《柳叶刀》发声：是时候认真谈谈吃肉的问题了 | 热心肠日报

今天是第943期日报。

Lancet：对肉食更深入的思考

Lancet[IF:53.254]

① 牲畜饲养的气候影响以及肉类引起的营养和健康问题，已成为一个紧迫的问题；② 即使是影响最小的肉类，也会导致比最不可持续的植物和蔬菜生产形式产生更多环境影响；③ 数据表明全世界所有死亡人数的4.4％由红肉或加工肉类引起，因此讨论建议设立针对红肉的健康相关税收；④ 需要采取更广泛的系统方法，来平衡我们想要吃肉的愿望，并保护我们赖以生存的生态系统。

We need to talk about meat
11-24, doi: 10.1016/S0140-6736(18)32971-4

【主编评语】吃肉或许不需深思，但最近关于牲畜饲养的气候影响以及肉类引起的营养和健康问题已成为一个紧迫的问题，Lancet发表的这篇社论提出了引发人们深度思考的问题，让我们再次面对肉食的时候，需要多一点考量。（@可乐）

川大邓振华+张林等：吃发酵乳制品或降低特定癌症风险

International Journal of Cancer[IF:7.36]

① 纳入61项关于摄入发酵乳制品与癌症风险关系的研究，共包括1962774名参与者和38358个癌症病例；② 荟萃分析表明，摄入发酵乳制品与癌症风险降低之间具有显著关联；③ 总体比较与队列研究分析表明，摄入酸奶与癌症风险，尤其是膀胱癌和结直肠癌风险降低显著相关，但与前列腺癌及肾癌的风险增加相关；④ 癌症类型亚组分析表明，摄入发酵乳制品显著降低了膀胱癌、结直肠癌和食道癌风险；⑤ 分层分析表明，奶酪摄入与结直肠癌风险显著降低有关。

Fermented dairy foods intake and risk of cancer
10-29, doi: 10.1002/ijc.31959

【主编评语】International Journal of Cancer上发表的来自四川大学华西基础医学与法医学院邓振华和张林团队的一项最新荟萃分析结果，分析了61项研究（包括近200万名受试者）后发现，摄入发酵乳制品与癌症风险的降低显著相关，特别是膀胱癌、结直肠癌及食道癌。（@沈志勋）

脂代谢网络对心血管疾病风险的影响

International Journal of Epidemiology[IF:8.36]

① 纳入787名PREDIMED试验参与者和230名心血管疾病（CVD）病例；② 不饱和程度是脂质代谢网络结构的主要决定因素，共鉴定出10个与CVD风险相关的脂质类群；③ 羟基化磷脂酰胆碱类群的评分每增加1个标准差，CVD风险比（HR）为1.39；④ 包含甘油二酯及甘油单酯的类群的HR为1.24，包含高不饱和磷脂及胆固醇酯的类群的HR为0.81；⑤ 据报道地中海饮食可改变脂质与心血管疾病的关系，但第一年随访期间未见干预组间脂质亚网络/类群的显著差异。

Lipid metabolic networks, Mediterranean diet and cardiovascular disease in the PREDIMED trial
11-13, doi: 10.1093/ije/dyy198

【主编评语】International Journal of Epidemiology上发表的一项最新研究，对近1000名受试者的脂代谢网络及心血管疾病进行分析后发现，脂代谢显著影响了心血管疾病的风险，而在第一年的随访期中，地中海饮食干预并未显著影响脂代谢网络。（@沈志勋）

菌群时间序列数据分析的新方法

Microbiome[IF:9.133]

① 微生物测序数据分析过程中，可采用对时间序列数据的分类处理方案；② 主要分为三步，首先区分结构化和非结构化模型，然后进行中性测试，最后估计模型的参数；③ 为了方便大家实现上述步骤，作者开发了一个新的R包（seqtime）；④ 本方法可快速而稳定的对微生物群落结构进行分类，并直接从微生物时间序列数据中评估物种间的相互作用程度；⑤ 该程序不仅可以确定微生物动态的生态驱动因素，也可以指导适当的群落模型来进行预测和后续分析。

Signatures of ecological processes in microbial community time series
06-28, doi: 10.1186/s40168-018-0496-2

【主编评语】生长速率、种间互作、随机过程和物种迁移等都会影响菌群的动态，这些因素的不同导致群落模型的适用性上存在差异，并可能影响种间相互作用关系的确定。一个新工具可以区分时间序列数据的噪音类型，帮助确定微生物动态的驱动因素，指导互作网络的构建。（@gaoch）

对宿主的遗传选择可同时影响菌群组成

eLife[IF:7.616]

