【2023世和学术盘点】免疫、靶向、放化疗：NGS助力肿瘤全程管理
导语
近年来，肿瘤精准诊疗的概念不断“微观化”，伴随着生物信息学与测序技术的交叉融合，基因检测越来越广泛地应用于临床各个领域。高通量测序（Next Generation Sequencing，NGS）作为一项颠覆性分子诊断技术，凭借通量大、覆盖面广、敏感性高等优势，将精准医学推向了新的高度，在肿瘤全程管理中展现出越来越广阔的应用前景。作为国内肿瘤NGS技术领跑者，世和基因携手临床专家，在肿瘤精准医学领域取得了诸多学术突破。本文将分别从免疫治疗、靶向治疗和放化疗三个方面，对世和基因2023年的重要学术成果进行盘点。
PART 01
NGS助力精准免疫治疗
1.1 局晚期食管鳞癌新策略：PD-1单抗联合放化疗及疗效生物标志物
标题：Toripalimab combined with definitive chemoradiotherapy in locally advanced oesophageal squamous cell carcinoma (EC-CRT-001): a single-arm, phase 2 trial （The Lancet Oncology，51.1）
研究亮点：
① II期前瞻性单臂临床研究首次证实PD-1抗体联合根治性放化疗在局晚期食管鳞癌中的疗效和安全性。该研究有望改变临床实践，为此类患者提供新的治疗选择。
② 结合基因变异和免疫微环境多层面，研究揭示了局晚期食管鳞癌免疫联合放化疗潜在疗效生物标志物。详情>>
1.2 TMB及克隆分析揭示食管癌免疫新辅助治疗获益新方向
标题：Neoadjuvant sintilimab and chemotherapy in patients with potentially resectable oesophageal squamous cell carcinoma (KEEP-G 03): an open-label, single-arm, phase 2 trial （Journal for ImmunoTherapy of Cancer，10.9）
研究亮点：
① II期临床研究证实免疫联合化疗新辅在II-IVA期可切除ESCC患者中具有良好的抗肿瘤疗效和安全性。
② 研究证实了NGS检测生物标志物，包括肿瘤突变负荷、主克隆性突变、驱动基因变异、ctDNA，在食管癌新辅助免疫治疗中的预测价值。详情>>
1.3 多组学技术揭示晚期NSCLC肝转移灶疗效差异机制
标题：Immune suppressive microenvironment in liver metastases contributes to organ-specific response of immunotherapy in advanced non-small cell lung cancer（Journal for ImmunoTherapy of Cancer，10.9）
研究亮点：
① 配对比较非小细胞肺癌（NSCLC）肺原发灶和肝转移灶的免疫治疗疗效差异及其机制。
② 通过WES、RNAseq、单细胞测序和mIHC多组学检测技术可满足多种场景下的临床基础研究需求，有助于解决临床难题，为更多的患者带来福音。详情>>
1.4 EGFR TKI耐药非小细胞肺癌免疫治疗新思路及疗效生物标志物探究
标题：Tislelizumab plus chemotherapy for patients with EGFR-mutated nonsquamous non-small cell lung cancer who progressed on EGFR tyrosine kinase inhibitor therapy（Journal for ImmunoTherapy of Cancer，10.9）
研究亮点：
① EGFR TKI靶向治疗失败后，替雷利珠单抗联合化疗方案表现出较好的疗效和可耐受的安全性。
② 液体活检技术揭示了与临床疗效相关的生物标志物，为患者精准治疗助力。
1.5 HER2非ex20ins突变可能是非小细胞肺癌免疫治疗正向预测因子
标题：Genomic and immune characteristics of HER2 mutated Non-small cell lung cancer and response to immune checkpoint inhibitor-based Therapy (Molecular Oncology, 6.6)
研究亮点：
① 研究进一步证实HER2突变NSCLC具有高度的分子异质性。
② 研究发现HER2不同突变亚型对免疫治疗响应不同，其中非ex20ins突变可能是免疫治疗的正向预测因子。详情>>
PART 02
NGS助力精准靶向治疗
2.1 NGS结合类器官药敏试验准确预测肺癌患者临床疗效
标题：Using patient-derived organoids to predict locally advanced or metastatic lung cancer tumor response: a real-world study (Cell Reports Medicine, 14.3)
研究亮点：
① 通过NGS检测证明类器官样本与同源肿瘤组织样本的基因组测序结果具有较好的一致性。
② NGS联合类器官药敏试验可准确预测晚期肺癌患者抗肿瘤治疗临床疗效。详情>>
2.2 NGS揭示EGFR-SEPT14融合是TKI新型耐药机制
标题：A novel acquired EGFR-SEPT14 fusion confers differential drug resistance to EGFR inhibitors in lung adenocarcinoma (Genes & Disease, 6.8)
研究亮点：
① NGS在罕见变异类型的检出上具有明显优势，同时动态监测有助于确定患者耐药机制，找到更适合的治疗方案。详情>>
2.3 NGS揭示胃癌曲妥珠单抗耐药机制及克隆进化
标题：Exploring potential molecular resistance and clonal evolution in advanced HER2-positive gastric cancer under trastuzumab therapy (Oncogenesis, 6.2)
研究亮点：
① 研究基于治疗前后组织样本的全面基因组分析发现，晚期HER2阳性胃癌患者曲妥珠单抗原发耐药与获得性耐药潜在标志物。
② 研究进一步提出克隆进化分支模式与疾病进展存在一定相关性，广泛分支进化模式，PFS更短。详情>>
2.4 NGS揭示罕见ALK V1180L伴SCLC转化双重耐药机制
