全景 | 这就是华大质谱,技术升级还送福利!
提起华大质谱,
不少老师好像发现了新大陆,
啊,原来华大还有质谱? !
今天,科技君就为大家好好介绍
华大产品/平台队列里的“宝藏男孩”
——华大质谱
重点是,在各位老师
埋头科研、苦心求索的时间里,
华大质谱又实现了
两大激动人心的升级!
现在,科技君就和您分享这些成果。
(文末有福利!)
关于华大质谱
发展历程
华大质谱平台经过十余年的建设和发展,已建成基于质谱检测技术为基础的高质量科研及科技服务平台。截至2019年2月,华大质谱平台在蛋白质组学和代谢组学领域发表85篇研究论文,累计影响因子达432。
华大质谱平台发文数量逐年上升
华大质谱平台始终聚焦于组学研究成果和技术的应用,开发了一系列的医学检验技术,如新生儿遗传代谢病检测、母乳营养检测等;始终积极从事蛋白质组学和代谢组学的商业服务,为海内外超450家单位提供服务。
仪器配置
目前,华大质谱平台拥有包括Orbitrap Fusion Lumos、Q Exactive HF-X、QTRAP 6500+、Triple TOF 5600+、Xevo G2-XS QTOF等在内的几十台质谱仪,辅助以高效样本制备平台和分子分离平台,能实现工业规模和科研层次的蛋白质组学、代谢组学研究及目标分子检测。
专业资质
华大质谱平台从建立初期就非常重视质量的标准化管理,获得过ISO9001、ISO14001、OHSAS18001三标一体认证,通过了CNAS 17025质量管理体系及ISO27001信息安全质量管理体系认可,标准化管理能力处于行业领先水平。
生物信息分析平台
华大质谱平台拥有多名具有丰富的设计与开发经验的生物信息专业技术与分析人员,主要负责大规模蛋白质组学、代谢组学数据的处理、分析与深层开发。
依托高性能计算平台,应用蛋白质组分析专业软件Mascot、MaxQuant、ProteinPilot、Proteome Discoverer、Spectronaut X™等,以及质谱平台自主开发的多种数据分析软件系统,从UniProt、Swiss-Prot、TrEMBL、NCBI等数据库中进行蛋白的序列分析、蛋白结构分析、蛋白注释、生物学通路等分析。
在代谢方面,采用代谢组专业处理软件Progenesis QI进行谱图提峰,然后采用华大自主研发的MetaX进行后续数据分析。多软件、多平台、多数据库的结合,为质谱平台大量的数据产出、处理和分析提供技术支持。
两大技术升级
蛋白磷酸化
3项突破,一站式定量
速度更快!标记定量,10个样本同时上机
蛋白翻译后修饰(PTM),是指在蛋白质的氨基酸侧链上共价结合化学小分子基团。大多数真核生物所表达的蛋白质,都需要经过一系列的翻译后修饰,才能形成复杂的功能执行体。在所有的蛋白翻译后修饰中,磷酸化修饰是最为常见的一种修饰方式。它参与几乎所有的生物学过程。
磷酸化修饰的分析可应用于动物、植物、微生物等各个研究领域,研究细胞的增殖、发育、分化、凋亡,细胞骨架调控、神经活动、肌肉收缩、新陈代谢及肿瘤发生、生物的细胞功能中生物“开/关”作用机制等。
磷酸化修饰分析的应用范围举例
磷酸化蛋白iTRAQ是一种磷酸化蛋白标记定量技术,它应用iTRAQ试剂,对酶解后的肽段进行标记,经过TiO2肽富集后进行质谱检测,从而实现磷酸化蛋白的鉴定及相对定量。
而这一次,华大质谱升级的内容,是将IBT标记试剂正式加入磷酸化标记定量的行列。
IBT标记试剂,是华大自主研发的一款10标试剂,它的加入,让磷酸化蛋白标记定量样本数从8增加到10,也就是说,同时上机样本数更多了,速度更快,效率更高,而鉴定定量还是同样高!
