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用于NK细胞的mRNA-LNP制剂筛选和优化

慕羽 生物药论 2023-12-01

自然杀伤(NK)细胞通过基因编码的表面受体消除癌症和病毒感染的细胞,参与免疫系统。因其先天的独立性以及显著降低毒性,已经成为过继细胞治疗(ACT)中T细胞的替代品。用mRNA工程化NK细胞增强其肿瘤靶向性和细胞毒性,在ACT中显示出巨大的潜力。然而,NK细胞的mRNA转染具有挑战,最常见的递送方法,如电穿孔,具有局限性。因此,一种能够在保持细胞活力的情况下实现高mRNA转染效率的替代性非病毒递送系统将有利于NK细胞疗法的发展。

这项研究中,分别基于聚合物文库不同的可电离脂质,研究了用于向NK细胞递送eGFP mRNA的聚合物和脂质纳米颗粒(LNP)制剂。基于阳离子聚合物的mRNA纳米颗粒显示出NK细胞的有限内化和低转染效率。另一方面,通过调整脂质摩尔比和制备参数来优化mRNA-LNP制剂,从而在NK细胞中获得高转染效率(~100%)和高蛋白表达。总之,与聚合物和电穿孔相比,当在NK(KHYG-1)和T(Jurkat)细胞系以及脐血来源的NK细胞中测试时,优化的LNP显示出更高的转染效率和eGFP表达。因此,基于LNP的mRNA递送是进一步开发新型NK细胞疗法的一种有前景的策略。

研究亮点



01脂质纳米颗粒(LNPs)能够保证NK细胞活力同时实现约100%的mRNA转染。02LNPs mRNA递送优于电穿孔和聚合物纳米颗粒。03

β-谷甾醇LNPs显示出优良的转染效率和表达强度。

04LNP实现了约100%的mRNA转染和存活的T细胞。
结果
1聚合物介导的mRNA转染NK细胞
聚合物的配方和表征

为了研究聚合物在NK细胞中的mRNA转染潜力,首先合成了阳离子聚合物pHDPA、pHDePA、pHPMA-DAE、pDMAEMA和PEG-pDMAEMA。通过聚合物的胺基和mRNA的磷酸基团之间的静电相互作用,阳离子聚合物与mRNA自组装,形成聚合物纳米颗粒。为了研究聚乙二醇化和交联的影响,首先用PEG-BCN通过无铜点击化学对pHDPA复合物的叠氮化物基团进行后修饰,然后加入DTT使聚合物的吡啶二硫基化学交联。然后用蔗糖作为冷冻保护剂将这些聚合物冷冻干燥,并在转染前溶解在无核酶水中。

mRNA聚合物的一个重要参数是N/P比,即聚合物的胺基与核酸的磷酸基团的比率。N/P比率不仅对聚合物的特性起着关键作用,而且对细胞的转染效率和活力也起着至关重要的作用。尽管在较高N/P比下制备的聚合物可以增强的细胞摄取和内体逃逸,但过量的阳离子聚合物通常对细胞活力产生负面影响。为了避免潜在的毒性,因此在以下转染实验中排除了高N/P比率,使用10的N/P比来配制pHDPA、pHDePA、pHPMA-DAE、pDMAEMA和P5D39聚合物,PEG化的pHDPA复合物的N/P比为4,对于PEI聚合物,选择40的N/P比。

如表1所示,除了pHDPA(具有和不具有PEG化和交联)形成具有负ζ电位的纳米聚合物外,其他聚合物带正电,其尺寸范围为138至199nm(表1)。仅在没有PEG化的pHDPA和P5D39的情况下分别产生56nm和77nm的较小颗粒

▼表1 mRNA聚合物的表征

聚合物介导的mRNA转染HEK293T、KHYG-1和NK-92细胞

为了研究聚合物对于NK细胞的mRNA转染效率,首先使用了一种更容易转染的细胞系HEK293T细胞,Lipofectamine3000™ 作为阳性对照。各种聚合物的mRNA转染效率如图1A,对于细胞的毒性如图1B。其中pHDPA聚合物不具备转染能力,P5D39与DMAEMA有较低的转染效率,PEI聚合物约50%转染效率。各种聚合物毒性如图1B,除P5D39外,所有聚合物均将HEK293T细胞的存活率保持在95%,P5D39表现出细胞毒性,存活率降至约50%。

