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细菌/病毒/肿瘤有多大关联?新分析方法发表 | 热心肠日报

热心肠小伙伴们 热心肠研究院 2022-01-15

今天是第1820期日报。


绘制细菌、病毒和癌症之间的关联图谱

Microbiome[IF:11.607]

① 利用全基因组和RNAseq数据集,开发并验证基于Kraken的流程,识别并过滤数据中细菌和病毒序列;② 某些细菌和病毒在患者和癌症亚型具有差异性,如患者年龄、肿瘤分期、存活率和癌基因的体细胞突变或基因表达谱;③ 假单胞菌在慢性髓系发育不良中与年龄增长有关,罗尔斯顿菌与肾癌存活率的提高有关;④ 在前列腺癌中,痤疮丙酸杆菌的检测和增加与癌症基因突变数量的减少有关;⑤ 除乙肝可整合到癌症基因组,没有发现存在普遍的横向基因转移现象。

An atlas of the tissue and blood metagenome in cancer reveals novel links between bacteria, viruses and cancer
04-22, doi: 10.1186/s40168-021-01039-4

【主编评语】由细菌和病毒引起的宿主组织感染可导致癌症。病毒的致癌机制包括通过基因组整合破坏宿主基因组和致癌病毒蛋白的表达,而细菌致癌的重要机制是慢性炎症。Microbiome近期发表的文章,通过对3025份癌症样本、1000份正常对照的全基因组测序数据进行分析,挖掘其中的病毒和细菌序列,鉴定出一些已知的病毒、细菌和癌症之间的关联,同时也识别出新的关联,提供了一份病毒、细菌和癌症之间联系的详细图谱,为将来的研究和进一步实验验证提供参考。(@爱的抉择)

神刊CA:一文读懂胃癌治疗的进展(综述)

CA - A Cancer Journal for Clinicians[IF:292.278]

① 全身化疗、放疗、手术、免疫治疗和靶向治疗均已被证明对胃腺癌有效;② 三联化疗已成为可切除胃癌的治疗标准,联合治疗(术前/术后化疗+放化疗)对非转移性胃癌和胃食管腺癌患者有效;③ 对于转移性及不可切除胃癌,多药化疗优于单药化疗,根据HER2或PD-L1的表达可联合HER2单抗或PD-L1单抗用于一线治疗;④ 生物标志物(微卫星不稳定性、PD-L1、HER2、肿瘤突变负荷及EB病毒)推动了个体化治疗进展;⑤ EGFR及Claudin18.2可作为胃癌治疗新靶点。

Current treatment and recent progress in gastric cancer
02-16, doi: 10.3322/caac.21657

【主编评语】CA - A Cancer Journal for Clinicians上发表的一篇综述文章,详细介绍了胃癌(包括局部/可切除及转移性/不可切除胃癌)的现有及在研治疗方案(包括化疗、放疗、手术、免疫治疗及靶向治疗),讨论了生物标志物在胃癌个体化治疗中的应用,并对未来的研究方向(新靶点、腹腔化疗、复发预测)等进行了展望。(@szx)

肠上皮化生程度越高,短期内胃癌风险越高

Gut[IF:19.819]

① 纳入2980名接受胃镜检查患者,标准化收集胃粘膜,3年及5年后再次进行胃镜检查,21人被诊断为早期胃癌(EGN);② 肠上皮化生(IM)是EGN的一个显著风险因素,校正年龄后,伴有或不伴有IM的EGN发生率分别为133.9和12.5/10万人-年;③ II级和III-IV IM患者的EGN风险均显著增加(校正后HR分别为7.34及20.7);④ 一半以上的EGN是由III-IV的IM患者在2年内发展而来,吸烟史进一步增加II级和III-IV IM患者的患癌风险。

Severity of gastric intestinal metaplasia predicts the risk of gastric cancer: a prospective multicentre cohort study (GCEP)
05-11, doi: 10.1136/gutjnl-2021-324057

【主编评语】来自Gut上发表的一项前瞻性队列研究结果,对近3000名接受胃镜检查的患者进行多年随访,发现肠上皮化生是早期胃癌的显著风险因素,且肠上皮化生严重程度越高,早期胃癌风险越高。超过一半的早期胃癌是由严重肠上皮化生发展而来的。该研究建议,II期和III-IV期肠上皮化生患者应分别在5年内及2年内接受胃镜监测。(@szx)

