如何快速检测冠状病毒?ELISA 法来帮忙
从 SARS(非典型肺炎病毒)到 MERS(中东呼吸综合征冠状病毒),再到近来爆发的 SARS-CoV-2(新型冠状病毒),冠状病毒总是打得人们措手不及。与时间赛跑,与疫情角力,有效快速地检测冠状病毒是防控其进一步传播的关键。本文,我们就来聊聊如何构建 ELISA 法快速检测冠状病毒的实验。
SARS-CoV-2 病毒彩色图片,图片来源:NIAID
ELISA 免疫分析 PK 核酸检测法
一般来说,常用的病毒检测手段包括:核酸扩增试验(NAAT,例如实时荧光 RT-qPCR)、透射电子显微镜、免疫组织化学和血清学方法(例如 ELISA 和免疫荧光分析)等。
不同的诊断或研究需求,应选择合适的检测方法。譬如目前 SARS-CoV-2 的临床诊断主要依赖于核酸检测,而针对动物(例如穿山甲和蝙蝠)的大规模筛选项目,为了能更好地解析病毒的起源、传播和进化,以 ELISA 为代表的血清学检测方法除了比 NAAT 更为经济外,还具有如下明显优势:
✦ 血清学筛查所需的设施空间较小,并且可以在现场进行,以最大程度地减少样品运输及周转时间。
为避免 NAAT 中扩增子的交叉污染,其工作流程通常需要四个单独的物理位置:
样品制备(裂解、核酸提取和逆转录);
NAAT 主混合物制备;
模板添加;
扩增和分析。
尽管诸如实时 RT-qPCR 的技术简化了工作流程,但此类要求限制了其在指定区域实验室中执行。另一方面,在病毒灭活后,ELISA 实验可以在任意位置进行。
✦ ELISA 仅需简单的设备,投资较小。
按照标准执行 NAAT,最低要求包括用于预混液制备和样品添加的 UV 安全柜或工作站、PCR 仪、琼脂糖凝胶电泳和可视化设备。为获得更严格、更迅速的检测,还要求使用实时 RT-PCR 仪,所需的初始投资较大,限制了在偏远地区的应用。
✦ 与 NAAT 相比,技术人员进行 ELISA 等血清学检测所需的实验技能相对来说比较简单,只需要稀释和移液技能即可。
✦ 用于扩增子可视化的 NAAT 中常用的核酸染色试剂可能是诱变剂,对技术人员和周围环境造成潜在的健康风险;而 ELISA 使用的化学药品和溶液相对安全。
✦ 最后,也是最重要的,ELISA 检测的灵敏度和特异性较高,甚至是早期诊断或者动物样本。
以 MERS-CoV 为例,通过使用两种 MERS-CoV 核衣壳蛋白特异性单克隆抗体进行 ELISA 分析,该测试可以准确检测低至 10 TCID50/ 0.1 mL 的 MERS-CoV 病毒,并且特异性为 100%。
由于急性感染患者的鼻咽抽吸病毒量约为 106 copies/ mL,病毒的源头宿主中东地区单峰骆驼的鼻腔样本通常约为 104-106 copies/ mL,因此该测试为 MERS-CoV 诊断和筛查提供了足够的敏感性。
采用 ELISA 方法检测 MERS-CoV 核衣壳蛋白[1],步骤如下:1)根据「捕获抗体-核衣壳蛋白-检测抗体」的夹心法免疫分析原理,设计 ELISA 实验;2)制备溶液及缓冲液,必要时可使用高压灭菌器或过滤器进行灭菌,以免其它微生物的肽段与目标抗原发生竞争;3)捕获抗体包被微孔板;4)将含有潜在感染性 MERS-CoV 的样品根据规定进行处理;5)样品稀释和孵育;6)偶联 HRP 的检测抗体进行稀释和孵育;7)每个孔加入 TMB 底物溶液,室温孵育后加入终止液终止反应,读板、分析数据。
ELISA 检测 S 蛋白,多种方法百花齐放
与 SARS-CoV 相同,SARS-CoV-2 也是通过病毒表面的 S 蛋白结合 ACE-2蛋白进入细胞的。近日,美国德克萨斯大学奥斯汀分校的 Jason S. McLellan 团队在 bioRxiv 上的论文表明,后者与宿主细胞上 ACE-2 蛋白的亲和力增加了 10-20 倍[2]。检测 S 蛋白是采用 ELISA 法鉴定 SARS-CoV-2 病毒的有效方法。
尽管两者 S 蛋白的氨基酸序列同源性只有 76.47%[3],但是结构总体看来极为相似。
SARS-CoV-2(2019-nCoV)与 SARS-CoV 的结构对比[2]
Bio-Techne 旗下的子品牌 Novus Biologicals® 可提供 SARS-CoV ELISA 检测的关键工具:S 蛋白抗体对。
如要定量检测病毒含量,还需使用到标准品蛋白。对于 SARS-CoV-2 的 ELISA 检测,R&D Systems® 可提供 ELISA 抗体对和标准品定制,以助力更多检测方法的发现,加速疾病的研究进程。
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参考资料:
1.MERS Coronavirus: Methods and Protocols.
2.Cryo-EM Structure of the 2019-nCoV Spike in the Prefusion Conformation.