图说 | m6A功能及其在肿瘤中的作用(1)
The following article is from 珠江肿瘤 Author 孙月琴
背景介绍:
近几年关于mRNA的内部修饰(internal modification)的研究逐渐增多,包括N6甲基腺苷修饰(m6A)、N1甲基腺苷修饰(m1A)、甲基胞嘧啶修饰(m5C)、假尿苷修饰等。m6A作为mRNA中最常见的甲基化修饰,无论是mRNA还是lncRNA,都大量存在m6A修饰。关于m6A章节的图说我们将从”m6A的机制“、”m6A readers在RNA中的具体作用“、”m6A在癌症中作用“三部分来讲解,首先,小编将介绍”m6A的机制“。机制图如下:
m6A能够加速mRNA前体的加工时间,加快mRNA在细胞中的转运速度和出核速度,其主要发生在RRACH序列(其中R = A或G,H = A,C,或U),m6A这种甲基化修饰被证明是可逆化的,由甲基化转移酶(writer)、去甲基化酶(eraser)和甲基化阅读蛋白(reader)共同参与发挥作用。根据上图将依次介绍每一个分类及其功能。
m6A writer(甲基化转移酶)
m6A writer主要作用就是催化mRNA上腺苷酸发生m6A修饰。这些蛋白并不是各自孤立的,而是会形成复合物(complex)共同行使催化功能。如图所示,包括:METTL3、METTL14、METTL16、RBM15、VIRMA、WTAP、ZC3H13等。
METTL14与METTL3形成稳定的复合物,在底物识别中起关键作用;
WTAP确保METTL3-METTL14异二聚体定位在核斑点上并促进催化活性;
RNA结合基序15(RBM15)结合m6A复合物并将其募集到特殊的RNA部位;
ZC3H13通过将WTAP桥接至mRNA结合因子Nito增强m6A;
VIRMA通过募集MTC来调节区域选择性甲基化,在3'UTR和接近终止密码子中指导m6A;
METTL16是新发现的writer,可催化U6-snRNA中的m6A修饰并参与RNA前期剪接。
m6A eraser(去甲基化酶)
m6A eraser主要作用是对已发生m6A修饰的碱基进行去甲基化修饰。如图所示,包括:FTO和ALKHB5等。
FTO通过抑制剪接位点的SRSF2结合来控制mRNA剪接、通过增加促成脂肪的RUNX1T1-S同工型的相对表达来调节成脂,还通过降低细胞周期蛋白A2和细胞周期蛋白依赖性激酶2的m6A水平来阻断YTHDF2介导的mRNA降解,从而促进脂肪细胞周期进程和脂肪形成。
ALKHB5介导的m6A去甲基化则主要是涉及到长3'-UTR mRNA的剪接和产生。
m6A reader(甲基化阅读蛋白)
m6A reader主要功能是识别发生m6A修饰的碱基,从而激活下游的调控通路如RNA加工,包括翻译,剪接,输出,降解和microRNA加工等。即发生m6A修饰的mRNA想要行使特定的生物学功能,则需要这种特定的RNA结合蛋白,也叫reader。如图所示,包括:EIF3、HNRNPA2B1、HNRNPC、IGF2BPs、YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3。图中每一个reader所介导的主要作用已整理于如下表格:
EIF3 | enhances mRNA translation(增强mRNA翻译) |
HNRNPA2B1 | mediates mRNA splicing and primary microRNA processing(调节mRNA剪接和主要microRNA加工) |
HNRNPC | mediates mRNA splicing(调节mRNA剪接) |
IGF2BPs | enhances mRNA stability and storage(增强mRNA的稳定性和储存能力) |
YTHDC1 | enhances the translation of target RNA and reduces the abundance of target RNA (增强靶RNA的翻译并降低靶RNA的丰度) |
YTHDC2 | enhances the translation of target RNA and reduces the abundance of target RNA (增强靶RNA的翻译并降低靶RNA的丰度) |
YTHDF1 | enhances mRNA translation(增强mRNA翻译) |
YTHDF2 | promotes mRNA degradation(促进mRNA降解) |
YTHDF3 | enhances translation and degradation by interacting with YTHDF1 and YTHDF2 (通过与YTHDF1和YTHDF2相互作用增强翻译和降解) |
总结:
表观遗传学已成为科研时下热门话题,虽然对于m6A的研究越来越多,但是我们对此的了解还远远不够。下一次让我们一起来学习m6A readers在RNA中如何具体发挥它的作用吧。
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