▲图1 HEK293T细胞和两种NK细胞系KHYG-1和NK-92的不同eGFP mRNA聚合物转染,24小时后评估转染效率和细胞活力。

接下来,在NK细胞上评估聚合物介导的mRNA递送(图1C)。在两种NK细胞系,即KHYG-1和NK-92中筛选出了PEI、P5D39和pHPMA DEAE,Lipofectamine3000™ 用作对照。只有少量NK细胞呈eGFP阳性(PEI为0%,P5D39为0.5%,pHPMA-DAE为0.5%)。Lipofectamine脂质复合物对NK细胞的转染效率也最低(~0.05%)。与HEK293T细胞类似,P5D39聚合物引起细胞毒性,KHYG-1和NK-92的细胞活力分别降至66%和85%(图1D)。

KHYG-1细胞对聚合物摄取的评估

聚合物转染mRNA的效率较低,表明聚合物的摄取与mRNA内体逃逸受限。为了评估NK细胞对这些纳米颗粒的摄取,配制了含有Cy5标记编码eGFP mRNA的PEI、P5D39和pHPMA DEAE聚合物,并转染KHYG-1细胞。转染后24小时通过荧光显微镜观察结果,如图1E所示,观察到Lipofectamine3000TM和P5D39聚合物的较高细胞摄取(Cy5信号),而缺乏eGFP表达,表明孵育24小时后,这些聚合物仍在细胞内还未释放。PEI和pHPMA-DAEE聚合物显示缺乏细胞摄取,这解释了NK细胞中转染活性低的原因。

2LNP介导mRNA转染NK细胞
不同可电离脂质的筛选

由于聚合物eGFP mRNA纳米颗粒在NK细胞中的表达有限,因此研究了LNP转染NK细胞的潜力。用可电离脂质C24、Lipid 5和SM-102制备的LNP(图2A 1-3),N/P比为3,首先在KHYG-1细胞中,评估其转染效率和对细胞活力的影响。在微流控制备过程中,以体积比为1:1.5(乙醇相:水相),总流速TFR为4mL/min。如图2B所示,当使用高剂量时,C24-LNP转染仅有3%的eGFP阳性细胞。由Lipid 5和SM-102可电离脂质组成的LNP成功转染了KHYG-1细胞,Lipid 5转染效率为48%,SM-102转染效率在70%左右。然而,由于本实验中只使用了一个N/P比,我们进一步进行了优化步骤以确定最佳配方参数。

▲图2 使用LNPs将mRNA递送到KHYG-1细胞并筛选不同的可电离脂质

mRNA LNP的优化

在优化过程中,对颗粒的大小、PDI和ζ-电位进行表征,并通过流式评估转染效率、eGFP表达强度(gMFI)和细胞活力,如表2所示。为了确定转染KHYG-1细胞的最佳电离脂质,筛选了Lipid 5和SM-102的不同N/P比的LNP。对于SM-102,N/P=3和5的LNP显示出相似的转染效率,根据剂量的不同,转染效率在82%到84%之间。不同的是,N/P比率对Lipid 5起着关键作用,因为与N/P=3相比,N/P=5不仅显著提高了转染效率,从36%提高到90%(低剂量),而且gMFI从3提高到2819(表2)。毒性方面,当3和5的N/P用于两种可电离脂质时,细胞活力95%。还应该提到的是,N/P比的差异不会影响颗粒的大小,因为SM-102和Lipid 5在N/P=3和5中的大小范围为105至110nm(表2)。正如预期的那样,当使用更高的N/P比时,ζ电位略有增加,SM-102和Lipid 5分别从−3.5到−2.7 mV和从−6.2到−4.9 mV。由于与SM-102相比,基于Lipid 5的LNP制剂显示出更高的表达强度,因此使用Lipid 5 N/P比为5的可电离脂质进一步优化。