这么说吧,以后在磷酸化蛋白标记定量研究中,不用再“纠结”磷酸化iTRAQ 8个样本数的限制,10个样本一起来吧!
磷酸化蛋白iTRAQ/IBT定量技术流程
注:IBT研发文献已于2018年9月发表于《Analytical chemistry》(IF:6.042),点击左下角“阅读原文”或复制以下地址到浏览器打开即可查阅:
https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/abs/10.1021/acs.analchem.8b00321
质量更高!一次实验鉴定位点10000+
第二个突破是,华大质谱引入了高质量平台——Orbitrap Fusion Lumos。这个“大块头”就像它的外表一样“猛”:有CID、ETD、HCD等多重碎裂模式可选,能采集到更多、更丰富的二级谱图,在超高灵敏度和分辨率的帮助下,一次磷酸化定量实验,最高可以鉴定10000+个蛋白修饰位点。
高质量质谱平台Orbitrap Fusion Lumos
信息更丰富!可信度更高
此外,磷酸化PRM也已蓄势待发。PRM(parallel reaction monitoring,平行反应监测技术),是通过串联质谱,有目的地筛选目标蛋白肽段,进行定量的靶向蛋白质组研究策略之一。它经常被应用于以下几个方面的研究:
1.人类疾病相关信号转导靶标磷酸化蛋白研究;
2.动植物抗病抗逆机制;
3.疾病标志物筛选;
4.药物作用靶点;
5.同源磷酸化蛋白或突变磷酸化蛋白研究。
磷酸化PRM通过液质联用(LC-MS/MS)的方式,对感兴趣的磷酸化修饰蛋白进行定量验证。在PRM模式下,一个母离子产生的所有碎片离子全部得到扫描,二级质谱信息就这样“一网打尽”啦——要的就是丰富、完整!
这些信息再用于二次鉴定、RT确认,可信度极高,定量哪些目标磷酸化蛋白,完全可以自己说了算!
目标磷酸化蛋白PRM定量技术流程
科技君来总结下,从磷酸化iTRAQ磷酸化IBT,到磷酸化PRM,华大质谱的磷酸化产品覆盖到鉴定、定量、验证的全部环节,为您提供磷酸化蛋白修饰的一站式解决方案。
靶向代谢组
检测列表又扩充啦!
第二个大的升级在靶向代谢组。这次,华大质谱的靶向代谢组学又迎来了三位“新朋友”——10种维生素、13种类固醇激素、38种氨基酸,它们都可以实现定量检测了!
在高质量平台的检测流程下,每run一次,可以检测几十种同类型的小分子。以氨基酸为例,一次实验,38种氨基酸全部检测完成,实现绝对定量。这,就是高通量、高精度的优势。
靶向代谢组学研究流程
目前,华大质谱已经完成每一个小分子transitions的方法建立,在代谢物鉴定、定量时,可以直接取用。这样,整个项目的周期大大缩短,最低10个工作日,就能完成一个靶向定量项目。
维生素、类固醇激素、氨基酸检测列表
(点击上下滑动查看)
科技君来总结下,从维生素、动物激素,到氨基酸,华大质谱完成了这些代谢物的同步定量检测,靶向代谢组学检测列表又得到扩充。
最新福利
春光烂漫,正好出发
华大质谱产品强势集结
直接给您:
1. 高质量结果
磷酸化鉴定、定量到验证,
一站式解决方案已配齐。
一次实验,
最高可鉴定10000+蛋白修饰位点。
2. 优质服务体验
靶向代谢物同步定量检测,
同类代谢物一次检测完成,
最快10个工作日即可完成,
超“快”的交付体验!
3. 限时福利
即日起至 2019年6月1日,
免费赠送磷酸化PRM方法建立环节!
更多优惠,
欢迎详询当地销售!
撰稿:秦兴通
编辑:市场部
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