点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：白羽，编辑：景行、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读已有报道表明新冠肺炎与嗅觉丧失以及嗅球中存在SARS-CoV-2病毒有关。为了检验嗅觉神经上皮是否为病毒的靶点，研究人员由人嗅觉神经上皮中构建了RNA-seq文库，发现病毒受体血管紧张素转换酶-2(ACE

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：逍遥君，编辑：景行、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读正在进行的COVID-19疫情在世界范围内造成了毁灭性的死亡，对公共卫生构成了巨大的威胁。然而，由于科学界对这种致死性疾病的宿主免疫应答的了解有限，阻碍了有效治疗药物的确定和治疗。因而本研究为了鉴定SARS-CoV-2（HCoV-19）感染后宿主炎症反应的转录特征，对从COVID-19患者支气管肺泡灌洗液（BALF）和外周血单核细胞（PBMC）标本中分离的RNA进行了转录组测序。结果揭示了患者SARS-CoV-2感染的不同宿主炎性细胞因子谱，并强调了COVID-19发病机制与过度细胞因子释放如CCL2/MCP-1、CXCL10/IP-10、CCL3/MIP-1A和CCL4/MIP1B之间的相关性。此外，SARS-CoV-2诱导的淋巴细胞凋亡和P53信号通路的激活可能是患者淋巴细胞减少的原因。COVID-19患者的转录组数据集将是临床指导抗炎药物和了解宿主反应分子机制的宝贵资源。论文ID原名：Transcriptomic

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：Champion，编辑：景行、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读为了解结构异质性并揭示成功重编程的机制，本研究采用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞转座酶可及染色质分析（scATAC-Seq）对不同时间点的重编程细胞进行了分析。研究分析表明，重新编程的细胞以异步轨迹进行，并分化成不同的亚群。并鉴定了荧光探针和表面标记，以丰富早期重编程的人类细胞。此外，表面标记的组合使用使得具有不同重编程倾向的早-中期细胞能够很好地分离。scATAC-Seq分析进一步揭示了负责重编程过程调控阶段的基因组分区和转录因子。FOSL1和以TEAD4为中心的调控网络之间的二元选择决定了成功重新编程的结果。论文ID原名：Diversification

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：胡胡，编辑：景行、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读躯体感觉是由多种初级感觉神经元的存在定义的，这些神经元具有独特的生物学特征以及对外部和内部刺激的反应特征。然而，关于细胞状态的多样性是如何在转录过程中产生的，目前还没有一个相对完整的概念。本研究使用深度单细胞RNA测序分析来解决小鼠感觉神经发生过程中的分裂和分子偏倚过程，结果确定了有丝分裂后神经元中一系列复杂的连续和特定的转录变化，这些变化描绘了导致主要感觉神经元类别产生的递阶调节状态。同时发现早期表达的亚型与本研究之前未被发现的基因型有关。总体而言，感觉神经元的早期多样性是通过连续的双电位中间产物产生的，其中相关基因模块的同步化和竞争性命运程序的同时抑制在细胞的稳定和最终分裂到分化之前。论文ID原名：Single

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：逍遥君，编辑：夏甘草、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读肝内胆管细胞癌（intrahepatic

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：小鹿同学，编辑：夏甘草、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读本研究描述了一个人类黑质（SN）的单细胞转录组图谱，该图谱是通过对来自大脑皮层和SN成对样本中大约17,000个单细胞核进行测序而生成的。研究者发现帕金森氏病（PD）的常见遗传风险与多巴胺能神经元（DaN）特异的基因表达有关，包括线粒体的功能、蛋白质折叠和泛素化途径。研究者确定了PD风险与少突神经胶质细胞特异的基因表达之间存在明显的细胞类型关联。与阿尔茨海默氏病（AD）不同，研究者发现PD风险与小胶质细胞或星形胶质细胞之间没有关联，这表明神经炎症在PD中的因果作用要小于AD。除了PD外，研究者发现SN

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：不二，编辑：夏甘草、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读抑郁症是一种常见的疾病，女性的发病率是男性的两倍。在这里，研究人员发现一类调控转录物-长非编码RNA（lncRNAs），约占抑郁症患者大脑中差异表达基因的三分之一，并显示出复杂的区域和性别特异性调控模式。研究人员揭示了灵长类特有的神经元富含的基因LINC00473，在抑郁女性而不是男性的前额叶皮层（PFC）中下调。利用病毒介导，在成年小鼠PFC神经元中表达LINC00473，研究人员仅在雌性小鼠中诱导应激恢复来重现人类性别特异性表型。这种性别特异性表型伴随着雌性小鼠的突触功能和基因表达的选择性改变，结合对培养的人类神经元样细胞的研究，表明LINC00473是CREB效应因子。总之，研究结果确定LINC00473是女性特有的应激恢复的驱动因素，在女性抑郁症中是异常的。论文ID原名：Sex-Specific

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：思越，编辑：夏甘草、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读鼻咽癌（NPC）是一种侵袭性恶性肿瘤，种族和地理分布极为不均。鼻咽癌中存在非常复杂的肿瘤微环境(TME)，靶向TME在NPC中标志着一种有前途的治疗方法。本研究首次从单细胞水平上系统全面地构建了鼻咽癌的肿瘤微环境图谱，鉴定了多种免疫细胞亚群，对鼻咽癌肿瘤细胞的异质性和免疫细胞的多样性进行了深入分析，鉴定了一系列与患者预后密切相关的分子特征及潜在的治疗靶点。该研究在单细胞水平上揭示了鼻咽癌的细胞异质性，为鼻咽癌的精准治疗奠定了新的基础。论文ID原名：Single-cell

