Mol Neurobiol︱刘振华课题组揭示DNAJ家族基因在帕金森病中的作用
撰文︱张凯琳
责编︱王思珍
编辑︱杨彬伟
帕金森病(Parkinson’s Disease,PD)是常见的神经退行性疾病之一,目前认为遗传因素、环境因素与年龄老化在PD发生发展过程中起了重要作用[1]。DNAJ蛋白,又称为热休克蛋白40(Hsp40),是Hsp70蛋白的分子伴侣,可以辅助Hsp70行使多种功能,包括蛋白质合成、折叠、组装、运输、降解、聚集的各个过程[2-5],在代谢紊乱、自身免疫性疾病和神经退行性疾病等多种疾病中发挥着重要作用[6-8]。DNAJ蛋白家族成员众多,且结构多样,研究表明DNAJ家族基因与PD等神经退行性疾病有关,然而目前尚无研究在PD患者中对DNAJ家族所有基因进行全面的遗传分析。
2022年6月17日,中南大学湘雅医院刘振华课题组在Molecular Neurobiology在线发表了题为“Genetic analysis of HSP40/DNAJ family genes in Parkinson’s disease: A large case-control study”的研究论文,探究了DNAJ家族全部基因在PD中的作用。博士研究生张凯琳、潘宏旭为论文共同第一作者,中南大学湘雅医院唐北沙教授、郭纪锋教授、李津臣教授为论文重要参与作者。在此项研究中,作者发现DNAJC26基因与PD显著相关,DNAJB2等9个基因与PD提示性相关。
为了全面系统地探究DNAJ家族基因与PD的关系,作者运用新一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)对3879例PD患者和2931例健康对照进行了49个DNAJ家族基因的遗传学分析。其中,作者对1917例散发早发PD(sEOPD)或家族性PD(FPD)患者以及1652例健康对照进行了全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES),并对1962例散发晚发PD(sLOPD)患者和1279例健康对照进行了全基因组测序(whole-genome sequencing,WGS)。
作者通过对上述测序结果进行生物信息学分析,获得了49个DNAJ家族基因共1617个罕见非同义突变,并进一步分层为罕见错义变异(Missense)、罕见有害错义变异(Dmis)、功能缺失变异(LoF)等,随后利用SKAT-O对每个基因的不同变异集进行了负荷分析并发现:在sEOPD和FPD队列中,DNAJC26基因与PD显著相关,DNAJB2和DNAJC18基因与PD提示性相关;在sLOPD队列中,DNAJC2、DNAJC10、DNAJC22、DNAJC24、DNAJC27、DNAJC28、DNAJC29基因与PD提示性相关(表1)。
表1 显著性或提示性相关的DNAJ家族基因在PD中的作用分析
(图引自:Zhang, KL, et al., Mol Neurobiol, 2022)
作者还进一步对DNAJC26、DNAJB2以及DNAJC18基因中检测到的罕见有害变异与各蛋白结构域的关系绘制了模式图(图1),由该图可以看出,各基因中的罕见有害变异更倾向于聚集在蛋白结构域区域,提示这些蛋白结构域的功能损害可能影响PD发病。
此外,作者还分析了DNAJC26基因变异与发病年龄的关系,结果发现携带有该基因罕见有害变异的PD患者发病年龄显著低于未携带者。
这些研究结果显示:DNAJ家族蛋白与PD相关,且不同的DNAJ蛋白分别影响sEOPD、FPD、sLOPD发病,提示了分子伴侣在PD发病中的重要作用。
图1 DNAJC26、DNAJB2和DNAJC18基因罕见有害变异
(图引自:Zhang, KL, et al., Mol Neurobiol, 2022)
总之,该研究强调了分子伴侣在PD发病机制中的作用,但这些基因在PD中的作用需要进一步在更大的PD队列或功能实验中进行验证。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35715682/
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参考文献(上下滑动阅读)
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