12月8日中科院刘永鑫报告:宏基因组数据分析的机遇与挑战
报告题目:宏基因组数据分析的机遇与挑战
报 告 人:刘永鑫 工程师
报告时间:2 0 2 0 年 1 2 月 0 8 日 1 9:0 0 - 2 1 : 0 0
直 播 平 台 :腾 讯 会 议 ( 会议ID:290938070,密码:202020)
直 播 链 接 :https://meeting.tencent.com/l/OuZ3F5CHTHfn
报告人简介:刘永鑫,宏基因组公众号创始人,中科院青促会会员。目前发表论文30余篇,被引 2200余次,主持国自然和中科院项目,在编专著《微生物组数据分析》、《微生物组实 验手册》两部,申请专利2项,获得软件著作权1项。东北农业大学微生物学学士,中国 科学院大学生物信息学博士,研究方向为微生物组数据挖掘、分析方法开发和科学传 播。负责的微生物组数据分析项目在Science、Nature Biotechnology、Cell Host & Microbe 等杂志发表论文30余篇。参与微生物组分析平台QIIME 2开发。受邀以第一作者 和/或通讯作者在Protein & Cell、Current Opinion in Microbiology、遗传 等杂志发表微生物组研究方法综述。兼职为Journal of Genetics and Genomics、Bioinformatics、BMC Genomics等10余个杂志审稿人。2017年7月创办“宏基因组”公众号,目前分享本领域相 关原创文章2400余篇,关注人数10万+,累计阅读1800万+。
报告内容:近年来高通量测序技术的发展,开发一系列适合微生物组研究的技术,快速推 动了微生物组领域的发展并积累了海量数据。而微生物组数据分析过程复杂、软件 和方法的种类多样让初涉本领域的同行非常茫然。本次演讲系统概述了微生物组常 用宏基因组测序技术方法的优缺点,方便同行根据科学问题快速选择合适的研究手 段。同时在众种的分析软件中,挑选主流软件整合的分析流程推荐给同行,方便快 速实现较优的宏基因组分析流程,并对常用软件和数据库进入介绍,方便同行选择 和优化结果。同时对近几年宏基因组分析方法的最新进展进行总结,帮助大家掌握 最前沿的方法,同时把握好未来的发展趋势,在宏基因组的黄金时代贡献自己的一 份力量。本次报告通过对当前宏基因组数据分析的主流方法进行整理和总结,为同 领域研究者更方便、灵活的开展数据分析,快速选择研究分析工具,高效挖掘数据 背后的生物学意义提供参考,进一步推动微生物组研究领域的发展。
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