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：思越，编辑：十九、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读SARS-CoV-2引起疾病的大流行，但关于SARS-CoV-2感染后的病毒行为和宿主反应的研究很少。作者通过深入分析SARS-CoV-2与其他呼吸道病毒的转录应答情况。SARS-CoV-2感染的细胞和动物模型，以及COVID-19患者的转录和血清谱分析，发现SARS-CoV-2对宿主的转录反应具有独特的表征，且病毒复制与免疫表达存在不平衡关系，表现在I型和III型干扰低的表达、趋化因子升高以及IL-6的高表达。论文ID原名：Imbalanced

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：艾奥里亚，编辑：十九、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读酗酒和长期接触酒精会导致酒精性肝病的发生(ALDS)。目前已有研究发现，ALDS和昼夜节律的紊乱之间存在潜在的联系，但不同酒精摄入模式如何对肝脏昼夜节律代谢产生不同的影响实际上仍未被探索。基于急性和慢性乙醇饲养，研究者揭示了肝脏中昼夜节律相关转录组的差异性重编程。具体地说，日常SREBP转录途径的重新连接导致乙酰辅酶A代谢中不同的肝脏信号，这些信号被翻译成蛋白质乙酰化的亚细胞模式。因此，不同的饮酒模式决定了肝脏昼夜节律代谢的不同代谢适应。论文ID原名：Distinct

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：杨峰，编辑：十九、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读几十年来，对癌症生物学的研究主要集中在蛋白质编码基因的参与上。直到最近才发现一大类分子，称为非编码RNAs

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：刘宁，编辑：十九、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读心血管疾病（CVD）是全球范围内最致命的疾病之一，在临床上具有显着疗效且几乎没有不良反应的中药已被越来越多地接受用于心血管疾病预治。复方丹参片是由丹参，三七和冰片组成的草药制剂，在临床上广泛用于治疗心绞痛，冠状动脉硬化并显着改善微循环。之前仅对复方丹参片的心脏保护作用的常规药理方面进行了研究，但是其作用机理仍然知之甚少，主要是因为多组分化合物的各种化学成分在其相应的治疗靶标中均表现出多样性。本研究利用转录组学和代谢组学联合，揭示在治疗高脂饮食喂养的小鼠中异丙肾上腺素诱发的心肌损伤中复方丹参片的作用机制。本研究发现了复方丹参片可以恢复心肌损伤造成的心血管疾病相关的基因的mRNA水平，同时代谢组学显示复方丹参片可以恢复心肌损伤造成的差异代谢物中的21种代谢物，涉及葡萄糖代谢，脂肪酸代谢和氨基酸代谢。本研究证明在研究中药作用机制中转录组和代谢组的重要价值，而挖掘出的差异基因和代谢物为进一步研究复方丹参片治疗心血管疾病的分子机制提供线索。论文ID原名：Transcriptomics

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：贤，编辑：十九、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读2型糖尿病（T2D）是一种长期代谢紊乱疾病，主要表现在高血糖和缺乏胰岛素。前期研究表明石斛属植物降糖效果显著，可以替代药物预防或治疗糖尿病，但其治疗的分子机制仍不清楚。本研究采用生物化学和转录组（RNA-Seq

点击蓝字↑↑↑“转录组”，轻松关注不迷路编译：刘宁，编辑：十九、江舜尧。原创微文，欢迎转发转载。导读黑色素瘤是一种恶性肿瘤，在全世界范围内发病率逐渐增加，但是对传统化疗和放疗具有耐药性。因此，迫切需要开发低毒性的新型药物来治疗黑色素瘤患者。黄荆是一种芳香灌木，在亚洲国家中广泛分布，也是一种重要的中药材，用于治疗各种疾病。其提取物EVn-50具有广泛的抗肿瘤活性，对结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌和乳腺癌效果显著。牡荆素Vitexin成分1（VB1）是EVn-50混合物中最丰富的牡荆素化合物，可以通过抑制AKT/FOXO3途径来抑制肝细胞癌生长和血管生成，通过抑制mTOR信号传导来抑制绒毛膜癌的生长，但是尚无关于VB1对黑色素瘤的影响的分子机制研究。在这项研究中，研究人员通过各种黑色素瘤细胞系和移植瘤小鼠模型证明VB1在体内和体外对黑色素瘤均具有抑制作用，阻止G2/M期的细胞周期诱导细胞凋亡。通过转录组分析发现这种作用是通过VB1可以影响多种黑色素瘤细胞系中的各种途径，包括p53，凋亡和细胞周期途径。VB1显着诱导ROS的积累从而导致DNA损伤。有趣的是，VB1也可以诱导对BRAF制剂维罗非尼耐药的黑色素瘤细胞中的ROS，导致DNA细胞毒性，从而导致G2/M期停滞和细胞凋亡。以上结果表明VB1可能是一种具有前景的药物用于治疗黑色素瘤。论文ID原名：Vitexin