（文章篇）S5E52：比五环更火的还有此环~

昨天基金项目终于可以在各大网站上查询了。（基金篇）S5E51：环状RNA基金大爆发，这是要上天吗？小张昨天梳理了一下今年命中的环状RNA本子，其中面上、青年几乎各占一半，说明很多老师在早些年就已经关注到了这个领域，另一部分老师也敏锐地嗅到环状RNA这个方向。

其实，从去年开始，小张聊科研就已经密切关注着环状RNA（circRNA）这个方向，各种文章、评论纷至沓来，当然就明确知道今年circRNA的项目大幅提升是必然结果。

点击查看往期关于环状RNA的文章：

（文章篇）一石双鸟：一个环状RNA circ-Foxo3，两篇paper（上）

今天我们依然来看一篇circRNA的文章吧。

Inducible RasGEF1B circular RNA is a positive regulator of ICAM-1 in the TLR4/LPS pathway （RNA Biology ）

TLR4/LPS、NF-kB是炎症相关通路，涉及到内毒素LPS以及Toll - 4受体（TLR4）蛋白，是生物体内炎症反应的重要通路。LPS可以与巨噬细胞表面上的TLR4结合，引起自噬反应的发生，从而利于巨噬细胞对生物体内病原体的吞噬。

作者发现了一个环状RNA：mcircRasGEF1B，主要定位于细胞质，有细胞特异性表达特征。敲除该circRNA能降低LPS诱导的ICAM-1的表达，且能调控ICAM-1的成熟mRNA的稳定性。

作者的逻辑思路：

1、确定LPS诱导的circRNAs

跟一般lncRNA研究类似，就是先筛分子

通过小鼠巨噬细胞的RNA测序的数据库，确定了1916个circRNAs。然后在LPS刺激下，发现LPS能诱导mcircRasGEF1B表达。

小鼠RasGEF1B基因包含了14个外显子。mcircRasGEF1B是有2-4号外显子形成。

并且发现mcircRasGEF1B和线性mlinRasGEF1B与LPS刺激成一定关系。

mcircRasGEF1B的表达对BF-kB成依赖关系。

2、TLR介导mcircRasGEF1B表达，mcircRasGEF1B的表达有细胞特异性特征，且进化保守

3、定位与无编码能力鉴定

4、mcircRasGEF1B调控ICAM-1的表达

实验发现，mcircRasGEF1B调控ICAM-1的mRNA水平和蛋白水平。这部分内容，跟研究lncRNA也类似。下游靶蛋白表达变化会从转录、翻译及翻译后过程进行分析验证。

最后验证了原来mcircRasGEF1B调控了ICAM-1转录过程。

鉴于相关的文章还不是很多，另外，关于基金还有很重要一点是基于前期工作基础的持续性研究，不一定是热点就能抓住的。

That's all. Thank you!

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