Cell亮点纷呈：不为人知的菌群小蛋白+胰腺癌菌群 | 热心肠日报

今天是第1187期日报。

Cell：挖掘人体菌群中不为人知的小蛋白

Cell[IF:36.216]

① 分析1773个人宏基因组（包括4个身体部位），鉴定出4539个保守的小蛋白质家族；② 大部分都是此前未知的，>90%的小蛋白家族不含已知的结构域，约半数不存在于参考基因组中；③ 对于在已有宏转录组数据集中能找到同源性的小蛋白质家族，至少75%是活跃转录的；④ 预测了小蛋白的多种潜在功能，如管家功能、细胞间互作（如分泌或跨膜蛋白）、适应性（可发生水平转移）、抗噬菌体/其它细菌；⑤ 一种新型核糖体相关蛋白可能普遍存在于人体菌群中。

Large-Scale Analyses of Human Microbiomes Reveal Thousands of Small, Novel Genes
08-08, doi: 10.1016/j.cell.2019.07.016

【主编评语】受计算机和试验方法所限，小蛋白常因难以检测而研究中被忽视。Cell本期发表的一项重磅研究，通过计算机方法，对人体宏基因组中潜在的小蛋白进行了大规模分析和鉴定，揭示出菌群含有的大量未知小蛋白及其多样化的功能，对于进一步挖掘菌群功能有重要意义。（@李丹宜）

Cell：肿瘤菌群和肠道菌群可影响胰腺癌预后

Cell[IF:36.216]

① 生存期短（STS）和生存期长（LTS）的胰腺癌（PDAC）患者，其肿瘤菌群组成有显著差异，LTS患者的肿瘤菌群有更高的α多样性；② 用LTS患者肿瘤中富集的3个菌属（假黄色单胞菌、糖多孢菌、链霉菌）+1个菌种（克劳氏芽孢杆菌），能较准确预测患者的长期生存，与患者的抗肿瘤免疫活化（募集并激活CD8+ T细胞）相关；③ 将STS、LTS和对照个体的粪菌移植给小鼠，可对肿瘤菌群组成（小部分通过细菌移位）、肿瘤生长和肿瘤内免疫浸润产生影响。

Tumor Microbiome Diversity and Composition Influence Pancreatic Cancer Outcomes
08-08, doi: 10.1016/j.cell.2019.07.008

【主编评语】胰腺癌（PDAC）有“癌中之王”的恶名，通常存活期较短，但也有少数患者能生存5年以上。最新一期的Cell发表了来自美国德克萨斯大学安德森癌症中心的最新研究，揭示了PDAC长期幸存者的肿瘤菌群特征，及其与抗肿瘤免疫应答的关联，表明肿瘤菌群组成有望作为PDAC预后的预测标志物。该研究还通过粪菌移植试验，为靶向肠道菌群改善PDAC的疗法提供了初步的证据支持。（@李丹宜）

马现仓+贾慧珏等：肠道菌群异常可影响色氨酸代谢，促进小鼠精神分裂症状

Molecular Psychiatry[IF:11.973]

① 给抗生素处理的小鼠移植健康人（HC）或精神分裂症（SCZ）患者的粪菌；② SCZ小鼠有精神运动亢进和认知损伤等SCZ样症状；③ SCZ小鼠的色氨酸（Trp）水平降低，大脑和血液中Trp分解代谢的犬尿氨酸（Kyn）-犬尿喹啉酸（Kyna）通路活性上升，脑内特定区域的神经递质多巴胺和5-羟色胺增多；④ SCZ小鼠的结肠腔滤液可促进Trp-Kyn-Kyna代谢途径关键酶IDO1和KAT II的活性；⑤ HC和SCZ小鼠的肠道菌群组成和功能有差异，可能影响Trp代谢和神经递质水平。

Transplantation of microbiota from drug-free patients with schizophrenia causes schizophrenia-like abnormal behaviors and dysregulated kynurenine metabolism in mice
08-07, doi: 10.1038/s41380-019-0475-4

【主编评语】Molecular Psychiatry最新发表了由西安交通大学附属第一医院马现仓和华大基因贾慧珏等主导的研究，用粪菌移植等方法表明肠道菌群异常可促进精神分裂症，一定程度上与菌群引起的色氨酸代谢异常（色氨酸-犬尿氨酸-犬尿喹啉酸通路上调）有关，提示菌群-肠-脑轴在精神分裂症中的重要作用。（@李丹宜）

Cell：肠道信号如何促进雄性果蝇生理特征

Cell[IF:36.216]

① 雄性果蝇中，中肠R4区后部的碳水化合物代谢，呈现雄性特异性特征；② 肠道外邻近的雄性性腺，通过激活该肠道区域肠上皮细胞中的JAK-STAT信号，引起雄性特有的肠道糖基因表达上调，并促进肠道分泌柠檬酸；③ 柠檬酸进入循环，通过柠檬酸转运蛋白Indy，促进雄性果蝇的食物摄取；④ 同时，肠道分泌的柠檬酸通过Indy作用于邻近的雄性性腺睾丸，促进精子成熟；⑤ 雄性果蝇中，性腺-肠道轴存在双向交流，促进这两个器官生理功能的性别特征。

