《自然·综述》：于君等24页长文讲透菌群与大肠癌 | 热心肠日报
今天是第2559期日报。
于君等Nature Reviews：一文读懂肠菌在大肠癌及其治疗中的作用（综述）
Nature Reviews Clinical Oncology[IF:65.011]
① 有益和有害菌群平衡对肠道健康至关重要，菌群失调或改变（包括其他非细菌微生物）可能会导致各种肠道疾病的发生；② 肠菌可能通过基因毒性介导的遗传变异、致癌信号级联传导、炎症、促使免疫逃逸的发生、微生物-宿主间的共代谢以及营养组分变化等促进CRC发生；③ 宿主遗传/表观遗传特征与肠菌间存在双向交互作用，肠菌能够放大致癌因子下游效应，促进CRC的发展；④ 肠菌会影响免疫检查点抑制剂的治疗效果，也可作为肿瘤生物标志物。
Gut microbiota in colorectal cancer development and therapy
05-11, doi: 10.1038/s41571-023-00766-x
【主编评语】结直肠癌（CRC）是全球最常见的癌症之一，其肠内共生菌群是肿瘤微环境的重要组成部分，它的失调对于癌症的发展、进展和治疗有着重要影响。近日，香港中文大学于君及团队在Nature Reviews Clinical Oncology发表最新综述，从肠道菌群与CRC的关系、肠道菌群在CRC防治中的作用、肠道菌群影响免疫检查点抑制剂的治疗效果以及肠道菌群作为肿瘤生物标志物等角度系统地论述了肠菌在癌症发展和治疗中的作用，值得关注和精读。（@九卿臣）
Nature：解析肠道拟杆菌的外膜如何摄取聚糖
Nature[IF:69.504]
① 拟杆菌跨细菌外膜的聚糖摄取由SusCD蛋白复合物介导，该复合物包括膜底物桶和脂蛋白盖，在闭合和释放过程中促进底物结合和运输；② 表面暴露的糖结合蛋白和糖苷水解酶在捕获、处理和运输大的糖链中发挥关键作用；③ 添加底物时，果聚糖utilisome发生构象变化，揭示GHlev和SGBPlev底物结合状态，证明踏板仓运输机制在PUL所有OM定位成分存在时运作；④ 拟杆菌额外外膜成分聚集在核心SusCD转运器上形成稳定的糖类利用机器，被命名为utilisome。
Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes
06-07, doi: 10.1038/s41586-023-06146-w
【主编评语】拟杆菌门是人类微生物群中丰富的成员，在远端肠道利用了大量的饮食和宿主来源的聚糖。Nature近期发表的文章，从结构的角度出发，解析了聚糖利用机器utilisome如何形成和运转的。（@章台柳）
袁静等Nature子刊：噬菌体疗法或可缓解肺炎克雷伯菌引起的脂肪肝
Nature Communications[IF:17.694]
① 高产酒精的肺炎克雷伯菌是导致非酒精性脂肪性肝病原因之一，其抗生素耐药性会显著影响临床实践效果；② 筛选出一种不含溶源性、耐药性或毒力因子的裂解噬菌体phiW14，可作为治疗内源性酒精性脂肪肝病的候选药物；③ 噬菌体疗法能够缓解肺炎克雷伯菌引起的脂肪性肝炎，包括肝功能障碍以及细胞因子和成脂基因的表达；④ 噬菌体疗法不仅可以靶向抑制肠道菌群中的肺炎克雷伯菌，还可通过调节炎症、脂质和碳水化合物代谢来预防脂肪性肝炎；
Bacteriophage targeting microbiota alleviates non-alcoholic fatty liver disease induced by high alcohol-producing Klebsiella pneumoniae
06-03, doi: 10.1038/s41467-023-39028-w
【主编评语】多项研究已经发现肠道菌群中高产酒精的肺炎克雷伯菌可能是非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的原因之一，但目前仍没有批准的药物治疗可用于NAFLD。近日，首都儿科研究所袁静、孙英及团队在Nature Communications发表最新研究，筛选出一种不含溶源性、耐药性或毒力因子的裂解噬菌体phiW14，发现噬菌体靶向微生物群可缓解高产酒精肺炎克雷伯菌引起的NAFLD，值得关注。（@九卿臣）
Nature子刊：靶向肺炎克雷伯菌治疗原发性硬化性胆管炎
Nature Communications[IF:17.694]
① 在45名原发性硬化性胆管炎（PSC）患者粪便中检测到肺炎克雷伯菌（Kp）和鹑鸡肠球菌富集，两种病原体携带者疾病活动性高且临床结果差；② PSC衍生Kp在SPF肝胆损伤易感小鼠中的定植增强肝Th17细胞反应，并细菌移位至肠系膜淋巴结而加重肝损伤；③ 靶向Kp的裂解性噬菌体疗法在体外可持续抑制Kp生长；④ 口服噬菌体降低无菌和SPF小鼠Kp水平，未发生脱靶失调；⑤ 口服和静脉注射噬菌体成功抑制SPF肝胆损伤易感小鼠Kp水平，减轻肝脏炎症及疾病程度。
