生信分析平台搭建（二十）：常见问题
编者按
手把手教你生物信息分析平台搭建系列专栏到这里就全部结束了，可能一次很难照着文章完成所有的操作，这很正常，需要多操作几次。由于每个人的情况都不同，可能会出现各种各样的问题，不过不要害怕，每解决一个问题，技能就提升一步。
接前面：
二十五：基本配置
1、virtualbox无法安装成功
这个一般计算机设备不会有太大问题，首先要确保系统版本为64位，其次，CPU开启虚拟化，这样基本上就可以了。
2、共享文件夹设置不成功
虚拟机很多 46 32308 46 15045 0 0 3445 0 0:00:09 0:00:04 0:00:05 3446功能严重依赖virtualbox tools增强功能，在使用共享粘贴板，共享文件夹的时候，首先需要确保增强工具安装成功。
另外，设置完共享文件夹之后，默认只有root账户可以使用，如果想让更多账户使用共享文件夹功能，需要将用户添加到vboxsf组中。
3、gnome桌面安装不成功
gnome桌面安装完成之后，如果没有设置自动启动gdm3，就需要在登录界面进行选择。
4、逻辑错误
Linux命令行界面下，严格区分大小写，在使用一些命令时，需要区分大小写，否则会提示找不到一些命令。
5、软件编译错误
有可能是虚拟机中资源不足，比如cpu和内存不足，导致无法编译成功，这个其实也很常见，有些软件编译的时候非常消耗资源，会将CPU占满，甚至需要编译几个小时，对资源的消耗是非常大的，这种问题常常会提示类似于 program will not fit into available memory等错误。这种问题就需要想办法补充资源，或者终止一些消耗大内存的程序，释放一些内存。或者切换到文本界面。
6、安装软件缺少依赖
第一个就是最常见的缺少依赖，这个一般会提示缺少某些文件，比如前面我们在安装bwa的时候，提示缺少zlib.h，这个时候我们就需要找到哪个软件中提供了zlib.h，原来zlib.h来自于zlib库，所以，使用yum安装zlib就可以解决了这个问题；在安装circos的时候，提示缺少很多perl模块，将这些perl模块一个个安装上即可。
第二个原因是，提示缺少依赖，但是这个依赖的软件已经安装了，这是因为没有在系统路径下，无法找到。这个问题其实也很常见，尤其是作为普通用户安装软件时常常出现这种错误，因为root用户安装的软件，都会安装到usr等系统目录，类似这种错误就需要使用export将这些软件添加到bashrc中，例如export PERL5LIB，export R_LIBS，export LD_LIBRARY_PATH等；
7、如何解决错误
首先，一般系统错误会有提示，例如提示缺少某些东西。
error： zlib.h:no such file or directory
如果看不懂错误提示，可以使用google进行搜索，几乎所有的程序问题google都能搜索到解决方案，但是有时候google无法访问，所以需要学会科学上网，或者尝试使用bing搜索，总之不管如何，
搜索一下，error： zlib.h:no such file or directory
mp_get_memory_functions.c:1:17: fatal error: gmp.h: No such file or director
apt install -y vim
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