Sex Differences in Intestinal Carbohydrate Metabolism Promote Food Intake and Sperm Maturation
08-08, doi: 10.1016/j.cell.2019.07.029

【主编评语】生理和代谢具有性别差异，Cell发表的一项最新研究在果蝇中探究了肠道来源的信号如何影响全身生理的性别差异，发现在雄性果蝇中，性腺与邻近肠道区域间存在双向交流，对二者的功能产生影响，细胞因子信号和代谢物柠檬酸是主要介导因子。（@李丹宜）

栖息地变化影响北极熊的粪便菌群

ISME Journal[IF:9.493]

① 全球气候变化使北极海面的冰层融化加快，导致北极熊的栖息地开始发生变化，一些原本栖息于冰上的北极熊开始栖息于陆地上；② 收集栖息于陆地上及栖息于冰上的北极熊的粪便，利用16S rRNA测序对菌群多样性及组成进行对比分析；③ 陆地北极熊粪便菌群的细菌多样性更高，其中丰度最高的OTU属于变形菌门；④ 与冰上北极熊相比，陆地北极熊粪便菌群中的厚壁菌门显著减少。

Global change-driven use of onshore habitat impacts polar bear faecal microbiota
07-11, doi: 10.1038/s41396-019-0480-2

【主编评语】来自ISME Journal上发表的一项研究，发现随着气候变暖，冰层熔化加快，一些北极熊开始从冰上迁移到陆地上生存，而栖息地的变化也显著影响了北极熊粪便菌群的多样性及组成。（@沈志勋）

全身振动可降低糖尿病小鼠炎症、改变肠道菌群

International Journal of Molecular Sciences[IF:4.183]

① 全身振动（WBV）是一种可以降低炎症反应和逆转2型糖尿病（T2DM）的模拟运动；② WBV可诱导T2DM小鼠和对照小鼠的网膜巨噬细胞由促炎（M1）向抗炎（M2）型极化，使T2DM小鼠的M2巨噬细胞水平恢复至对照小鼠的基线水平，提高抗炎细胞因子IL-10水平；③ WBV可以改变肠道菌群组成，略降低α多样性，使短链脂肪酸产生菌增多，拟杆菌属和Alistipes菌属增多；④ WBV有望预防和治疗包括糖尿病和肥胖症在内的许多疾病。

Whole Body Vibration-Induced Omental Macrophage Polarization and Fecal Microbiome Modification in a Murine Model
06-26, doi: 10.3390/ijms20133125

【主编评语】International Journal of Molecular Sciences发表的一项小研究，分析了“全身振动”这种运动模拟方法对糖尿病小鼠的巨噬细胞表型和肠道菌群组成的影响，表明全身振动或能降低炎症水平、改善肠道菌群，从而改善糖尿病等代谢炎症疾病。（@李丹宜）

Lancet：口腔健康不容忽视！

Lancet[IF:59.102]

① 龋齿、牙周疾病和口腔癌等口腔疾病会导致疼痛、败血症、工作效率下降、经济负担加重，应重视口腔健康；② 全球约35亿人患有牙齿疾病，龋齿是最常见疾病之一；③ 一项纳入326万人的研究揭示了不同年龄段的口腔疾病情况，低/中等收入国家和贫穷边缘化群体的患病率越来越高；④ 糖摄入、烟酒消费及复杂社会/商业因素起关键性作用；⑤ 现需要更多关注游离糖摄取对龋齿、超重/肥胖及糖尿病等相关疾病的影响，控制糖业对公共卫生造成的威胁。

Oral diseases: a global public health challenge
07-20, doi: 10.1016/S0140-6736(19)31146-8

【主编评语】Lancet近期发表的一篇长综述科普文章，聚焦全球口腔健康问题，探讨了口腔疾病的影响和主要风险因素，特别提出应关注糖摄入对口腔健康的危害。这篇文章是公开获取的，有兴趣的读者不妨仔细阅读。（@李丹宜）

Lancet子刊：食品价格政策如何影响消费行为

Lancet Public Health[IF:11.6]

① 1132名成年受试者在虚拟超市中进行共4258次购物行为，其中645次购物无价格变动，2545次购物遇上1次价格变动，1068次购物遇上2次以上的价格变动；② 价格变动包括：水果/蔬菜津贴、含糖饮料税、饱和脂肪税、盐税、糖税；③ 在无价格变动时，67.90%的食品购物行为是健康的，饱和脂肪税、盐税及糖税轻微但显著地提升了这一比例；④ 饱和脂肪税及盐税造成了一定的替换效果：在增加了水果/蔬菜购买占比的同时，增加了糖在总能量摄入中的占比。

The effect of food price changes on consumer purchases: a randomised experiment
08-02, doi: 10.1016/S2468-2667(19)30105-7

【主编评语】Lancet Public Health上发表的一项最新研究，通过一项虚拟购物实验，分析了食品价格政策（包括税及补贴）对食品购买行为的影响，发现对饱和脂肪、盐、糖征税可提升健康食品的购买。（@沈志勋）

感谢本期日报的创作者：李丹宜，沈志勋，吴芹，徐笑

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