Lancet子刊:DS-8201用于转移性大肠癌的三线或以上治疗

The Lancet Oncology[IF:33.752]

① 纳入78名表达HER2的转移性结直肠癌患者,之前接受过2种以上的治疗后仍进展;② 每3周静脉注射一次DS-8201(6.4mg/kg),直至疾病进展/死亡或发生不可接受的不良事件;③ 在53名HER2阳性(IHC2+/IHC3+、ISH阳性)患者中,中位随访27.1周后,24名患者确认客观缓解(客观缓解率为45.3%);④ 常见的3级或以上治疗相关不良事件包括中性粒细胞减少(22%)及贫血(14%);⑤ 5名患者发生间质性肺病或肺炎,其中1名患者死亡。

Trastuzumab deruxtecan (DS-8201) in patients with HER2-expressing metastatic colorectal cancer (DESTINY-CRC01): a multicentre, open-label, phase 2 trial
05-04, doi: 10.1016/S1470-2045(21)00086-3

【主编评语】DS-8201是一种靶向HER2的抗体-药物偶联物(ADC),已获批用于治疗HER2阳性的转移性乳腺癌及胃癌。The Lancet Oncology上发表的一项2期临床试验结果,在经标准治疗后进展的53名HER2阳性转移性结直肠癌患者中,DS-8201治疗的客观缓解率可达45.3%,需要关注治疗期间的间质性肺病或肺炎风险。(@szx)

大肠癌肝转移患者复发风险有多高?ctDNA或可预测

PLoS Medicine[IF:10.5]

① 纳入54名接受手术切除的结直肠癌肝转移患者,43%接受了新辅助化疗,78%接受了辅助化疗,中位随访51个月;② 所有治疗前的ctDNA检出率为46/54(85%),手术后的ctDNA检出率为12/49(24%);③ 新辅助化疗后的ctDNA清除与无复发生存期无显著关联;④ 手术后仍可检测到ctDNA的患者的无复发生存期及总生存期均显著低于未检测到ctDNA的患者;⑤ 所有治疗后可检测到ctDNA的患者的5年无复发生存率为0%,而未检测到ctDNA的患者为75.6%。

Circulating tumor DNA dynamics and recurrence risk in patients undergoing curative intent resection of colorectal cancer liver metastases: A prospective cohort study
05-03, doi: 10.1371/journal.pmed.1003620

【主编评语】PLoS Medicine上发表的一项前瞻性队列研究结果,对54名接受手术切除(部分接受新辅助化疗和/或辅助化疗)的结直肠癌肝转移患者进行多年随访,发现手术后仍可检测到ctDNA预示着更差的预后(更短的无复发生存期及总生存期)。另外,对于所有治疗结束后(手术和/或辅助化疗)仍可检测到ctDNA的患者,5年内均出现了复发;而对于未检测到ctDNA的患者,5年内仅有1/4复发。该研究结果提示,ctDNA或可用于预测结直肠癌肝转移患者的复发风险。(@szx)

肿瘤微环境中的髓系免疫细胞影响大肠癌预后

Journal for ImmunoTherapy of Cancer[IF:9.913]

① 对913份结直肠癌样本的肿瘤微环境进行分析;② 较高的上皮内及基质CD14+ HLA-DR+ 细胞密度与较低的结直肠癌死亡率相关,但较高的上皮内CD14+ HLA-DR- 细胞密度与较高的结直肠癌死亡率相关;③ 相比于CD14+ 细胞,CD15+ 细胞与肿瘤细胞更为接近,而相比于CD14+ HLA-DR- 细胞,CD14+ HLA-DR+ 细胞与肿瘤细胞更为接近;④ 相比于CD14+ HLA-DR- 细胞,任意一个肿瘤细胞的半径20μm内有至少一个CD14+ HLA-DR+ 细胞与更低的结直肠癌死亡率相关。

Prognostic significance of myeloid immune cells and their spatial distribution in the colorectal cancer microenvironment
04-30, doi: 10.1136/jitc-2020-002297

【主编评语】Journal for ImmunoTherapy of Cancer上发表的一项最新研究,对结直肠肿瘤微环境中的CD14+ 单核细胞及CD15+ 粒细胞进行分析,发现成熟的CD14+ HLA-DR+ 细胞的浸润及其与肿瘤细胞的接近与更好的结直肠癌预后相关,而未成熟的CD14+ HLA-DR- 细胞的浸润则相反。(@szx)