▼表2 脂质纳米颗粒的优化

用β-谷甾醇和豆甾醇取代胆固醇(图2A 6-8)被报道可增强内体逃逸,从而增强蛋白质表达。而在研究中,豆甾醇取代导致PDI为0.63的高度多分散颗粒,这可能是由于聚集,导致较低的转染效率(约36%)和非常低的gMFI(表2)。另一方面,与基于胆固醇的LNP相比,掺入β-谷甾醇不仅显著提高了转染活性(低剂量为87%对56%,高剂量为84%对70%)而且还显著增加了eGFP的总表达(表2),且基于胆固醇和β-谷甾醇的制剂在粒径和ζ电位方面没有显著差异,分别产生92和86 nm的颗粒,ζ电势略负,约为−2 mV。此外,用胆固醇制备LNP时,mRNA包封率更高,观察到的eGFP的表达差异可以用LNP的形态来解释。先前使用冷冻透射电子显微镜(cryo-TEM)、差示扫描量热法(DSC)和膜流动性测定法研究了胆固醇和植物甾醇LNP的形态差异,表明β-谷甾醇LNP具有更高程度的片层性,与含胆固醇的LNP相比,外部脂质层中的脂质组成不同。冷冻透射电子显微镜(cryo-TEM)图像清楚地表明,用胆固醇和天然类似物制备的LNP显示出核壳结构,具有无定形核和片状表面。然而,与显示均匀弯曲外层的基于胆固醇的LNP相比,具有天然类似物(如β-谷甾醇)的LNP表现出多方面的表面。β-LNP的结构变化会增加颗粒的脆性,从而增加其与内涵体膜的融合,最终增强mRNA的释放

▲图3 用胆固醇或β-谷甾醇制备的低剂量(每孔500 ng mRNA)基于Lipid 5 N/P=5的mRNA-LNP转染KHYG-1细胞,24小时后的荧光显微镜图像,比例尺=300μm。

在LNP的微流控制备过程中,优化配方参数也发挥了重要作用。当TFR以1:1.5的体积比(EtOH:水相)从11 mL/min降低到9 mL/min时,低剂量转染效率从87%下降到30%,高剂量从84%下降到15%(表2),ζ电位保持在−2 mV左右,但粒径从86 nm增加到137 nm。相反,当TFR降低到9mL/min,同时体积比从1:1.5增加到1:3时,eGFP阳性细胞的百分比分别为92%和94%(低剂量和高剂量),这是本研究中最高转染效率。1:3的体积比导致更高的gMFI水平和eGFP表达(表2)。

优化结果表明,LNP的最佳脂质为Lipid 5、DSPC、DMG-PEG2K和β-谷甾醇。此外,N/P比为5和体积比为1:3(EtOH:水相)的TFR为9mL/min是LNP微流控制备的最佳参数。除了脂质组成和配方参数的影响外,两种mRNA剂量转染NK细胞都是有效的。因此,使用较低剂量(每孔500ng mRNA)进行下一步实验。

优化后的LNP在KHYG-1和Jurkat细胞中的转染效率

在两种免疫细胞系:KHYG-1 NK细胞和Jurkat T细胞使用优化后的LNP(Lipid 5、N/P=5、β-谷甾醇、TFR 9mL/min和1:3体积比)与电穿孔比较mRNA递送效率。对新制备LNPs表征后(表3),按照转染方案将KHYG-1和Jurkat细胞与该mRNA-LNP一起孵育。

▼表3 优化的mRNA-LNPs表征


如图4A和B所示,LNP和电穿孔分别导致92%和85%的eGFP阳性KHYG-1细胞,同时保留了细胞活力(99%)。重要的是,图4C和5显示用LNPs转染导致gMFI比电穿孔增加35倍

▲图4 优化的mRNA-LNPs与电穿孔在KHYG-1和Jurkat细胞中的比较

▲图5  各类mRNA递送方式在KHYG-1细胞中24小时后的荧光显微镜图像,比例尺=300μm

在Jurkat细胞中观察到类似的情况,如图4A-C所示,LNP的转染效率优于电穿孔,而电穿孔细胞活力明显下降,当与LNP一起孵育时,Jurkat细胞活力仅下降了4%。通过FC测量的gMFI有明显差异,与电穿孔相比,LNP的eGFP表达增加了54倍,在图6的荧光图像中可看出较为明显的差异

