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生信小白7行代码画一个高颜值的世界地图

小麦研究联盟 宏基因组 2022-07-05

不要害怕编程,它其实像泡方便面一样简单。先在百度搜索R,然后像安装QQ一样,一直选择下一步,安装成功后,双击打开桌面R的快捷方式。

复制粘贴下面代码,敲一个回车键,就能得到下面的世界地图。如果这个图上面,恰巧能表示你选取的200份小麦全球的分布情况,岂不是心里很美。

install.packages("maps"## 安装R包
install.packages("ggplot2")
library("ggplot2"### 加载ggplot2
library("maps"### 加载地图包
world_map <- map_data("world"### 导入地图数据 
head(world_map) ### 看看地图数据是啥样子
world_map$size <- 1:dim(world_map)[1### 生产一些随机的数据

### 画图开始 ####
ggplot(world_map, aes(x = long, y = lat, group = group, fill = size)) +
  geom_polygon(colour = "white",size=0.2) + scale_fill_distiller(palette = "YlGnBu",direction = 1)


效果图


地图数据与画图参数讲解

world_map初始样子就是下面这个样子,有6列数据,分别是经度,维度,组别,顺序,国家,地区


现在我们需要按照一些特性,给不同国家画上不同颜色,使地图更有意义。比如每个国家博士数量,GDP,国足进世界杯次数,SCI文章数量,搜集的小麦材料各个国家占比等等。

这里我们使用一个随机的数据。world_map$size <- 1:dim(world_map)[1]数值是从1到n的数据,没啥具体的含义,就为了一个例子。


我们画自己的图就只要修改这个数据,怎么修改呢?可以使用write.csv把地图数据写出来(这是个exel格式)然后用read.csv再读进去就可以了。

网上很多类似教程,其他参数不再细讲,聪明如你,一定可以。

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