【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第13章(上) Python建模库介绍
作者:SeanCheney Python爱好者社区专栏作者
简书专栏:https://www.jianshu.com/u/130f76596b02
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【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(上) pandas高级应用
【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(中) pandas高级应用
【翻译】《利用Python进行数据分析·第2版》第12章(下) pandas高级应用
本书中,我已经介绍了Python数据分析的编程基础。因为数据分析师和科学家总是在数据规整和准备上花费大量时间,这本书的重点在于掌握这些功能。
开发模型选用什么库取决于应用本身。许多统计问题可以用简单方法解决,比如普通的最小二乘回归,其它问题可能需要复杂的机器学习方法。幸运的是,Python已经成为了运用这些分析方法的语言之一,因此读完此书,你可以探索许多工具。
本章中,我会回顾一些pandas的特点,在你胶着于pandas数据规整和模型拟合和评分时,它们可能派上用场。然后我会简短介绍两个流行的建模工具,statsmodels和scikit-learn。这二者每个都值得再写一本书,我就不做全面的介绍,而是建议你学习两个项目的线上文档和其它基于Python的数据科学、统计和机器学习的书籍。
13.1 pandas与模型代码的接口
模型开发的通常工作流是使用pandas进行数据加载和清洗,然后切换到建模库进行建模。开发模型的重要一环是机器学习中的“特征工程”。它可以描述从原始数据集中提取信息的任何数据转换或分析,这些数据集可能在建模中有用。本书中学习的数据聚合和GroupBy工具常用于特征工程中。
优秀的特征工程超出了本书的范围,我会尽量直白地介绍一些用于数据操作和建模切换的方法。
pandas与其它分析库通常是靠NumPy的数组联系起来的。将DataFrame转换为NumPy数组,可以使用.values属性:
In [10]: import pandas as pd In [11]: import numpy as np In [12]: data = pd.DataFrame({ ....: 'x0': [1, 2, 3, 4, 5], ....: 'x1': [0.01, -0.01, 0.25, -4.1, 0.], ....: 'y': [-1.5, 0., 3.6, 1.3, -2.]}) In [13]: data Out[13]: x0 x1 y 0 1 0.01 -1.5 1 2 -0.01 0.0 2 3 0.25 3.6 3 4 -4.10 1.3 4 5 0.00 -2.0 In [14]: data.columns Out[14]: Index(['x0', 'x1', 'y'], dtype='object') In [15]: data.values Out[15]: array([[ 1. , 0.01, -1.5 ], [ 2. , -0.01, 0. ], [ 3. , 0.25, 3.6 ], [ 4. , -4.1 , 1.3 ], [ 5. , 0. , -2. ]])
要转换回DataFrame,可以传递一个二维ndarray,可带有列名:
In [16]: df2 = pd.DataFrame(data.values, columns=['one', 'two', 'three']) In [17]: df2 Out[17]: one two three 0 1.0 0.01 -1.5 1 2.0 -0.01 0.0 2 3.0 0.25 3.6 3 4.0 -4.10 1.3 4 5.0 0.00 -2.0
笔记:最好当数据是均匀的时候使用.values属性。例如,全是数值类型。如果数据是不均匀的,结果会是Python对象的ndarray:
In [18]: df3 = data.copy() In [19]: df3['strings'] = ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'] In [20]: df3 Out[20]: x0 x1 y strings 0 1 0.01 -1.5 a 1 2 -0.01 0.0 b 2 3 0.25 3.6 c 3 4 -4.10 1.3 d 4 5 0.00 -2.0 e In [21]: df3.values Out[21]: array([[1, 0.01, -1.5, 'a'], [2, -0.01, 0.0, 'b'], [3, 0.25, 3.6, 'c'], [4, -4.1, 1.3, 'd'], [5, 0.0, -2.0, 'e']], dtype=object)
对于一些模型,你可能只想使用列的子集。我建议你使用loc,用values作索引:
In [22]: model_cols = ['x0', 'x1'] In [23]: data.loc[:, model_cols].values Out[23]: array([[ 1. , 0.01], [ 2. , -0.01], [ 3. , 0.25], [ 4. , -4.1 ], [ 5. , 0. ]])
一些库原生支持pandas,会自动完成工作:从DataFrame转换到NumPy,将模型的参数名添加到输出表的列或Series。其它情况,你可以手工进行“元数据管理”。
在第12章,我们学习了pandas的Categorical类型和pandas.get_dummies函数。假设数据集中有一个非数值列:
In [24]: data['category'] = pd.Categorical(['a', 'b', 'a', 'a', 'b'], ....: categories=['a', 'b']) In [25]: data Out[25]: x0 x1 y category 0 1 0.01 -1.5 a 1 2 -0.01 0.0 b 2 3 0.25 3.6 a 3 4 -4.10 1.3 a 4 5 0.00 -2.0 b
如果我们想替换category列为虚变量,我们可以创建虚变量,删除category列,然后添加到结果:
In [26]: dummies = pd.get_dummies(data.category, prefix='category') In [27]: data_with_dummies = data.drop('category', axis=1).join(dummies) In [28]: data_with_dummies Out[28]: x0 x1 y category_a category_b 0 1 0.01 -1.5 1 0 1 2 -0.01 0.0 0 1 2 3 0.25 3.6 1 0 3 4 -4.10 1.3 1 0 4 5 0.00 -2.0 0 1
用虚变量拟合某些统计模型会有一些细微差别。当你不只有数字列时,使用Patsy(下一节的主题)可能更简单,更不容易出错。
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