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RNA提取实验常规样本采集(三) | RNA专题

联川生物 联川生物 2022-05-21

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编者按

不知不觉,我们的RNA提取专题已经过去了那么多期,小伙伴们觉得这些对你有没有帮助呢?我们总计13期的RNA专题马上就要暂时地告一段落了。小伙伴们还想获得什么干货呢?欢迎留言给我们呦~

现在先让我们回顾一下往期的精彩内容:

1. RNA提取的那些事

2. 困难组织的RNA提取总结 

3. RNA不稳定原因分析

4. 改善RNA提取质量的方法

5. RNA纯度和完整性鉴定 

6. 不同物种RNA质检图介绍 

7. RNA提取中28S断裂现象简要描述

8. RNA提取特殊案例介绍

9. 常规样本采集和RNAlater使用方法

10. RNA提取实验常规样本采集(一)

11. RNA提取实验常规样本采集(二)

前两期我们已经讲述了一些常规样本的采样。今天我们来说说体液、石蜡、细菌、真菌样本的采集。


1尿液、胆汁、腹腔引流液等体液的采集 

1、收集 5- 10ml 新鲜尿液、胆汁或者腹腔引流液,置于 4°C 或冰盒中正立放置

之后转移至 15- 50ml 锥形底的离心管中。

2、4°C ,1000 rpm ,离心10  min(去除细胞及碎片)。

3、小心转移上清到新的 15- 50ml 锥形底的离心管中(注意不要转移沉淀)。

4、4°C ,2500 rpm ,离心10 min( 去除残留的碎片及细菌细胞)。

5、转移上清至新的 2.0ml EP 管中,严格封口。

6、- 80°C长期保存。


注意:

脑脊液、尿液、乳汁、精浆、细胞上清等体液样本通常RNA含量极低,所以该类样本的送样原则:越多越好,最少不能少于20ml通过样本富集以达到RNA富集的目的。


2石蜡样本采集

石蜡包埋样本有2种准备方式:石蜡切片、石蜡中心组织块

1、石蜡切片:

RNA提取1次≤80um。

用石蜡切片机切成5-20um的切片,如用于miRNA实验,切片厚度≥10um。将石蜡切片转到螺纹冻存管,迅速浸入液氮中,冷冻>1h,之后转至-80℃长期保存。

2、石蜡中心组织块:

RNA提取1次需35mg样本。

取石蜡包埋样本中心组织块(不取暴露于空气中的组织截面部分)于螺纹冻存管中,迅速浸入液氮中,冷冻1>h,之后转至-80℃长期保存。


注意:

石蜡样本通常以石蜡切片为主,选取的切片必须是组织含量高的部分,至少提供5-10片10um厚度的切片。


3细菌样本采集 

一次反应所需细菌的量≤1 X 107

1、显微镜下观察细菌生长状态,收集对数期的细菌。

2、将适量体积的菌液转移至 2ml 旋盖尖底离心管 (RNase-free)中,于室温下 14000g 离心1min。

3、弃尽培养基,将细菌沉淀迅速置于液氮中冷冻>1h,然后转移至 -80℃或液氮中长期保存。

4、运输方式:干冰运输。


注意

不允许寄送有毒性、致病性的细菌,尽量以沉淀的形式寄送,勿以液体形式寄送,实验发现特别是菌类样本,菌沉淀的RNA抽提质量往往好于菌液。


4真菌样本采集 

一次反应所需真菌的量≤50mg

将真菌称重,分装多管;将称重后的真菌置于预冷的螺纹冻存管中,迅速投入液氮,速冻时间>1h,转入-80°C长期保存或用干冰直接寄出。


5Total RNA样品 

Total RNA一般长期保存于-80℃冰箱,若要寄送可直接使用干冰寄出,或加入适量保存液,再用干冰运输。

RNA的保存介质:

① RNA保存液(1/10体积3M NaAc,pH5.2, 3倍体积无水乙醇)。

② 3倍体积无水乙醇 。

③  Rnase-free水(送样量>15ul)。


注意:

(1)total RNA中应尽量避免多糖、蛋白、DNA等杂质的残留,送样时需注明溶剂成分

(2)total RNA应避免反复冻融,由于反复冻融所产生的剪切力会对RNA样品有破坏作用,所以在实际操作中,应对RNA样品小量分装。


好了,本期RNA提取专题小课堂就到这里了。

下期还有更多精彩内容等着你哦~

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