http://doi.org/10.1186/s40168-019-0775-6植物邻近检测识别和化感应答的响应策略是物种间相互作用的重要过程。 尽管越来越多地了解植物邻近识别和涉及植物释放挥发物的响应,但人们对于在土壤中的信号化学物质如何在植物-植物相互作用中的分子机制知之甚少。近日,Microbiome 杂志在线发表了来自中科院南京土壤研究所孙波课题组题为“Root ethylene mediates rhizosphere microbial community reconstruction when chemically detecting cyanide produced by neighbouring plants”的研究论文。该文章研究了种间植物(花生与木薯)地下部化学信号识别途径,揭示了花生信号调控根际微生物的竞争性防御生存策略。我国人均耕地资源不足,建立合理的作物间作体系可以提高耕地利用效率,增加单位面积产量,但需要发挥不同作物在光能和养分利用上的互补优势,减少作物间竞争的不利影响。不同作物根系构型不同,吸收养分的类型及吸收的时间和空间均有差异,如何调控并强化间作系统中作物间相互促进作用是提高养分利用率的关键。根际是作物吸收养分的门户,根系-土壤-微生物相互作用影响了养分转化、吸收和作物生长,根系分泌物影响根际环境条件(pH、O2分压、碳源等)从而影响根际微生物组成及其对养分的转化,根系释放的信号启动作物间化学通讯识别过程从而影响作物生长-防御权衡策略。已有研究从植物生理学角度揭示了乙烯等胁迫诱导型激素在信号识别和应答邻近植物种间竞争方面的作用机制,但是关于这类信号在根系-土壤-微生物界面上的互作机制仍不清晰,制约了建立有效措施调控种间植物竞争、提升间作系统作物养分利用率。该研究利用了我国南方地区常用的花生-木薯间作系统,针对调控花生和木薯竞争促进养分利用问题,运用红壤旱地花生连作、花生-木薯间作田间试验,并结合盆栽、水培实验和外源乙烯添加实验,及利用高通量测序、激素组分析等方法,试图揭示了种间植物竞争下植物根系与微生物间基于信号的“化学对话”机制。
Diagram of intercropping and monocropping sampling sites in the field and pot experiments.a. 田间花生和木薯间作系统(i)和花生单作系统(ii)。间作组合包括一个2.0米的花生条(五排花生,行距为0.4米)和一个0.4米的木薯条(一排木薯)。同一列内的植物间距离为0.2米。在单作系统中,行间距离为0.4米,同一柱内的行间距离为0.2米。 CRi,BSi和PRi代表间作系统中的木薯根际土壤,块状土壤和花生根际土壤。 PRm和BSm代表单作系统中花生根际土壤和相应的散装土壤。 b. 间作和单作盆栽实验的示意图。成对的植物在用丝网筛过滤器(红色虚线)分隔成小室的盆中一起生长。处理(Treatment)I,木薯单作;处理II,花生和木薯间作,处理III,花生单作;处理IV,在花生中加入氰化物稀释液进行培养。与对照(Control, C)相比,花生加水培养。从相应的有色地点收集的根际和散装土壤用地点名称加小写字母“ s”表示;从地点收集的花生植物用地点名称加上小写字母“ p”表示研究发现邻近植物木薯产生的氰化物可诱导间作花生根系乙烯释放。该信号分子一方面调控花生生理应答;另一方面可经根部释放重塑根际微生物群落,影响作物养分吸收。研究结果表明:花生与木薯间作,木薯根部的氰化物促进花生根部乙烯前体积累,上调乙烯相关基因表达,激发乙烯释放。这种气体分子以减少花生植株地上生物量为代价,调控花生根际微生物网络中的核心物种(放线菌门 Catenulispora sp.)丰度,重塑微生物网络结构。新构建的微生物组加速根际有机氮磷矿化,为花生地下部提供可利用氮磷养分,从而提高花生子代有效繁殖能力,进一步提高花生在间作模式下的生态适应性。
图8. 花生介导木薯-花生间作系统中根际微生物群增加可用养分的机理概述。暴露于地下的氰化物诱导花生根中产生乙烯,并且乙烯介导放线菌物种重塑根际微生物群,从而通过增加可利用的营养成分促进花生种子的产生
综上所述,该研究表明木薯能从根部向土壤中释放出一系列液态和气态的氰化物,而附近的花生接收到这种信号后,能够释放相应的气态分子乙烯,在乙烯影响下,花生植株会主动缩减地面植株的繁茂程度,优先保证果实的养分供给。同时,乙烯还能作为“召集信号”,聚集土壤中的有益微生物到花生根部,提高氮、磷等有效养分的吸收率,以进一步提高花生果实的饱满程度和产量。
Reference
Chen, Y., Bonkowski, M., Shen, Y. et al. Root ethylene mediates rhizosphere microbial community reconstruction when chemically detecting cyanide produced by neighbouring plants. Microbiome 8, 4 (2020). https://doi.org/10.1186/s40168-019-0775-6
猜你喜欢
10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑
系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组 宏基因组
专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人
一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树
必备技能:提问 搜索 Endnote
文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical
扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图
16S功能预测 PICRUSt FAPROTAX Bugbase Tax4Fun
在线工具:16S预测培养基 生信绘图
科研经验:云笔记 云协作 公众号
编程模板: Shell R Perl
生物科普: 肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进 细胞暗战 人体奥秘
写在后面
为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份,另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。
学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”
点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读