著名打假人Elisabeth M Bik三年持续跟踪论文图片问题!南方医科大学丁彦青等人4篇文章被质疑
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论文信息一
2020年1月,南方医科大学丁彦青等人在Molecular Cancer发表题为"Hsa_circ_001680 affects the proliferation and migration of CRC and mediates its chemoresistance by regulating BMI1 through miR-340"的论文。
质疑信息
#1 Elisabeth M Bik于2020年2月发表评论:图2H蓝色框内,在“Scramble”行中48h 和 96h 面板看起来非常相似。由于同一细胞有2个不同的时间点,因此预计会有一些相似性,但这2个面板看起来比预期的更相似,细胞经过了48h成长期,但几乎就像同一样本的两次不同曝光一样。
#2 作者于2020年2月回应:非常感谢您的评论。我为这个错误道歉。以下是12年2019月2日首次投稿的图片,我们有投稿记录。我们将此结果放在补充图2中。审稿人建议我们把这个结果放在图2中。当我们重新排列这些结果时,我们犯了错误。我会立即联系小编解决问题。再次感谢您的善意提醒。如果您有任何问题,请随时告诉我们。!
#3 Pranujan Pathmendra于2023年4月发表评论:本文中提到的下列核苷酸序列试剂似乎标识错误:
qRT-PCR 正向引物 5'- AACTGTTTGCAGAGGAAACTGA-3'
声称靶向人类 miR-340(chr5:180,015,303-180,015,400(GRCh38/hg38))。
预测靶向人类 miR-452(chrX:151,959,628-151,959,712(GRCh38/hg38))。
生物素探针序列 5'-TTAGTCAGAGTAACGAAATATT-3'
声称靶向人类 miR-340(chr5:180,015,303-180,015,400(GRCh38/hg38))。
预测对人类无靶向性。
生物素探针和地高辛探针序列 5'-CATGGACATGATCTTCTTTATAA-3'
声称靶向人类 hsa_circ_001680/B2M (chr15:45009906-45009989, circBASE, NM_004048)
预测不针对所声称的 circRNA 目标的后接合点序列。
预测不能区分声称的宿主基因 B2M(chr15:44,711,358-44,718,851(GRCh38/hg38))的线性和环状转录本。
这些核苷酸序列的身份如上所述进行了验证 (Byrne et al. 2021, Park et al. 2022, Pathmendra et al. 2023).
我们认识到,核苷酸序列分析依赖于可能需要更新的算法和数据库。
这些错误识别的试剂可能仅反映在手稿制备过程中发生的错误,也可能反映出可能质疑结果有效性的更关键问题。
#4 作者于2023年4月回应:非常感谢您的评论,我们将立即检查引物和探针序列顺序。
#5 Elisabeth M Bik于2023年5月发表评论:亲爱的李博士,您在 2020 年 2 月写道,您将联系编辑解决评论 #1 中指出的问题。现在已经是 2023 年 5 月了,三年多过去了,论文似乎没有任何更正。能否请您介绍一下您何时联系了期刊编辑,以及期刊的回复如何?
#6 Elisabeth M Bik于2023年5月发表评论:图3L绿色方框处出现重叠
#7 Elisabeth M Bik于2023年5月发表评论:图 S2(附加文件 3)中可能还有一些重复的面板。相同颜色的方框突出显示了三个 "Vector"面板,它们看起来与 "Scramble "面板完全相同。
这使得重复的面板总数达到了五组。
#8 Illex illecebrosus针对#6于2023年5月提供了证明图片重复的动画:https://youtu.be/Ctf5z9GJMSw
#9 作者于2023年5月回应 #5 :感谢您的好心提醒。我们会尽快给编辑发邮件。
论文信息二
2010年10月,南方医科大学在Clinical & Experimental Metastasis发表题为"CD133+ single cell-derived progenies of colorectal cancer cell line SW480 with different invasive and metastatic potential"的论文。
第一作者:南方医科大学李广秋
通讯作者:南方医科大学丁彦青、邓永键
质疑信息
#1 Actinopolyspora biskrensis于2022年1月发表了评论:图2中出现重叠
#2 Actinopolyspora biskrensis于2022年1月发表了评论:图 6D 有两组相似图
论文信息三
2018年5月,南方医科大学Cell Death and Disease在Gastroenterology发表题为"STX2 promotes colorectal cancer metastasis through a positive feedback loop that activates the NF-κB pathway"的论文。
第一作者:南方医科大学王永霞
通讯作者:南方医科大学丁彦青、廖雯婷、冶亚平
质疑信息
#1 Actinopolyspora biskrensis于2021年10月发表评论:图 4D 和 6A 中似乎都使用了一个波段。作者能否提供原始的未裁剪扫描件?
论文信息四
2020年7月,南方医科大学在Cell Death & Disease发表题为"Upregulation of OSBPL3 by HIF1A promotes colorectal cancer progression through activation of RAS signaling pathway"的论文,于2022年11月2日已撤回。
第一作者:南方医科大学焦红丽、翁斌树、闫珊珊
通讯作者:南方医科大学丁彦青、冶亚平
质疑信息
#1 Actinopolyspora biskrensis于2021年2月发表评论:图 4C 中至少有一个波段似乎被使用了两次,分别在水平和垂直翻转之后,以及在对比度调整之后。很难看出这是怎么会意外发生的。作者可以发表评论吗?
#2 Indigofera tanganyikensis于2021年2月发表评论:一个肿瘤在旋转和一些编辑后在图3中出现了两次。
#3 Hoya camphorifolia于2022年11月发表评论:
2022年11月2日已撤回
主编已撤回本文。发表后,人们对疑似图像重复和重叠表示担忧。具体说来:
在图3a中,两种细胞系的细胞生长曲线看起来高度相似;
在图 3e 中,shRNA#1 和 shRNA#2 的 H&E 图像似乎重叠;
在图 3h 中,scramble 和 shRNA#1 组中的肠道图像似乎来自同一样品;
同样在图3h中,shRNA#1和shRNA#2组的肝脏图像看起来高度相似(旋转90度,亮度调节);
在图 4c HCT116 shRNA 数据中,代表 OSBPL3 和 P27 的条带看起来高度相似(旋转 180 度);
在图5a中,HCT15 OSBPL3条带与图166c中的HCT3 OSBPL27和P4印迹高度相似;
在图中。S2g,表示HCT15载体基团的图像与图6高度相似。S1e RKO HIF3a+OSBPL1-shRNA#<>;
在图中。S3f,HCT116 shRNA#1 和 shRNA#2 的图像似乎重叠。
在表1中,OSBPL3低表达组和高表达组的患者总数不一致。
因此,主编不再对所提供的数据有信心。
所有作者都没有回应编辑或出版商关于此次撤稿的任何信件。
参考消息:
https://pubpeer.com/publications/AA22E0B4111D09ACE375E837BFC3E9
https://pubpeer.com/publications/AB9FECE6A393656F9BD91EA70D1729
https://pubpeer.com/publications/0537A6B0115122E1E496E80282EAF1
https://pubpeer.com/publications/A14AABD164B748EF6C78F12102D4E9
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