国家微生物科学数据中心推出免费一站式生物信息分析云平台
产生了大量的微生物组学数据,想进行数据分析不知道使用什么工具?不会使用Linux系统?不会写代码?没有合适的参考数据库?计算资源不足?现在这些问题都可以通过国家微生物数据中心推出的一站式生物信息分析云平台解决。
国家微生物科学数据中心面向微生物领域的科学家,提供免费的一站式生物信息分析云平台。该平台可提供包括生物信息在线分析工具、计算资源、公共参考数据的整合在线服务。图形化操作界面,用户无需任何编程基础,无需配置Linux操作系统,无需安装复杂的生物信息分析软件,无需下载庞大的生物数据库,一键就能搞定生物数据分析,并且每项分析都可以自定义分析参数,实现在鼠标点击之间即可在国家微生物科学数据中心在线进行生物信息数据分析,挖掘出准确、详细、专业的分析结果。
目前国家微生物科学数据中心已经上线了84个分析工具和自定义的数据分析工作流,涵盖了宏基因组分析流程、基因组拼接、基因组结构分析、基因组注释分析、元基因组分析、比较基因组分析、便携分析等7大功能,分析类型多样、涵盖面广,符合广大科研人员分析需求,旨在让更多领域内科研人员能更快、更高效、更自主的完成交互分析。
标准分析工作流
•单菌拼接注释流程
•宏基因组拼接注释流程
•新冠病毒识别流程
•RNAseq流程
•16s流程
•后台开放,支持自定义搭建个性化流程
目前已整合到微生物高通量测序数据分析工具
那么究竟如何快速使用这些分析工具进行线上数据分析呢,小编手把手教您具体操作步骤:
1. 首先进入国家微生物科学数据中心首页http://nmdc.cn/,选择分析工具的入口按钮,进入分析工具界面。
2.在分析工具主界面,选择工具进行使用,这里以SOAPdenovo2为例
3.点击需求工具的开始按钮进行使用。
4.首次使用需要先登录账号才能使用,如果没有账号需要先进行注册。
5.登录之后会再次返回工具主界面,选择需要的工具进行使用。
6.进入工具分析页面,选择不同参数构建分析项目,确认无误后即可开始分析。
7.项目运行后跳转到任务运行的详细界面
8.任务完成之后点击下载按钮,下载需要的结果文件
以上是国家微生物科学数据中心单个分析工具示例使用的完整范例,用户可以图形化操作界面完成复杂的生物数据分析,得到自己所需的科研结果,具体不同功能的分析工具用户可以根据自己的分析需求来去选择。
用户如果想自己创建一个项目进行相关数据分析,也可以进入http://biocloud.nmdc.cn/网址创建个人分析项目和具体的分析任务,以下是系统操作的详细步骤:
NO.1
建立个人项目,用于区分不同类型的任务
NO.2
创建项目之后,找到具体的分析工具创建项目
NO.3
找到具体的分析工具之后创建分析项目
NO.4
提交任务
NO.5
提交之后,查看项目的作业
NO.6
查看项目的作业信息
NO.7
形成可视化分析结果
如在使用分析工具的过程中有任何相关的问题请联系网站下方服务邮箱或电话咨询。服务邮箱:nmdc@im.ac.cn;联系电话:010-64807385。
后续我们将持续推送手把手教程系列的宏基因组数据提交步骤,敬请关注。
来国家微生物科学数据中心http://nmdc.cn/,获取更多精彩内容。
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学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”