阿司匹林用于肝癌的预防与辅助治疗(综述)

Cancer Research[IF:9.727]

① 多项回顾性队列研究及流行病学研究表明,在普通人群或肝细胞癌高危人群中,定期服用阿司匹林与肝细胞癌的发病及死亡风险降低相关;② 阿司匹林或可辅助其它疗法(手术切除、肝动脉栓塞、肝动脉化疗栓塞、索拉非尼)以减少肝细胞癌的复发;③ 但也有部分研究表明,阿司匹林对肝细胞癌的发病及复发风险并无显著影响;④ 阿司匹林的防癌作用可能与其抗血小板及抗炎作用有关;⑤ 阿司匹林可能增加出血风险,限制了其用于肝细胞癌的预防与治疗。

Aspirin in hepatocellular carcinoma
04-23, doi: 10.1158/0008-5472.CAN-21-0758

【主编评语】有证据显示阿司匹林可降低结直肠癌的风险和死亡率,但其是否对所有癌症都有保护作用还不明确。近期发表于Cancer Research的一篇综述文章,详细介绍了阿司匹林用于肝细胞癌的预防及辅助治疗的相关研究结果,并讨论了阿司匹林在肝细胞癌中的潜在作用机制。但由于现有研究多为回顾性队列研究或流行病学研究,且结论并不完全一致,并考虑到阿司匹林可能导致的出血风险,未来还需要从前瞻性研究中获得更多的证据。(@szx)

影响大肠癌风险的饮食因素

Clinical Gastroenterology and Hepatology[IF:8.549]

① 对EPIC的386792名被试开展全饮食关联研究,评估92种食物和营养素与结直肠癌(CRC)的风险关系,鉴定出20种关联性;② 酒精、白酒/烈酒、葡萄酒、啤酒/苹果酒、软饮料和猪肉与CRC正相关;③ 牛奶、奶酪、钙、磷、镁、钾、核黄素、维生素B6、β-胡萝卜素、水果、纤维、非白面包、香蕉和总蛋白质与CRC负相关;④ 在NLCS人群中重复验证出13种关联性,即酒精与CRC风险正相关,而奶制品、钙、磷、镁、钾、核黄素、β-胡萝卜素和总蛋白质则负相关。

A prospective diet-wide association study for risk of colorectal cancer in EPIC
04-23, doi: 10.1016/j.cgh.2021.04.028

【主编评语】Clinical Gastroenterology and Hepatology近期发表的文章,对欧洲癌症与营养前瞻性调查(EPIC)的386792名被试开展全饮食关联研究,鉴定出20种关联性,随后在荷兰队列研究(NLCS)中进行重复验证。最后得出结论:酒精与CRC风险呈正相关,而奶制品和钙与之呈负相关,摄入较高的磷、镁、钾、核黄素、β-胡萝卜素和总蛋白质可降低CRC风险。(@爱的抉择)

福建医科大学:吃过多肉食及腌制食品可能增加鼻咽癌风险

American Journal of Clinical Nutrition[IF:6.766]

① 纳入中国南方3个鼻咽癌流行地区的2554例新诊断的鼻咽癌患者和2648例对照;② 成年时期植物性饮食摄入量最高者的鼻咽癌风险相比于摄入量最低者降低了52%,而动物性饮食摄入量最高者的鼻咽癌风险为摄入量最低者的2.26倍;③ 青春期的饮食模式与鼻咽癌风险也有类似但较弱的关联;④ 在成年时期及青春期,大量摄入腌制食品均与鼻咽癌风险增加有关,但在青春期发现更强关联;⑤ 相比于青春期,基于成年时期的饮食因素预测鼻咽癌风险更稳定和可靠。

Dietary patterns and risk of nasopharyngeal carcinoma: a population-based case-control study in southern China
05-08, doi: 10.1093/ajcn/nqab114

【主编评语】福建医科大学的叶为民团队在American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项病例-对照研究结果,对比了2554名鼻咽癌患者及2648名对照的饮食模式,发现摄入更多的植物性饮食与更低的鼻咽癌风险相关,而摄入更多的动物性饮食及腌制食品与更高的鼻咽癌风险相关。(@szx)

感谢本期日报的创作者:Echo Quasimodo,orchid,this little piggy,szx,临床营养陈彬林

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