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在?B站综合排序第一的单细胞课程不来学?

Editor's Note

手把手从知识背景、代码原理、分析实操教大家学习单细胞测序,B站”Biomamba 生信基地”同名发布的系列视频教程常居同类视频头名,适合零基础的小白学习。

The following article is from Biomamba 生信基地 Author BIOMAMBA




离"Biomamba 生信基地"最初发布"手把手教你做单细胞测序"系列教程差不多已经过去了一年,之前一直是综合排序第一,全靠诸位支持,“单细胞测序”这一词条下,我的视频总播放量目前也排在榜一,目前访问量已经3.1万了,看来B站确实是一个很好的学习与交流的平台。目前基础分析的部分已发布完毕,进阶分析部分细胞通讯已部分更新,也排在对应词条的第一位,拟时序分析的教程也会在近期推出。这篇推送把目前本公众号所有的单细胞测序相关推送、教程全部整理在下面,大家记得按顺序学习系统性的看三遍,一定会学有所成,加油!






往期回顾


如果你还没学完基础课程,一定要跟着下面蓝色超链接的顺序走,每篇文章中的超链接要点开看(按顺序掌握自然没有疑问):


B站视频,先看一遍视频再去看推送操作,建议至少看三遍:https://www.bilibili.com/video/BV1S44y1b76Z/
单细胞测序基础数据分析保姆级教程,代码部分整理在往期推送之中:手把手教你做单细胞测序数据分析(一)——绪论
手把手教你做单细胞测序数据分析(二)——各类输入文件读取
手把手教你做单细胞测序数据分析(三)——单样本分析
手把手教你做单细胞测序数据分析(四)——多样本整合手把手教你做单细胞测序数据分析(五)——细胞类型注释手把手教你做单细胞测序数据分析(六)——组间差异分析及可视化手把手教你做单细胞测序数据分析(七)——基因集富集分析

上游fastq文件处理:
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:cellranger
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:dropseqRunner


细胞通讯B站连续播放起来比较方便:
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1

往期推送单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat基础分析教程
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析
给你们申请到了免费的128GB云服务器



其他单细胞相关技术贴也在这里:细胞的数量由誰决定?单细胞中应该如何做GSVA?答读者问(三):单细胞测序前景答读者问(四):如何分析细胞亚群答读者问(六):Seurat中如何让细胞听你指挥答读者问(八):为什么Read10X也会报错?
答读者问(十)整合后的表达矩阵,如何拆分出分组信息?
答读者问(十一)如何一次性读取一个目录下的cellranger输出文件?
给你安排一个懂生信的工具人(十):不学编程 零代码完成单细胞测序数据分析:Loupe Browser
什么?不做单细胞也能分析细胞类群和免疫浸润?
答读者问 (十三)查看Seurat对象时的ERROR:type='text'
各类单细胞对象(数据格式)转换大全(一)批量整理好GEO中下载的单细胞数据
答读者问 (十四)Seurat中分类变量处理技巧


单细胞文献阅读:文献阅读系列(三)、单细胞测序解析糖尿病肾病中肾小球的动态变化
文献阅读系列(四)、单细胞测序技术解析健康人与T2D患者的胰岛差异文献阅读系列(六)、小鼠全肾单细胞测序开篇之作文献阅读系列(七)、一篇不花钱就能白嫖的文章文献阅读系列(八)、不会吧不会吧,Nature都能白嫖?文献阅读系列(十一)、高氧下小鼠肺发育损伤的ScRNA图谱文献阅读系列(十二)、IgAN & STRT-Seq
文献阅读系列(十三)、老树开新花——EGFR、肿瘤、免疫+scRNA-Seq


非技术帖:关于单细胞的事 谈谈后面的计划
Biomamba助推的第一篇论文发表啦给你们申请到了免费的128GB云服务器
这批服务器的优惠可能要下架了,手快有手慢无了
趁机预告一波





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