① 在共生基因组（hologenome）的概念中，宿主与菌群的组合是一个独立的选择单位；② 以热带罗非鱼作为研究模型，通过继代选育获得耐寒性罗非鱼，以验证上述概念；③ 通过对宿主的遗传选择获得的耐寒性罗非鱼，其菌群在温度变化下也显示出了更高的恢复力，提示对宿主的选择也同时塑造了菌群；④ 这一发现与共生基因组的概念一致，强调了宿主与菌群在响应环境变化时的紧密联系。

Host genetic selection for cold tolerance shapes microbiome composition and modulates its response to temperature
11-20, doi: 10.7554/eLife.36398

【主编评语】eLife上发表的一项最新研究，以热带罗非鱼作为研究模型，通过继代选育获得耐寒性罗非鱼，并发现在对宿主进行遗传选择的同时，宿主体内的菌群也表现出了与宿主相似的“耐寒性”，提示菌群与宿主受到了相似的选择，验证了共生基因组（hologenome）这一概念。（@沈志勋）

干燥综合征vs系统性红斑狼疮，肠道和口腔菌群有何异同？

Journal of Autoimmunity[IF:7.607]

① 选取39名原发性干燥综合征（pSS）患者、30名系统性红斑狼疮（SLE）患者及965名健康人，分析肠道菌群及口腔菌群的组成及多样性；② pSS患者与SLE患者的粪便菌群组成与健康人有显著差异，细菌丰富度较低，厚壁菌门/拟杆菌门的比例较低，而拟杆菌属物种的相对丰度较高；③ pSS患者与SLE患者的粪便菌群组成无显著差异；④ pSS患者与SLE患者的口腔菌群存在显著差异，差异可能来源于pSS患者的口腔干燥。

Shared gut, but distinct oral microbiota composition in primary Sjögren's syndrome and systemic lupus erythematosus
11-09, doi: 10.1016/j.jaut.2018.10.009

【主编评语】干燥综合征和系统性红斑狼疮，是两种由密切关联的系统性炎症性自身免疫疾病，在流行病学、临床、病原学和病因学等方面有相通之处。来自Journal of Autoimmunity上发表的一项最新研究，对比了干燥综合征患者、系统性红斑狼疮患者及健康人在肠道菌群及口腔菌群上的异同，发现两组患者的肠道菌群组成无显著差异，但均异于健康人，而两组患者的口腔菌群组成存在显著差异。（@沈志勋）

IL23R基因上的一个SNP影响回肠菌群的多样性及组成

Journal of Crohn's and Colitis[IF:6.637]

① 分析15名轻中度回肠克罗恩病（CD）患者和58名健康人的粘膜相关菌群；② IL23R基因位点上的一个SNP——rs11209026显著影响健康人回肠菌群的组成，其突变型与菌群多样性、丰富度以及克里斯滕森菌科的丰度增加相关；③ 与健康样本相比，未发炎CD样本中柔嫩梭菌群的丰度、菌群多样性和丰富度降低；④ 发炎和非发炎CD患者的回肠菌群多样性、丰富度及分类群无显著差异；⑤ 钙网蛋白与健康样本中变形菌门的丰度正相关、与菌群多样性负相关。

IL23R-protective coding variant promotes beneficial bacteria and diversity in the ileal microbiome in healthy individuals without inflammatory bowel disease
11-16, doi: 10.1093/ecco-jcc/jjy188

【主编评语】Journal of Crohn's and Colitis上发表的一项最新研究，鉴定出IL23R基因上的一个SNP与回肠菌群的组成及多样性相关，野生型携带者的回肠菌群多样性、丰富度及有益菌丰度显著降低，可能与克罗恩病的风险增加相关。（@沈志勋）

肠道干细胞的节律受什么因素调控？

Stem Cell Reports[IF:6.537]

① 细胞的昼夜节律活动在肠道中是不均匀的，肠上皮细胞、成纤维细胞和干细胞具有昼夜节律，但肠内分泌细胞没有；② 果蝇肠道细胞主要与光周期同步，没有光周期的情况下，喂食可以调节果蝇的肠道昼夜节律；③ 肠道干细胞昼夜节律对维持干细胞生态位的信号通路高度敏感，Wnt和Hippo信号通路正向调节干细胞昼夜节律功能；④ 肠道干细胞昼夜节律受细胞信号通路的调节，生理变化（如细胞再生和衰老）期间昼夜节律可能会发生变化。

Intestinal Stem Cells Exhibit Conditional Circadian Clock Function
11-13, doi: 10.1016/j.stemcr.2018.10.010

【主编评语】干细胞的节律性日益受关注。本研究发现果蝇的肠上皮干细胞及其他肠已分化细胞的节律性并不一致，而干细胞的节律受环境和特定细胞通路调节。该结果有助于解释细胞生理变化期间的节律变化，值得参考。（@小肠君）

感谢本期日报的创作者：可乐，MAY DAY，Adam刘永鑫-中科院-宏基因组，沈志勋，女巫

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