WR：城环所杨军组揭示亚热带水库浮游有壳虫群落构建受随机性过程影响比确定性过程更强

有壳虫（又称有壳变形虫、或有壳肉足虫）是一类单细胞原生生物，其细胞被壳体所包裹，可以通过壳口伸出伪足进行摄食和运动。它们个体微小、分布广泛、多样性高，从热带到极地地区在淡水、半咸水和土壤中均有发现，在水生和陆地生态系统的生物地球化学循环和能量流动中发挥重要作用。在全球范围内，已经被描述的有壳虫形态种约有2000个。有壳虫能够在内陆水体沉积物和湿地环境中长期保存，同时对环境生态变化反应敏感，能够指示气候、水文以及水质等变化。因此，近20年来有壳虫已发展成为备受关注的新型指示生物。然而，以往的长时间系列有壳虫生态研究主要集中在沉积物环境，目前仍然缺乏长时间尺度上水体浮游有壳虫群落变化过程和机制的研究。

探究真核微生物群落构建的基本生态过程已成为微生物生态学的一个核心主题，但目前尚未形成共识，仍然存在争论。例如，基于生态位过程的经典理论中，确定性因素（包括当地环境条件、物种间相互作用）控制着局域群落的组成和动态。但是，随机性过程包括出生、死亡、迁移和扩散事件等对于调控局域物种组成也发挥重要作用。目前普遍接受的观点是，生物群落构建同时受到确定性过程和随机性过程的共同影响。此外，确定性和随机性过程的相对重要性会受到物种扩散能力和生态环境梯度的影响。目前，中性理论在水生态系统中的普适性缺乏相应的充分验证，我们对随机性过程影响浮游生物群落构建的认知还十分有限，尤其在有壳虫群落中。

图1 两座亚热带水库的采样站位

中国科学院城市环境研究所水生态健康研究组（杨军团队）采用环境DNA宏条形码技术、高通量测序技术和多元统计方法，研究了七年时间内两座亚热带水库表层水体浮游有壳虫群落动态过程及构建机制。结果显示，有壳虫在所有真核浮游生物群落中基本上属于稀有种，它们的相对丰度低于总丰度的0.01％。在两座水库中，有壳虫群落动态变化表现出的年际变化幅度强于季节变化，其中物种丰富度的差异是造成群落差异的主要原因。环境变量对有壳虫群落组成变化的解释量不到20％，暗示随机性过程可能是有壳虫群落构建的主要驱动力。通过群落中性模型分析，发现随机性过程能够解释超过65％的有壳虫群落变化。更重要的是，零模型分析结果表明：尽管确定性过程在某些年份表现出更强的影响，但总体而言，在七年时间尺度上随机性过程（以生态漂变为主）比确定性过程对有壳虫群落变化具有更大的贡献。

本研究首次强调了随机性过程对内陆水体有壳虫群落构建的重要性。为理解淡水生态系统中浮游有壳虫群落长期变化的生态格局、过程以及机制提供了新视角和新思路。此外，有壳虫作为浮游生物群落稀有种、生态功能种、环境指示种，对监测浮游生物的多样性和保护饮用水资源具有重要意义。在未来研究浮游生物群落构建和基于有壳虫群落重建环境变化时，应充分考虑随机性过程的影响。

图2 论文摘要图

研究成果以Seven-year dynamics of testate amoeba communities driven more by stochastic than deterministic processes in two subtropical reservoirs 为题发表在环境科学与生态学领域国际期刊Water Research, 2020, 185: 116232。博士生王文平为第一作者，杨军研究员为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划、福建省自然科学基金等项目的资助。

猜你喜欢

系列教程：微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能：学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂：宏基因组 寄生虫益处 进化树

必备技能：提问 搜索  Endnote

文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析：图表解读 分析流程 统计绘图

在线工具：16S预测培养基 生信绘图

科研经验：云笔记  云协作 公众号

编程模板: Shell  R Perl

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘  

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难，我们建立了“宏基因组”专业讨论群，目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论，获得专业解答，欢迎分享此文至朋友圈，并扫码加主编好友带你入群，务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份，另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助，首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路，仍未解决群内讨论，问题不私聊，帮助同行。

学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战，关注“宏基因组”

点击阅读原文