Bacteriophage therapy against pathological Klebsiella pneumoniae ameliorates the course of primary sclerosing cholangitis
06-05, doi: 10.1038/s41467-023-39029-9
【主编评语】原发性硬化性胆管炎（PSC）是一种特发性、异质性胆汁淤积性肝病，其特征是持续性进行性胆道炎症和纤维化，导致肝硬化和终末期肝病，除肝移植外，尚未开发出治疗PSC的有效药物。肺炎克雷伯菌（Kp）广泛存在于PSC患者粪便中，口服靶向Kp的噬菌体疗法治疗肠道炎症已被证明其安全性和潜力。然而，噬菌体治疗肝胆疾病在人群中的持续性和可行性仍然未知。发表于Nature Communications上的文章，在PSC患者和SPF/GF小鼠中验证了Kp与PSC的联系，证明靶向PSC中Kp的裂解噬菌体混合物能够缓解肝脏炎症和PSC的严重程度。（@RZN）
柯嘉等：基于核磁共振的深度学习模型可预测直肠癌预后
Radiology[IF:29.146]
① 将中国725名直肠癌患者盆腔的核磁共振（MRI）扫描结果分训练集（n=507）和验证集（n=218），开发并验证用于预测直肠癌患者总生存期的MRI深度学习模型；② Vision Transformer模型表现最佳，能准确预测验证集中患者的1年、3年和5年的总生存期；③ 该深度学习模型预测可推广到不同的队列和临床亚组，在统计上独立于潜在的混杂因素；④ 集成XGBoost模型或结合治疗前癌胚抗原的多模态模型，在验证集和外部测试集的C指数分别为0.86和0.67。
An MRI Deep Learning Model Predicts Outcome in Rectal Cancer
06-06, doi: 10.1148/radiol.222223
【主编评语】深度学习模型有可能改善直肠癌的预后，但尚未得到系统评估。近日，中山大学附属第六医院柯嘉及团队在Radiology发表最新研究，纳入中国725名直肠癌患者盆腔的核磁共振扫描结果分训练集和验证集，发现基于核磁共振开发的深度学习模型可较好的预测直肠癌预后，值得关注。（@九卿臣）
Nature子刊：结肠胶囊内镜的临床应用现状（临床前景）
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:73.082]
① 自进入市场以来的十多年里，结肠胶囊内镜（CCE）一直受限于其功能较差（单圆顶和单摄像头）的阴影之下；② 随着院外治疗日益增长的需求，加上技术和临床质量的提高，使得CCE更广泛的使用成为可能；③ 人工智能支持的镜头分析可能会进一步提高CCE的质量，未来CCE的价格可能降低到具有竞争力的水平；④ 目前新冠大流行后的局势使我们严重缺乏合格的相关卫生专业人员，自动化和人工智能支持的CCE可能会缓解当前困境。
Current status of colon capsule endoscopy in clinical practice
05-02, doi: 10.1038/s41575-023-00783-2
【主编评语】结肠胶囊内镜（CCE）目前仅用于有限的病人，而随着院外治疗日益增长的需求，加上技术和临床质量的提高，使得更广泛的CCE使用成为可能。近期Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology发表了关于CCE应用现状的短文评论。注：结肠胶囊内镜(colon capsule endoscopy, CCE)作为一种诊断结肠病变的新型工具，具有无创性、接受性高、安全性高等优点。（@注册营养师陈彬林）
ChatGPT能很好回答有关结肠镜检查的问题！
Gastroenterology[IF:33.883]
① 研究者从美国胃肠专科排名前20的三家医院的公开网页上检索到8个关于结肠镜检查的问题和答案；② 将这些问题作为ChatGPT的提示在同一天输入两次并得到两次回答，四名胃肠病学家对ChatGPT回答的易于理解度、科学充分性以及对答案的满意度共三方面进行打分；③ ChatGPT答案与医院网页上的答案的文本相似度极低（0%至16%），而两次ChatGPT答案的文本相似度从28%到77%不等；④ ChatGPT答案与非人工智能答案的上述三方面得分均旗鼓相当。
ChatGPT Answers Common Patient Questions About Colonoscopy
05-05, doi: 10.1053/j.gastro.2023.04.033
【主编评语】ChatGPT（英文全名：Chat Generative Pre-trained Transformer，中文名：聊天生成型预训练变换模型），是由人工智能实验室OpenAI研发的通用聊天机器人，于2022年11月30日上线。近期发表于Gastroenterology的一项研究表明ChatGPT能够为有关结肠镜检查的常见问题提供易于理解、科学充分和普遍满意的答案。据此，对话式人工智能程序可以生成可靠的医疗信息，以回应常见的患者问题。对人工智能程序进行专门的领域培训，有可能进一步优化其与患者的临床沟通。（@注册营养师陈彬林）
