单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》1.概论

在前面的基础课程里我们已经花了超过两个小时的时间教会大家怎样使用R语言以及完成单细胞测序数据分析中的所有基础操作，并且进阶分析教程中我们的细胞通讯相关内容也已经出了几期。那么这个系列我们就来详细地带大家学习一下拟时序分析。其实细胞通讯与拟时序分析都已经很常规啦，逐渐的也就算不上什么进阶分析了，拟时序分析无非就是花哨版的亚群分析，第一集的内容拟时序分析绪论已经做出来了，不多说上视频：

B站同步播出，连播起来比较方便：https://www.bilibili.com/video/BV1br4y1x7Hf/
PPT、参考文献自取：

链接：

https://pan.baidu.com/s/1QDmiBZxwayoFm4IpzHRQ8Q?pwd=0uy9

提取码：0uy9

往期回顾

如果你还没学完基础课程，一定要跟着下面蓝色超链接的顺序走，每篇文章中的超链接要点开看（按顺序掌握自然没有疑问）：

B站视频，先看一遍视频再去看推送操作，建议至少看三遍：https://www.bilibili.com/video/BV1S44y1b76Z/
单细胞测序基础数据分析保姆级教程，代码部分整理在往期推送之中：手把手教你做单细胞测序数据分析（一）——绪论
手把手教你做单细胞测序数据分析（二）——各类输入文件读取
手把手教你做单细胞测序数据分析（三）——单样本分析
手把手教你做单细胞测序数据分析（四）——多样本整合手把手教你做单细胞测序数据分析（五）——细胞类型注释手把手教你做单细胞测序数据分析（六）——组间差异分析及可视化手把手教你做单细胞测序数据分析（七）——基因集富集分析

上游fastq文件处理：
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件：cellranger
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件：dropseqRunner

细胞通讯B站连续播放起来比较方便：
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1
往期推送单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat基础分析教程
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析
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其他单细胞相关技术贴也在这里：细胞的数量由誰决定？单细胞中应该如何做GSVA？答读者问（三）：单细胞测序前景答读者问（四）：如何分析细胞亚群答读者问（六）：Seurat中如何让细胞听你指挥答读者问（八）：为什么Read10X也会报错?
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给你安排一个懂生信的工具人（十）：不学编程 零代码完成单细胞测序数据分析：Loupe Browser
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答读者问 （十五）稀疏矩阵转matrix, as.matrix函数是下下策

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文献阅读系列（十三）、老树开新花——EGFR、肿瘤、免疫+scRNA-Seq

非技术帖：关于单细胞的事 谈谈后面的计划
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