高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 2

基因组浏览器的基本使用、各部分功能和不同Track展示，在高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 1已有介绍。这次进一步介绍其可用的公共数据信息、区域截图和共享等。利用这些公共数据，可以很方便比较基因在不同细胞系的表达、修饰、TF结合和染色质三维作用等。找到关键信息后，可截取矢量图用于文章发表，也可把数据分享给老师、合作者，一起寻找更多信息。

EPGG支持的物种有人、小鼠、大鼠、猴子、猪、狗、猩猩、鸡、斑马鱼、果蝇、线虫、拟南芥、玉米、大豆、白菜、酵母等，也可以把自己的基因组整理成所需要的格式，导入EPGG使用。

模式生物有比较多的高通量测序研究的大项目，如TCGA，Roadmap，ENCODE等和染色体三维结构或互作 Hi-C、ChIA-PET研究等公共数据，可以直接点击Load加载，然后再选择关注的样品或数据类型，导入浏览器查看。

加载好，Track选择界面如下，可以点击+进一步展开，选择对应数据。

更多Track操作见下图，也可以导入自己的Track (小文件直接上传，大文件提供可访问的链接)。

文件上传界面如下：

Track多了，分组就是问题。EPGG提供右侧的Metadata colormap，用不同的颜色块区分样品和测序类型等，鼠标悬浮会有文字提示，是很方便的功能。

看到需要的结果，可以存储下来，放到文章的图中。

也可以分享给老师、同学、合作者们。

EPGG还提供了很多实用的分析功能，如下图：

浏览器访问链接：http://epigenomegateway.wustl.edu/browser/

下一期再详细介绍每个功能使用。

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