查看原文
其他

计算AUC曲线下面积

2016-08-11 张浩然 弗雷赛斯
Freescience按:小伙伴们还记得之前讲过MedCalc这个软件来进行ROC曲线绘制吗,ROC又称受试者工作特征曲线, 是用来检验某一诊断方法的敏感性和特异性的方法。AUC(曲线下面积)的值就是处于ROC curve下方的那部分面积的大小。

ROC曲线下的面积值在1.0和0.5之间。在AUC>0.5的情况下,AUC越接近于1,说明诊断效果越好。AUC在 0.5~0.7时有较低准确性,AUC在0.7~0.9时有一定准确性,AUC在0.9以上时有较高准确性。AUC=0.5时,说明诊断方法完全不起作用,无诊断价值。AUC<0.5不符合真实情况,在实际中极少出现。

(回顾点这里
今天我们讲讲如何利用Graph来计算药时AUC,药时曲线下面积(AUC)血药浓度曲线对时间轴所包围的面积。该参数是评价药物吸收程度的重要指标,反映药物的,AUC大表示吸收的多,高!(在公众号对话框回复Graph获得小神器哦)


【问题1】药时曲线的AUC计算
药物浓度-时间曲线(药时曲线)
Concentration-Time Curve (C-T curve)
曲线下面积(Area Under Curve, AUC)



【相关关键词】
•药物浓度-时间曲线(药时曲线)
•Concentration-Time Curve (C-T curve)
•曲线下面积(Area Under Curve, AUC)

•梯形法(trapezoid rule)
•积分(Integrate)

一、药时曲线的AUC计算
【原始数据结构】药时曲线的AUC
给大鼠口服某药物后,按照一系列时间点取血,用高效液相色谱分析血中药物的含量,如表所示:




【目标图片&结果】药时曲线的AUC
请绘制“药时曲线”如右图所示,并计算出阴影部分的面积。
推荐软件:GraphPad
备选软件:Excel,Origin




梯形法计算曲线下面积
梯形面积=(上底+下底)×高÷2
Area=(y2+y1)×(x2-x1)÷2




实例演示

1.使用GraphPad计算药时曲线的AUC。(推荐)
2.使用Excel计算药时曲线的AUC。
3.使用Origin计算药时曲线的AUC。

二、曲线下面积AUC——拓展
计算药时曲线AUC的其他方法
建立药物动力学模型,对实验数据进行曲线拟合,并求出相关的参数。利用函数的微积分方法求出曲线下面积。有软件可以自动计算~~~
该方法(药动模型法)的关键是:所建立的模型要合适,与实验数据有比较好的拟合度。
而用梯形法计算AUC不需要建立模型。应用广泛,但比较粗略。

AUC的其他用途

1.高效液相色谱的峰面积→计算浓度
2X射线衍射用峰面积→计算结晶度
推荐使用仪器自带的软件来完成计算,有更多专业的参数可以设定。其原理大多都是梯形法




视频手把手示范操作:

https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=t0300hf46cg&width=500&height=375&auto=0





浩然专栏主编

张浩然,男,北京大学药学博士,创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》,内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。等不及想看四部曲?给我们发送H002,打包给你哦。

Freescience精彩内容回顾(点击即达)

论文信号通路图,模式图,全搞定   | 谷歌不能上?有这个,一劳永逸|临床统计傻瓜式解决 | 外文写作润色神器 | 不花钱下载SCI全文黄金攻略!|PubMed有哪些被你忽视的细节?|SCI文献管理之黄金攻略!|卸载Visio—超赞的在线流程图制作工具|论文查重!关键是不要钱!|神器!分分钟找到高质量的目标文献!|生存分析从理解到作图妥妥的|科研作图神器GraphPad | 菜鸟写国自然-4:立项依据的写作 | 零基础不一样的实验protocol:开篇引言|引物设计?现成的随便拿啦!| 实验技能:小鼠尾静脉注射 | Western百败百战老学姐的心酸笔记|零基础Meta系列(十):一般套路(纯干货)一盏茶一篇meta(四)—SNP Meta,数据库寻找靶基因|网状meta分析(NMA)-第一卷基本技能| 段子手韩春雨老师|不得不扒的女神--胡海岚 | 扒一扒你所不知道的浙大PMCB团队(内嵌新春大红包!)实例讲解:基因数据库的利用(二)| 生物医学大数据解读和分析——构建生物网络实践(一)更多精彩内容请至公众号菜单栏

FS科研软件库,集合60+医学科研必备神器,现在统统打包分享点这里

FS科研线上沙龙第三期,每周四晚21点,每次一个专题,等你来哦,点这里



还有Freescience科研交流群

长按二维码加小秘书为好友



科学自由共享投稿请扔至freescience@zju.edu.cn未经许可 不得转载长按二维码关注

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存