、本品为AbA的甲醇溶液,浓度为1 mg/mL,直接用作储存液。
2、灭菌后YPD Agar培养基(PM2020)冷却至50-55 ℃,加入适量的AbA储液,倒板备用。(AbA工作浓度取决于宿主细胞的敏感度,见下表)
3、制备酵母感受态细胞并完成转化,参考SK2400,SK2401。
4、把100 μl完成转化酵母细胞悬液涂到含有适量AbA的YPD Agar培养基平板上,30℃培养2-4天。
5、挑取克隆鉴定,或统计转化效率。
三、不同菌株建议AbA的工作浓度:
菌株 | MIC(µg/mL) | |
S.cerevisiae | ATCC9763(diploid) | 0.2-0.4 |
Baker’s yeast(diploid) | 0.2-0.4 | |
Beer yeast(triploid or tetraploid) | 0.1 | |
SH3328(haploid) | 0.1 | |
Shochu yeast(diploid) | 0.1 | |
Sake yeast(diploid) | 0.1-0.2 | |
C.albicans | TIMM-0136(diploid) | 0.04 |
C.tropicalis | TIMM-0324(diploid) | 0.08 |
Schizo.pombe | JY-745(monoploid) | 0.1 |
四、对AbA敏感的真菌:
出牙酵母(Saccharomyces cerevisiae)、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)、光滑念珠菌(Candida glabrata)、构巢曲霉(Aspergillus nidulans)和黑曲霉(A. niger.)。
五、酵母双杂交报告基因筛选:
AUR1-C是AUR1 的突变体,编码肌醇磷酸化酰胺合成酶,表达产物可以使酵母菌对金担子素产生抗性,只有产生蛋白互作的时候才会被激活,以此来筛选互作蛋白。Y2Hgold的报告基因之一为AUR1-C,可以用金担子素来筛选互作蛋白,比用组氨酸缺陷(HIS3)培养基筛选背景更低(更少的假阳性)。用于筛选的金担子素常用的浓度范围0.1-0.5 µg/mL。如筛选出来阳性克隆太少,可以将金担子素从200 ng/mL降低至150 ng/mL或者125 ng/mL。
六、酵母单杂交筛选:
如酵母单杂用的载体为pAbAi,诱饵序列克隆到pAbAi载体形成pBait-AbAi,通过同源重组整合到Y1Hgold基因组上,当猎物蛋白与诱饵蛋白发生互作后,会激活重组酵母菌AbAr基因的表达,使酵母菌对金担子素产生抗性,以此来筛选互作蛋白。重组酵母菌会有低背景的AbAr的本底表达,而且不同的诱饵蛋白表达程度也不一样。需要筛选出可以抑制本底表达的最低金担子素的浓度,用于后续阳性克隆筛选。一般会先用100 ng/mL,150 ng/mL,200 ng/mL的金担子素筛选约2000个细胞(OD600值稀释到0.002后取100 µL图板)。金担子素浓度最高可加到1 µg/mL。如还不能抑制本底表达,那诱饵蛋白不能用于金担子素筛选的互作实验。
酵母双杂交、单杂交、三杂交实验用培养基汇总说明,不再傻傻分不清!