很多CNS文章都需要用到的技术，来了解下？

常规转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型，其实验方法成熟，花费较低，分析思路简洁清晰，很多CNS文章里面都会用到，同时也是入门生信，解决最常见问题的首选。（学习生信的系列书籍）

本次课程于2019年10月11日-13日在北京鼓楼开班，将系统讲述基于和不基于比对的转录组分析流程，从原始数据到表达矩阵、差异基因、富集分析、加权共表达网络、通路分析、可视化绘图等一系列常见操作，理论和实践兼备。

课程大纲

每节课1小时一个主题，理论结合实战，学懂原理，实战实操，全是老司机多年经验和代码的无私分享。下面是课程安排，如11代表第一天第一节课，26代表第二天第六节课，41为两周后的线上集中视频答疑。

11	转录组概述	转录组设计、应用、批次效应等
12	转录组分析流程简介	基于/不基于比对的分析流程讲演
13	Salmon定量实战	不基于比对直接定量基因和转录本的表达
14	差异基因分析	DESeq2差异基因分析
15	富集分析和可视化	GO富集分析
16	富集分析和可视化	GSEA富集分析
21	R基础	数据读写、处理和可视化
22	二代三代测序原理介绍	建库测序过程及注意事项
23	转录组环境配置	Linux下一键配置
24-25	STAR比对拼装差异剪接	和差异基因分析
26	文章常见图表解读	和Illustrator制作CNS标准图版
31	Linux基础	详细解释代码和文件格式转换
32	WGCNA基因加权共表达	网络分析和性状关联
33	Cytoscape绘制	共表达网络和调控通路网络图
34	图形修改和编辑	Adobe illustrator修图和组图
35	考试、圆桌论坛	自评学习效果、知识点回顾
41	答疑-线上	答疑、考试内容串讲

教程内容简介如下：

转录组的应用、设计和案例分享

1. 转录组学研究技术介绍

2. 转录组学实验设计和测序原则、注意事项

3. 二代、三代测序过程和原理解析

4. 转录组学文章案例分析

5. 在线基因表达资源数据库

转录组分析流程实战

1. 不基于比对的差异基因分析

2. 基于比对的差异基因分析

3. 转录本组装和选择性剪接分析

转录组高级分析

1. WGCNA基因、表型关联分析

2. Cytoscape 共表达网络绘制

3. 转录组常见图形在线绘制

4. KEGG/Reactome通路图绘制，表达映射

5. 基因互作的文献挖掘和数据库挖掘展示

常见图表解读和图形编辑排版

在培训上，结合发表高水平文章，进一步讲解16种常用分析图的原理和使用范围，让你不仅读懂图，更知道如何应用于自己的研究，并亲自轻松完成绘图。

针对大家使用R语言绘图学习时间成本较高的问题，易生信团队针对常用16种图开发了免费绘图网站，一键出图，更可鼠标点选参数修改图形的个性样式。

成果发表是科研过程中不可缺的一部分，发表成果又少不了图形展示。文章图表排版是否整齐规范、协调一致、重点突出对一篇文章的发表也是有不少贡献的。之前推出的文章发表图的修改和排版讲演了部分图形编辑和排版操作，本次培训也会实践从原始图形、到细节修饰再到排版发表的整个过程和注意事项。

基因组浏览器用于多组学数据的可视化和关联分析，本地有IGV，在线有UCSC genome Browser和Epigenomebrowser，各有特色。

生信基础知识

1. Linux/Windows下Rstudio和Linux命令的使用

2. Linux/Windows下转录组分析流程的搭建

生物学家必要掌握的Shell和R语言基础知识。

(如果基础薄弱，报名付款成功后，可免费领取基础程序课，做好准备工作, 让程序成为我们的得力工具而不是学习新知识的绊脚石。)

定制内容

如果您看到文章中有哪些图或分析工作需要重现，也请提出，一起讲述。

如果您有其它关注的问题，也请报名时提出，把这次课程变成您的定制讲解。

授课模式

本课程以讲解流程和实际操作为主，采用独创四段式教学，封装好的代码全部分享，随处可用：

• 第一阶段 3天集中授课；

• 第二阶段 自行练习2周；

• 第三阶段 在线直播答疑；

• 第四阶段 培训视频继续学习；

• 实现教-练-答-用四个环节的统一协调。

培训时间

2019-10-11 到 2019-10-13 (线下讲解实战)
每天早9点到晚6点，半封闭式教学 (最后1小时为集中讨论时间，最后一天会稍微提前一些，多留出时间讨论，也方便老师乘车返回)
报到时间：开课当天

授课地点 （暂定，鼓楼附近）

北京市西城区鼓楼附近（鼓楼地铁站周边1公里）。

课程价格

1.  截止2019-10-04 4500 元/人 （报名官网查看更多优惠）

2. 名额有限，每次课程报名满40人后自动关闭报名通道

3. 提供易汉博基因科技实习机会或工作机会

课程福利

1. 座位按报名并缴费或预付款成功顺序从前到后龙摆尾式排序

2. 赠送程序基础课一份 (http://bioinfo.ke.qq.com)

3. 多人 (N，10>N>1) 组团报名并同时缴费，每人还可减免N-1百元 (最高500)

4. 赠送金士顿U盘一个（32G含培训数据和脚本）

5. 附推荐语分享该招生信息到朋友圈，截图发到[e-mail] 可获200元腾讯优惠券

复制以下链接
http://www.ehbio.com/Training/ 或
点击阅读原文跳转报名页

易生信系列培训课程，扫码获取免费资料

更多阅读

心得体会 TCGA数据库 Linux Python 

高通量分析 免费在线画图 测序历史 超级增强子

生信学习视频 PPT EXCEL 文章写作 ggplot2

后台回复“生信宝典福利第一波”获取教程合集