标题：Transformation of NSCLC to SCLC harboring EML4–ALK fusion with V1180L mutation after alectinib resistance and response to lorlatinib: A case report and literature review (Lung Cancer, 5.3)
研究亮点：
① 研究首次描述了一名出现ALK融合伴有V1180L突变的NSCLC转化为SCLC的患者，经历了对阿来替尼治疗产生耐药后，可以从lorlatinib治疗获益。
② NGS检测有可能在肺癌病理类型转化后为患者寻找新的用药方案。详情>>
PART 03
NGS助力精准放化疗
3.1 NGS揭示直肠癌新辅放化疗预后/预测标志物
标题：Genomic features, evolutionary patterns, and minimal residual disease at surgical margins as novel prognostic/predictive biomarkers in locally advanced rectal cancer (Clinical and translational medicine，10.6)
研究亮点：
① nCRT治疗前基线组织中的KRAS突变和MYC扩增是nCRT预后更差的独立预测标志物，而增加放疗剂量可提升该部分人群的nCRT疗效；
② 基于NGS评估的手术切缘状态和nCRT诱导的肿瘤进化模式与nCRT疗效、术后复发风险相关。详情>>
3.2 NGS揭示食管鳞癌新辅放化疗预测标志物
标题：Genomic and transcriptomic remodelling by neoadjuvant chemoradiotherapy (nCRT) and indicative role of acquired INDEL percentage for nCRT efficacy in esophageal squamous cell carcinoma (International Journal of Radiation Oncology · Biology · Physics, 7)
研究亮点：
① 研究描绘了新辅放化疗诱导的基因变异图谱和转录图谱变化，并证明了获得性插入缺失百分比可以作为疗效生物标志物，为食管鳞癌的个体化诊疗提供了潜在治疗靶点和新型生物标志物。详情>>
结语
世和基因专注于肿瘤精准医疗和临床转化研究，拥有全球领先的检测技术。经过多年的科研深耕，公司核心技术团队参与发表SCI论文超600篇，总影响因子超4400分，近210项研究成果登上国际舞台，受到业界相关领域专家广泛关注和引用。我们期待携手更多临床专家开展全方位科研合作探索，将技术与临床深度结合，不断为肿瘤患者精准治疗探索新方法。
作者：郭郭 审核：胖胖的鹏 排版：Moro
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NGS及液体活检实验室获CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证，249次通过国家卫健委临检中心室间质评
公司核心技术人员参与发表以及公司参与临床研究项目发表SCI论文超590篇，总影响因子(IF)超4400分；2020年度江苏省科学技术二等奖：“肺癌精准医学高通量测序检测技术的创新与产业化”项目；拥有发明专利57项（其中境内54项）
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基于ATG-Seq等液体活检技术的CALIBRATE系列多癌种围术期大型临床研究成果相继发表。2021年5月，前瞻性多中心早中期肠癌术后ctDNA MRD大型临床研究（CALIBRATE-CRC）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2021年9月，液体活检预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究（CALIBRATE-RC-nCRT）成果发表于PLoS Med（IF=15.8）；2021年11月，前瞻性早中期肺癌术后ctDNA MRD大型临床研究（CALIBRATE-NSCLC）成果发表于Nature Comms（IF=16.6）；2022年5月，ctDNA预测局晚期NSCLC精准放化疗疗效大型临床研究（CALIBRATE-LC/EC-CRT）成果发表于Mol Cancer（IF=37.3）；2022年10月，前瞻性早中期肺癌术后MRD ctDNA克隆分析大型研究（CALIBRATE-LuCaTH）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2023年10月，前瞻性早中期胃癌MRD队列研究（CALIBRATE-GC）成果发表于Cancer Commun（IF=16.2）。此外，世和正将MERCURY技术应用于多项MRD研究。2022年10月，基于MERCURY多组学技术预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究（M-CALIBRATE-RC-nCRT）成果发表于Clin Chem（IF=9.2）；2023年5月，基于MERCURY多组学技术预测NSCLC术后复发风险的前瞻性大型临床研究（M-CALIBRATE-LuCaTH）成果发表于Cancer Res Comms
基于MERCURY多组学液体活检技术的DECIPHER系列多癌种早筛研究成果相继发表。2021年10月，大型肠癌早筛临床研究（DECIPHER-Colon）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2021年12月，大型肝癌早筛临床研究（DECIPHER-Liver）成果发表于Hepatology（IF=13.5）；2022年6月，国内首个大型泛癌种早筛研究（DECIPHER-Multi）成果发表于Mol Cancer（IF=37.3）；2022年6月，国内首个基于cfDNA Motif特征的肺癌早筛大型临床研究（DECIPHER-Lung）成果发表于eBioMedicine（IF=11.1）；2022年11月，大型肺癌早筛临床研究（DECIPHER-Lung 2）成果发表于Am J Respir Crit Care Med（IF=24.7）
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