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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第13章(上) Python建模库介绍

SeanCheney Python爱好者社区 2019-04-07

作者:SeanCheney   Python爱好者社区专栏作者

简书专栏:https://www.jianshu.com/u/130f76596b02


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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第1章 准备工作

【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第2章(上)Python语法基础,IPython和Jupyter

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第3章(上)Python的数据结构、函数和文件

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第4章(上)NumPy基础:数组和矢量计算

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第5章(上)pandas入门

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第6章(上) 数据加载、存储与文件格式

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第7章(上)数据清洗和准备

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第8章(上) 数据规整:聚合、合并和重塑

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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第9章(上) 绘图和可视化

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  【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(上) pandas高级应用

  【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(中) pandas高级应用

  【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(下) pandas高级应用


本书中,我已经介绍了Python数据分析的编程基础。因为数据分析师和科学家总是在数据规整和准备上花费大量时间,这本书的重点在于掌握这些功能。


开发模型选用什么库取决于应用本身。许多统计问题可以用简单方法解决,比如普通的最小二乘回归,其它问题可能需要复杂的机器学习方法。幸运的是,Python已经成为了运用这些分析方法的语言之一,因此读完此书,你可以探索许多工具。

本章中,我会回顾一些pandas的特点,在你胶着于pandas数据规整和模型拟合和评分时,它们可能派上用场。然后我会简短介绍两个流行的建模工具,statsmodels和scikit-learn。这二者每个都值得再写一本书,我就不做全面的介绍,而是建议你学习两个项目的线上文档和其它基于Python的数据科学、统计和机器学习的书籍。


13.1 pandas与模型代码的接口


模型开发的通常工作流是使用pandas进行数据加载和清洗,然后切换到建模库进行建模。开发模型的重要一环是机器学习中的“特征工程”。它可以描述从原始数据集中提取信息的任何数据转换或分析,这些数据集可能在建模中有用。本书中学习的数据聚合和GroupBy工具常用于特征工程中。


优秀的特征工程超出了本书的范围,我会尽量直白地介绍一些用于数据操作和建模切换的方法。


pandas与其它分析库通常是靠NumPy的数组联系起来的。将DataFrame转换为NumPy数组,可以使用.values属性:

In [10]: import pandas as pd In [11]: import numpy as np In [12]: data = pd.DataFrame({   ....:     'x0': [1, 2, 3, 4, 5],   ....:     'x1': [0.01, -0.01, 0.25, -4.1, 0.],   ....:     'y': [-1.5, 0., 3.6, 1.3, -2.]}) In [13]: data Out[13]:   x0    x1    y 0   1  0.01 -1.5 1   2 -0.01  0.0 2   3  0.25  3.6 3   4 -4.10  1.3 4   5  0.00 -2.0 In [14]: data.columns Out[14]: Index(['x0', 'x1', 'y'], dtype='object') In [15]: data.values Out[15]: array([[ 1.  ,  0.01, -1.5 ],       [ 2.  , -0.01,  0.  ],       [ 3.  ,  0.25,  3.6 ],       [ 4.  , -4.1 ,  1.3 ],       [ 5.  ,  0.  , -2.  ]])

要转换回DataFrame,可以传递一个二维ndarray,可带有列名:

In [16]: df2 = pd.DataFrame(data.values, columns=['one', 'two', 'three']) In [17]: df2 Out[17]:   one   two  three 0  1.0  0.01   -1.5 1  2.0 -0.01    0.0 2  3.0  0.25    3.6 3  4.0 -4.10    1.3 4  5.0  0.00   -2.0

笔记:最好当数据是均匀的时候使用.values属性。例如,全是数值类型。如果数据是不均匀的,结果会是Python对象的ndarray:

In [18]: df3 = data.copy() In [19]: df3['strings'] = ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'] In [20]: df3 Out[20]:  x0    x1    y strings 0   1  0.01 -1.5       a 1   2 -0.01  0.0       b 2   3  0.25  3.6       c 3   4 -4.10  1.3       d 4   5  0.00 -2.0       e In [21]: df3.values Out[21]: array([[1, 0.01, -1.5, 'a'],      [2, -0.01, 0.0, 'b'],      [3, 0.25, 3.6, 'c'],      [4, -4.1, 1.3, 'd'],      [5, 0.0, -2.0, 'e']], dtype=object)

对于一些模型,你可能只想使用列的子集。我建议你使用loc,用values作索引:

In [22]: model_cols = ['x0', 'x1'] In [23]: data.loc[:, model_cols].values Out[23]: array([[ 1.  ,  0.01],       [ 2.  , -0.01],       [ 3.  ,  0.25],       [ 4.  , -4.1 ],       [ 5.  ,  0.  ]])

一些库原生支持pandas,会自动完成工作:从DataFrame转换到NumPy,将模型的参数名添加到输出表的列或Series。其它情况,你可以手工进行“元数据管理”。


在第12章,我们学习了pandas的Categorical类型和pandas.get_dummies函数。假设数据集中有一个非数值列:

In [24]: data['category'] = pd.Categorical(['a', 'b', 'a', 'a', 'b'],   ....:                                   categories=['a', 'b']) In [25]: data Out[25]:   x0    x1    y category 0   1  0.01 -1.5        a 1   2 -0.01  0.0        b 2   3  0.25  3.6        a 3   4 -4.10  1.3        a 4   5  0.00 -2.0        b

如果我们想替换category列为虚变量,我们可以创建虚变量,删除category列,然后添加到结果:

In [26]: dummies = pd.get_dummies(data.category, prefix='category') In [27]: data_with_dummies = data.drop('category', axis=1).join(dummies) In [28]: data_with_dummies Out[28]:   x0    x1    y  category_a  category_b 0   1  0.01 -1.5           1           0 1   2 -0.01  0.0           0           1 2   3  0.25  3.6           1           0 3   4 -4.10  1.3           1           0 4   5  0.00 -2.0           0           1

用虚变量拟合某些统计模型会有一些细微差别。当你不只有数字列时,使用Patsy(下一节的主题)可能更简单,更不容易出错。


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