疑似克罗恩病的检查中，电动螺旋肠镜与单球囊肠镜的技术性能和诊断率的比较
Gut[IF:31.793]
① 纳入125例疑似克罗恩病（CD）患者，进行电动螺旋肠镜（MSE）和单气囊肠镜（SBE）检查的分别是62例和63例；② 总体技术成功率（98.4%：MSE，90.5%：SBE）、诊断率（95.2%：MSE；87.3%：SBE）和手术时间无显著差异；③ MSE在较深的小肠（远端空肠/近端回肠）中似乎有更高的技术成功率(96.8% vs 80.7%），DMI更高，深度/时间比、尝试的总肠镜检查率（ 77.8% vs 11.1%）更高；④ 这两种方式都是安全的，但MSE导致的轻微不良事件更多。
Technical performance and diagnostic yield of motorised spiral enteroscopy compared with single-balloon enteroscopy in suspected Crohn’s disease: a randomised controlled, open-label study (the MOTOR-CD trial)
05-17, doi: 10.1136/gutjnl-2023-329885
【主编评语】最近的研究表明，与单气囊肠镜（SBE）相比，电动螺旋肠镜（MSE）能够对疑似克罗恩病（CD）进行更深入和全面的小肠评估。然而，没有一项随机对照研究对疑似CD患者的双向MSE和双向SBE进行比较。Gut近期发表的文章，发表了一项相关的随机对照研究，MSE和SBE对疑似CD的小肠评估中具有相当的技术成功率和诊断率。而在较深的小肠评估方面，MSE得分高于SBE，小肠覆盖率完全，且在较短时间内插入深度更深。（@章台柳）
大局观！胃肠内镜检查产生的温室气体，不容忽视！
Gut[IF:31.793]
① 本系统综述概述了消化内镜相关环境碳足迹的现有文献，共纳入9篇学术论文，其中3篇是来自美国的横断面研究，其余为综述或立场声明；② 消化内镜检查可显著产生碳排放，这可以通过减少障碍（包括相关知识欠缺、监管要求、资金驱动、缺乏激励措施、COVID-19大流行）和确定新策略来缓解；③ 识别由消化内镜活动产生的碳排放至关重要，且迫切需要收集碳排放量化的相关数据并研究减少这些碳排放的新方法，以便将来实现“绿色内镜”。
Production and possible reduction of greenhouse gases produced during GI endoscopy activity: a systematic review of available literature
2022-12-15, doi: 10.1136/gutjnl-2022-328369
【主编评语】温室气体由二氧化碳、甲烷、氧化亚氮和含氟气体组成。在美国，卫生系统占温室气体排放总量的8.5%。近期发表于Gut的一篇系统综述的主要目的是批判性地分析消化内镜活动的碳排放情况。（@注册营养师陈彬林）
开发人工肠道组织，用于混合、分解肠道内食物
Advanced Materials[IF:32.086]
① 对细胞收缩性、细胞形态和转录组概况的评估显示，成功生成收缩的肠道肌肉贴片，既依赖于无血清介质中的生物因素，也依赖于来自弹性电纺明胶支架的环境线索；② 比较样本之间的基因表达模式发现，来自培养基的生物因子强烈地影响着离子运输活动，而支架调节着细胞与细胞之间的交流；③ 对配体-受体相互作用组的分析，确定了支架驱动的细胞间通讯的变化，上调的配体-受体相互作用中有78%参与了肠道神经元的发育和功能。
Engineered Living Intestinal Muscle Patch Produces Macroscopic Contractions that can Mix and Break down Artificial Intestinal Contents
02-13, doi: 10.1002/adma.202207255
【主编评语】肠道肌肉层执行各种肠壁运动，以达到控制推进和混合肠道内容物的目的。设计具有复杂收缩功能的肠道肌肉层对于开发生物人工肠道组织以治疗短肠综合征患者至关重要。Advanced Materials发表的研究，制造了一个电纺正交双层支架，其纤维排列整齐，模仿了肠道肌肉层的自然几何形状，能够产生三种不同的运动模式。我们的发现突出了结合生物分子和生物材料方法进行组织工程的重要性，为研究消化道运动和临床前药物发现提供了一个更加生理化的模型。（@NL）
感谢本期日报的创作者：DM，Sunflower，accepted，Jack Chen，注册营养师陈彬林，章台柳，NL