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离开了我,生信技能树照样茁壮成长!(下)

2017-08-05 jimmy 生信技能树

大家好,我是生信菜鸟团团长jimmy,是大家的老朋友啦~

和一群志同道合的小朋友组成了这个生信联盟,目前顺利进行的就是生信技能树论坛,和这个同名公众号。

论坛毕竟是过气的互联网产品,所以直到目前还是内测阶段,没有允许杂七杂八的人在上面乱发帖水帖。

公众号呢,也错过了红利期,发展的尤为艰难。不过也算是成长为了万人大号,在这里感谢所有支持我的粉丝。


熟悉我的人,都知道我几乎分享了自己这3年来生信摸索过程中的所有笔记,包括五百多篇博客笔记和一千多篇论坛笔记,点击阅读原文直达,或者搜索生信技能树,生信菜鸟团等关键词。(搜索)

但是公众号呢,不能总是吃老本,而且如果仅仅是我一个人的笔记,内容略显单薄,对新手帮助有限,我们希望建立一个更完整更为完善的生信入门知识库,全面而系统的帮助所有想成为生信工程师的朋友。

在这个理念下,我们组建成了这个团队,以公众号为主要门户来给粉丝分享干货。团队成员不止一次抱怨过我不善于管理,一年多了大家都是若即若离,导致大家看到的教程仍然还是我一家之言(这半年来看到的公众号推文几乎都是我本人写的)。 其中原因有很多,当然主要责任在我,我本人的确可以也很擅长安排自己的时间,在不影响自己正事的前提下做好笔记和分享,但这样只能说是一个好榜样,并不是好的带团队的做法。


昨晚仓促发出的帖子让大家误会了,以为我要离开生信技能树团队,其实是上半个月,我出去旅行啦!而且没有带电脑,这意味着我无法写推文了。也不能上论坛回复帖子,或者分享新的笔记。

但是这段时间论坛和公众号都发展的非常好,非常感谢我们这个团队。也让我看到了大家的潜力,我会认真反思一下自己的角色。


首先感谢罗登同学的亚马逊云教程系列:


亚马逊云教程1:云是什么,创建并连接EC2

亚马逊云教程2:新建用户,sudo权限,安装软件

亚马逊云教程3:文件传输,扩大存储,S3,快速输入命令

亚马逊云教程4:安装Anaconda,多python环境,运行jupyter notebook

亚马逊云教程5:安装TensorFlow,运行MNIST


同时值得一提的是这一系列教程都是(思考问题的熊)编辑到微信公众号的,这个活不轻松,去年我申请公众号的时候本意是把博客内容搬迁到公众号发布,编辑了三五个就不了了之了,非常的耗费时间。特别感谢两位同学。


然后感谢徐洲更同学的NGS数据处理实例干货笔记系列:


如何快速入门生物信息学

如何得到贵人相助

生信工作咨询速递-民以食为天,生信大法好


(伪)从零开始学转录组(1):软件安装

(伪)从零开始学转录组(2):读文章拿到测序数据

(伪)从零开始学转录组(3):了解fastq的测序质量

(伪)从零开始学转录组(4):了解参考基因组及基因注释

(伪)从零开始学转录组(5) 序列比对

(伪)从零开始学转录组(6):read计数

(伪)从零开始学转录组(7):差异基因表达分析

 (伪)从零开始学转录组(8):富集分析


这半个月,洲更同学以一己之力撑起来生物信息学的3大公众号(还有生信媛和Y叔),我非常欣赏。(他发布的这些推文里面有另外两个公众号的链接,大家可以点击阅读并关注)


尤其值得顶起来的是果子同学的传奇干货,带来了一天增粉300的效果。

数据库一网打尽:不会编程又怎样,还不照样拿课题发文章!

相信如果这样的推文发在其它大公众号,效果肯定更出色。


接下来是panda姐的转录组笔记,panda姐是生信技能树联盟的骨干成员啦:

【PPT】文献报告-A survey of best practices for RNA-seq data analysis

PANDA姐的转录组入门(1):计算机资源的准备

PANDA姐的转录组入门(2):读文章拿到测序数据

PANDA姐的转录组入门(3):了解fastq测序数据

PANDA姐的转录组入门(4):了解参考基因组及基因注释

PANDA姐的转录组入门(5):序列比对

PANDA姐的转录组入门(6):reads计数

而且她把这些笔记做成了PDF笔记,方便查看后台回复“合辑”即可获得。


还有吃瓜群众coco的公众号技巧系列:

我的小青涩搭讪 (还刻意加上了一个爱情故事)

这个故事效果非常好,本意是告诉大家如何置顶我们的公众号,这样就可以收到我们的干货分享了,但意外的是当天的广告收入就是两百多,如果能一直保持,就不需要大家打赏了,可惜~~~

没有赞赏,广告也没有人看 (看看吧)


看历史记录麻烦,号内搜索送给你! (中规中矩,但是很实用)

大家看到的我们公众号推文一切不是md排版的,都是由吃瓜群众操刀,各种图文混搭,越来熟练了。coco同学目前处于初学者阶段,值得鼓励和关注。


接下来是技能树的各个小编的投稿:


治国(知乎ID:青山屋主)投稿是最多了,同时也是转录组学习小组里面为数不多的几个真正认真学下去的,他的笔记如下:

高通量数据下载还能这样操作?

谁能告诉我,这数据测毁了么?

如何下载注释文件并查看基因结构

然后是课程推荐系列负责人五毛

污力导读:伯克利大学遗传统计课程

五毛的分子生物学基础知识

画风略微清奇。

还有卢同学的处女作:

使用IGV看序列比对情况

以及林行众同学的二次投稿:

如何选择聚类模块数目 (曲高和寡)


最后,还有几个跟生物信息学无关的冷笑话,阅读量比我们的正规教程好多了,都是由我的某个大学同学投稿,等凑齐5个了,有彩蛋。

女朋友重要吗?

最佩服你男朋友哪一点?

点开会有惊喜

不知道高考志愿怎么填怎么办?


额外值得一提的是写了那个爱情故事的coco同学同时还在带领一帮小朋友学习R语言:

将军笔记之基本统计

将军笔记之绘图将军之高级数据管理

将军笔记之图形初阶

将军笔记之创建数据集



最后,因为公众号每天的推文限制,还有很多也很有效的教程积累在论坛里面,在这里表扬一下前10名,谢谢大家。(点击阅读原文直达)

目前很多公众号都陷入了原创乏力怪圈,但是我们不同,我们生物信息学是一个非常年轻,充满活力的学科,技术。仅仅是我一个人就可以维持一天一篇原创技术教程,更别说我们这个一百多人的生信联盟啦。


但是这种零散的知识分享并不是我们的终极目标,最多3个月,我们的论坛笔记就会编辑成书,肯定不会让大家失望的。

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