▲图6 各类mRNA递送方式在Jurkat细胞中24小时后的荧光显微镜图像,比例尺=300μm

这些研究表明,与电穿孔相比,LNPs表现出更好的细胞相容性或较低毒性、优越的转染效率和更高的eGFP表达,并为工程化NK细胞临床提供了一种有前途的工具。

优化的LNP有效转染脐血来源的NK细胞

为了了解优化的mRNA-LNP制剂潜在的应用价值,研究了其在脐血来源的NK细胞中的效率。LNP在转染效率方面优于电穿孔,与电穿孔的57%相比达到75%(图7A)。至于毒性,两种递送技术都表现出相当高的细胞活力,达到99.5%(图7B)。而eGFP表达强度有显著差异,其中与电穿孔相比,优化的LNP导致gMFI增加了5倍(图7C)。 

▲图7 脐血来源的NK细胞中优化的mRNA-LNP与电穿孔的比较

此外,荧光显微镜图像显示NK细胞中eGFP的表达(图7D),清楚地展现了LNP转染具有更高水平的蛋白质表达,与电穿孔相比有更亮的荧光信号。这些发现表明,优化的LNP在体外来源的NK细胞中更有效地促进eGFP mRNA递送和随后的蛋白质表达。

KHYG-1 NK细胞系中优化的mRNA-LNP的剂量研究

每孔500 ng mRNA-LNP为最高浓度,进行浓度梯度研究优化的mRNA-LNP制剂用于KHYG-1 NK细胞转染,以评估优化的LNP在较低mRNA浓度下的mRNA递送潜力。为此,制备eGFP mRNA-LNP,并在KHYG-1细胞系中以1.9至500ng/孔(2.5×104个细胞)的不同mRNA浓度进行测试。结果显示,在所有剂量下,eGFP mRNA转染效率一致较高,其值在89%至92%之间。此外,无论mRNA浓度如何,细胞活力都保持在约99%不变。然而,在gMFI中观察到一个显著的趋势,表明随着浓度的降低,gMFI减少,这意味着细胞荧光水平降低。具体而言,500 ng的高剂量报告了55×10^3的最高gMFI值,1.9 ng的低剂量报告了1.5×10^3的最低值。值得注意的是,每孔15.6至250 ng的mRNA浓度达到了15×10^3至30×10^3的相似gMFI。

▲图8 在KHYG-1细胞中进行eGFP mRNA-LNPs的浓度梯度研究

这些发现表明,虽然转染效率和细胞活力在整个浓度范围内保持在高水平,但mRNA浓度与细胞内蛋白质表达相关。此外,低于500ng的浓度在转染效率和gMFI方面都显示出巨大的潜力。为了防止高生产成本,未来的研究中,可以考虑每孔低于500ng mRNA的标准剂量。

结论

目前,在正在进行的临床试验中,将mRNA递送到NK细胞的主要技术是电穿孔。然而,诸如对电穿孔细胞的形态和表型以及对mRNA完整性的影响等缺陷,现已将焦点转移到纳米颗粒作为转染剂上。在本研究中,确定一种用于NK细胞离体工程化的mRNA递送技术。这里比较了聚合物、LNP和电穿孔以获得最佳的eGFP mRNA递送。证明聚合物mRNA导致NK细胞有限的转染效率和细胞摄取。相反,LNP对脐血来源的NK、KHYG-1和Jurkat细胞显示出有希望的结果。具体地,当使用Lipid 5作为可电离脂质时。LNP优化显示,在较宽的mRNA浓度范围内,N/P=5,用β-谷甾醇取代胆固醇,TFR为9mL/min,体积比为1:3(EtOH:水相),不仅增加了eGFP阳性细胞的数量,而且增加了细胞内eGFP的蛋白表达。与电穿孔相比,观察到转染效率、蛋白质表达和细胞形态的改善。需要进一步的研究来评估用mRNA-LNPs治疗后NK细胞受体的功能,而这项研究证明了LNPs在临床开发新型NK细胞疗法方面的潜力。


参考文献:

https://doi.org/10.1016/j.jconrel.2023.08.014.



END

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